[發明專利]肺癌預后模型的構建方法及應用方法、電子設備在審
| 申請號： | 202110061920.4 | 申請日： | 2021-01-18 |
| 公開（公告）號： | CN112735592A | 公開（公告）日： | 2021-04-30 |
| 發明（設計）人： | 張蕾;張琦;馮林;程書鈞;張開泰;肖汀 | 申請（專利權）人： | 中國醫學科學院腫瘤醫院 |
| 主分類號： | G16H50/50 | 分類號： | G16H50/50;G16H50/30;G16B20/00 |
| 代理公司： | 北京市柳沈律師事務所 11105 | 代理人： | 彭久云 |
| 地址： | 100021 *** | 國省代碼： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 肺癌 預后 模型 構建 方法 應用 電子設備 | ||
1.一種肺癌預后模型的構建方法，包括：
獲取多個肺癌患者和多個參考人的外周血白細胞轉錄譜表達數據；
基于所述多個肺癌患者和所述多個參考人的外周血白細胞轉錄譜表達數據，篩選候選基因；以及
基于所述候選基因，構建風險評分模型；
其中，所述肺癌預后模型包括所述風險評分模型，
基于所述多個肺癌患者和所述多個參考人的外周血白細胞轉錄譜表達數據，篩選所述候選基因，包括：
對所述多個肺癌患者和所述多個參考人的外周血白細胞轉錄譜表達數據進行相似性分析，確定多個肺癌亞群；
將所述多個肺癌亞群分別與所述多個參考人進行差異表達基因分析，確定所述多個肺癌亞群各自的差異表達基因；
比較所述多個肺癌亞群的差異表達基因的表達狀態，選擇所述多個肺癌亞群中有較多的免疫抑制基因處于高表達狀態的肺癌亞群作為候選肺癌亞群，其中，所述高表達狀態是指免疫抑制基因的表達值大于所述多個參考人的所述免疫抑制基因的表達值；以及
從所述候選肺癌亞群的差異表達基因中篩選所述候選基因。
2.根據權利要求1所述的構建方法，其中，基于所述多個肺癌患者和所述多個參考人的外周血白細胞轉錄譜表達數據，篩選所述候選基因，還包括：
在確定所述多個肺癌亞群之后，通過血液轉錄組模塊富集分析對所述多個肺癌亞群進行驗證。
3.根據權利要求1或2所述的構建方法，其中，所述多個肺癌亞群包括兩個肺癌亞群。
4.根據權利要求1或2所述的構建方法，其中，基于所述候選基因，構建所述風險評分模型，包括：
獲取訓練數據集；
在所述訓練數據集中，基于所述候選基因，通過單因素Cox回歸分析，確定與生存期相關的基因；以及
通過LASSO Cox回歸分析結合十折交叉驗證法，對所述與生存期相關的基因進行篩選，以確定用于構建所述風險評分模型的基因以及所述風險評分模型，其中，所述風險評分模型表示為：
RS＝c1E1+…+cNEN，
其中，RS表示風險評分，Ei表示用于構建所述風險評分模型的第i個基因的表達值，ci表示用于構建所述風險評分模型的第i個基因的系數，N表示用于構建所述風險評分模型的基因的數量。
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