[發(fā)明專利]用于腫瘤預(yù)后分層評估的基因標(biāo)志物、評估方法及應(yīng)用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 202110028913.4
• 申請日: 2021-01-11
• 公開（公告）號(hào): CN112746108B
• 公開（公告）日: 2022-04-05
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 赫捷;高亦博;孫思進(jìn)
• 申請（專利權(quán)）人: 中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院腫瘤醫(yī)院
• 主分類號(hào): C12Q1/6886
• 分類號(hào): C12Q1/6886;G16B5/00;G16B20/00
• 代理公司: 北京美智年華知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 11846
• 代理人: 梁忠益;吳曉東

1.一種用于肺腺癌預(yù)后分層評估的基因標(biāo)志物，其特征在于，所述基因標(biāo)志物為METTL5、RAC1、RCCD1、C11orf24、SLC7A5。

2.一種基因標(biāo)志物在構(gòu)建肺腺癌預(yù)后分層評估模型中的應(yīng)用，其特征在于，所述基因標(biāo)志物為METTL5、RAC1、RCCD1、C11orf24、SLC7A5。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的應(yīng)用，其特征在于，

將基因標(biāo)志物的表達(dá)量代入模型公式，計(jì)算每個(gè)樣本的風(fēng)險(xiǎn)評分；以及

根據(jù)模型的閾值對樣本進(jìn)行分組并進(jìn)行組間生存分析；

其中，所述模型公式為RS=(0.130 × EXP_METTL5) + (0.078 × EXP_RAC1) + (0.031 ×EXP_RCCD1) + (0.053 × EXP_C11orf24) + (0.096 × EXP_SLC7A5)，其中 EXP_METTL5為METTL5基因表達(dá)量，EXP_RAC1為RAC1基因表達(dá)量，EXP_RCCD1為RCCD1基因表達(dá)量，EXP_C11orf24為C11orf24基因表達(dá)量，EXP_SLC7A5為SLC7A5基因表達(dá)量。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的應(yīng)用，其特征在于，獲得所述基因標(biāo)志物的步驟包括：

提取GEO數(shù)據(jù)中腫瘤的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集；

根據(jù)平臺(tái)文件對探針進(jìn)行注釋；

合并基因相同的探針表達(dá)；及

對每一樣本的基因表達(dá)進(jìn)行歸一化。

5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的應(yīng)用，其特征在于，所述歸一化為LASSO回歸。