[發(fā)明專利]基于協(xié)同過濾的新型冠狀病毒中藥組方推薦方法及系統(tǒng)有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 202110037705.0 | 申請日: | 2021-01-12 |
| 公開(公告)號: | CN112667922B | 公開(公告)日: | 2022-06-28 |
| 發(fā)明(設計)人: | 楊帆;薛付忠;張琪;李江冰;薛浩 | 申請(專利權)人: | 山東大學 |
| 主分類號: | G06F16/9536 | 分類號: | G06F16/9536;G16H20/10;G16B15/00;G16C20/30;G16C20/50 |
| 代理公司: | 濟南圣達知識產(chǎn)權代理有限公司 37221 | 代理人: | 李琳 |
| 地址: | 250002 山東省*** | 國省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 基于 協(xié)同 過濾 新型 冠狀病毒 中藥 推薦 方法 系統(tǒng) | ||
本發(fā)明公開一種基于協(xié)同過濾的新型冠狀病毒中藥組方推薦方法及系統(tǒng),包括:獲取三藥三方中藥的化合物,將化合物與新冠蛋白質(zhì)進行分子對接,得到化合物與蛋白質(zhì)的結合親和力;基于ADME篩選、結合親和力和化合物自由能對接閾值對化合物進行篩選,得到有效化合物;根據(jù)中藥所包含的有效化合物的分子指紋得到中藥分子指紋,根據(jù)中藥分子指紋和中藥功效性狀特征構建中藥?中藥相似度矩陣;基于中藥?中藥相似度矩陣和協(xié)同過濾算法對候選中藥進行篩選,得到中藥組方推薦方案。將三藥三方中藥化合物和新冠蛋白質(zhì)進行分子對接,衡量中藥及中藥組方與新冠蛋白質(zhì)的結合能力,同時基于協(xié)同過濾算法進行中藥組方的推薦,驗證中藥組方對新冠病毒治療的有效性。
技術領域
本發(fā)明涉及藥物推薦技術領域,特別是涉及一種基于協(xié)同過濾的新型冠狀病毒中藥組方推薦方法及系統(tǒng)。
背景技術
本部分的陳述僅僅是提供了與本發(fā)明相關的背景技術信息,不必然構成在先技術。
目前,在新冠肺炎的治療藥物方面仍然沒有特效藥物能夠?qū)崿F(xiàn)有效的療效。雖然有些研究表明氯喹、瑞德西韋等具有一定療效,如鐘南山等發(fā)表的有關氯喹的文章表明其可以有效減少感染時間;關于瑞德西韋治療新冠感染恒河猴實驗表明,經(jīng)瑞德西韋治療的動物肺部病毒載毒量顯著降低,對肺組織的損害明顯減少。但是實質(zhì)上還是存在爭議的,如柳葉刀文章表明氯喹無效,甚至有副作用,關于瑞德西韋認為服用瑞德西韋的患者癥狀改善及死亡率與對照組差別無統(tǒng)計學差異。
Covid-19在中醫(yī)上屬于瘟疫范疇,數(shù)千年來,中醫(yī)對瘟疫的防治積累了豐富的經(jīng)驗,形成較為系統(tǒng)的理論與方法。中國最早的文字殷墟甲骨文已經(jīng)有了“蟲”“蠱”“瘧疾”這些文字的記載,東漢時期《傷寒論》有關于瘟疫流行的詳細記載:“自建安紀年以來,猶未十稔,其死亡者三分之二,傷寒十居其七”。最早一部傳染病專著為清代吳有性所著《溫疫論》,詳細描述了其病因病機和治療方法,提出“戾氣”一說,并提出“達原飲”等治療方法,在后續(xù)瘟疫的救治過程中起了重要作用。在治療covid-19中,中醫(yī)藥同樣發(fā)揮了不可替代的作用,新型冠狀病毒感染的肺炎診療方案中明確要求有關醫(yī)療機構要在救治工作中積極發(fā)揮中醫(yī)藥的作用,加強中西醫(yī)結合。
目前有關三藥三方(金花清感顆粒、連花清瘟膠囊、血必凈、清肺敗毒湯、化濕敗毒方、宣肺敗毒方)治療新冠肺炎的相關RCT實驗表示,實驗組患者發(fā)燒、咳嗽、疲乏等癥狀與對照組相比明顯減輕,住院時間縮短,不良反應無明顯差別,證明上述方劑對新冠的作用。
中醫(yī)把人體看作一個整體,認為構成人體的各個部分,在結構上不可分割,在功能上相互協(xié)調(diào)制約。同樣,在治療方面,方劑也以整體的形式存在,按照中醫(yī)對病癥、藥物配伍關系等特有的認識及思維模式,進行合理組方,整體調(diào)節(jié),在辨證施治的過程中,始終強調(diào)方劑,而非單個藥物,各個藥物根據(jù)方劑中君臣佐使的配伍關系,達到最佳的治療效果。但是目前仍無法得知治療效果是由于方劑中的主要藥物,或者是主要藥物的主要成分起到治療作用還是方劑的整體作用,又鑒于西藥目前沒有特異性的治療藥物,對新冠治療和抑制具有局限性,對于中藥處方通過虛擬篩選方式衡量藥物和新冠蛋白的作用能力,以驗證三藥三方對新冠的作用,明確中醫(yī)藥在治療此次新冠肺炎治療中發(fā)揮的中藥作用。
發(fā)明內(nèi)容
為了解決上述問題,本發(fā)明提出了一種基于協(xié)同過濾的新型冠狀病毒中藥組方推薦方法及系統(tǒng),將三藥三方中藥化合物和新冠蛋白質(zhì)進行分子對接,衡量中藥及中藥組方與新冠蛋白質(zhì)的結合能力,同時基于協(xié)同過濾算法進行中藥組方的推薦,驗證中藥組方對新冠病毒治療的有效性。
為了實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采用如下技術方案:
第一方面,本發(fā)明提供一種基于協(xié)同過濾的新型冠狀病毒中藥組方推薦方法,包括:
獲取三藥三方中藥的化合物,將化合物與新冠蛋白質(zhì)進行分子對接,得到化合物與蛋白質(zhì)的結合親和力;
基于ADME篩選、結合親和力和化合物自由能對接閾值對化合物進行篩選,得到有效化合物;
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