[發明專利]預測藥物靶標相互作用的多注意力方法在審
| 申請號: | 202110045057.3 | 申請日: | 2021-01-13 |
| 公開(公告)號: | CN114765060A | 公開(公告)日: | 2022-07-19 |
| 發明(設計)人: | 彭德中;曾煜妮;王騫 | 申請(專利權)人: | 四川大學 |
| 主分類號: | G16B15/30 | 分類號: | G16B15/30;G06N3/04;G06N3/08 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 610065 四川*** | 國省代碼: | 四川;51 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 預測 藥物 靶標 相互作用 注意力 方法 | ||
1.一種用于本實施例的一種預測藥物靶標相互作用的方法,包括以下步驟:
1)計算DNN網絡輸出:
將樣本代入上式,得到一個值;
2)根據下式損失函數,
3)更新每個DNN網絡的參數通過最小化式(5),
4)計算線性變換矩陣W;
5)輸出模型MATT-DTI。
2.根據權利要求1所述的用于預測藥物靶標相互作用的方法,其特征在于,其中DNN網絡為一個藥物表達學習模塊,一個靶標表達學習模塊、一個多頭自注意力層和全連接層組成,其輸出預測的親和力值。
3.根據權利要求2所述的藥物表達學習模塊,其特征在于,該模塊由輸入層,相關自注意力層、全連接層、3層卷積層、池化層的順序組合,其輸出為藥物深層表達。
4.根據權利要求2所述的靶標表達學習模塊,其特征在于,該模塊由3層卷積層和1層池化層組成,輸出靶標深度表達。
5.根據權利要求1,2,3,4所述,將藥物深層表達和靶標的深層表達作為多頭自注意力層的輸入,再連接3層全連接層輸出預測的親和力值,且結構參數參考說明書表1,表2,和表3。
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