[發明專利]使用圖像分析識別候選細胞

在審

• 申請號: 202110066183.7
• 申請日: 2018-03-26
• 公開（公告）號: CN112730002A
• 公開（公告）日: 2021-04-30
• 發明（設計）人: 謝煌彬;賴志銘;梅蕊;邵宏仁;王小明;吳仁家
• 申請（專利權）人: 合度精密生物科技有限公司
• 主分類號: G01N1/31
• 分類號: G01N1/31;G01N15/14;G01N33/50;G01N33/574;G01N33/58;G06T7/00
• 代理公司: 上海浦一知識產權代理有限公司 31211
• 代理人: 鄭權

1.一種用于識別生物流體樣本中候選靶細胞的方法，其特征在于，包括：

獲得生物流體樣本；

通過用于結合細胞特征的生物綴合染料，給所述生物流體樣本中的細胞特征染色，以制備所述生物流體樣本；

捕獲所述生物流體樣本的數字圖像；

將圖像分析應用于所述數字圖像，包括：接收所述生物流體樣本的數字圖像，識別所述數字圖像中的多個像素區域，其中，識別所述多個像素區域包括：識別具有最小強度并且尺寸介于最小尺寸和最大尺寸之間的像素連接區域，確定所述像素連接區域的縱橫比，識別所述縱橫比滿足縱橫比閾值的區域，并將與至少一些所述所識別區域相對應的一部分所述圖像提供到分類器，作為供分類的候選區域。

2.根據權利要求1所述的方法，其特征在于，所述生物綴合染料包括4′，6-二氨基-2-苯基吲哚，或與抗細胞角蛋白抗體綴合或與抗CD-45抗體綴合的熒光染料。

3.一種非臨時性計算機可讀介質，用于識別生物流體樣本中的候選靶細胞的計算機程序產品可有形地體現所述非臨時性計算機可讀介質中，其特征在于，包括使處理器接收所述生物流體樣本的數字圖像的指令；

識別所述數字圖像中的多個像素區域，其中，識別所述多個像素區域的所述指令包括：識別具有最小強度并且尺寸介于最小尺寸和最大尺寸之間的像素連接區域的指令；

確定所述像素連接區域的縱橫比；

識別所述縱橫比滿足縱橫比閾值的區域；以及

將與至少一些所述所識別區域相對應的一部分所述圖像提供到分類器，作為供分類的候選區域。

4.根據權利要求3所述的非臨時性計算機可讀介質，其特征在于，用于識別所述連接區域的所述指令包括：將灰度圖像轉換為二進制圖像，檢查所述二進制圖像的連續像素以確定各個像素是否滿足所述最小強度，并確定所述各個像素是否與已經分配給連接區域的另一個像素相鄰的指令。

5.根據權利要求3所述的非臨時性計算機可讀介質，其特征在于，識別所述連接區域的所述指令包括最大穩定極值區域算法。

6.根據權利要求3所述的非臨時性計算機可讀介質，其特征在于，識別所述連接區域的所述指令包括：將所述數字圖像劃分為多個部分，搜索每個部分以獲取潛在連接區域，并識別以從所述搜索中找到的潛在連接區域為中心的新的一部分所述數字圖像的指令。

7.根據權利要求3所述的非臨時性計算機可讀介質，其特征在于，進一步包括：在識別出所述多個像素區域之前，將過濾器應用于所述圖像以減少所述圖像中的噪聲的指令。

8.根據權利要求3所述的非臨時性計算機可讀介質，其特征在于，確定所述縱橫比的所述指令包括：找到在所述區域的邊界上距離最大的兩點之間延伸的主軸，找到垂直于所述主軸且在所述主軸的對側上的所述區域的所述邊界上距離最大的兩點之間延伸的副軸，并計算所述副軸與所述主軸的比率的指令。

9.根據權利要求8所述的非臨時性計算機可讀介質，其特征在于，所述縱橫比閾值等于或小于0.4。

10.根據權利要求8所述的非臨時性計算機可讀介質，其特征在于，進一步包括：確定所述區域周圍的邊界框，確定所述區域的邊界內的第一數量的像素和一定范圍內的第二數量的像素，確定所述第一數量的像素與所述第二數量的像素比率，并將所述像素比率與范圍閾值進行比較的指令。

11.根據權利要求10所述的非臨時性計算機可讀介質，其特征在于，所述范圍閾值介于0.4和0.85之間。

12.根據權利要求3所述的非臨時性計算機可讀介質，其特征在于，進一步包括：確定所述區域周圍的邊界框，確定所述區域的邊界內的第一數量的像素和一定范圍內的第二數量的像素，確定所述第一數量的像素與所述第二數量的像素的像素比，并將所述像素比與范圍閾值進行比較的指令。