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[發(fā)明專利]藥物預(yù)測(cè)方法及模型的訓(xùn)練方法、裝置、電子設(shè)備及介質(zhì)在審

專利信息
申請(qǐng)?zhí)枺?/td> 202110007460.7 申請(qǐng)日: 2021-01-05
公開(公告)號(hào): CN112331261A 公開(公告)日: 2021-02-05
發(fā)明(設(shè)計(jì))人: 王凡;何徑舟;方曉敏;薛洋;劉荔行;張肖男;吳華;吳甜;王海峰 申請(qǐng)(專利權(quán))人: 北京百度網(wǎng)訊科技有限公司
主分類號(hào): G16B15/30 分類號(hào): G16B15/30
代理公司: 北京鴻德海業(yè)知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11412 代理人: 田宏賓
地址: 100085 北京市*** 國(guó)省代碼: 北京;11
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摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 藥物 預(yù)測(cè) 方法 模型 訓(xùn)練 裝置 電子設(shè)備 介質(zhì)
【權(quán)利要求書】:

1.一種藥物預(yù)測(cè)模型的訓(xùn)練方法,其中,所述方法包括:

獲取數(shù)個(gè)訓(xùn)練靶點(diǎn)的藥物數(shù)據(jù)集;

基于各所述訓(xùn)練靶點(diǎn)的藥物數(shù)據(jù)集,對(duì)所述藥物預(yù)測(cè)模型進(jìn)行訓(xùn)練;所述藥物預(yù)測(cè)模型包括特征處理模塊、編碼模塊和解碼模塊;其中,

所述特征處理模塊,對(duì)于各所述訓(xùn)練靶點(diǎn)的藥物數(shù)據(jù)集中的各藥物,將對(duì)應(yīng)的藥物的特征表達(dá)、所述藥物與對(duì)應(yīng)的所述訓(xùn)練靶點(diǎn)的特征表達(dá)以及所采用的隨機(jī)向量表達(dá)拼接,得到綜合特征表達(dá);

所述編碼模塊,對(duì)所述藥物數(shù)據(jù)集中的各所述藥物對(duì)應(yīng)的所述綜合特征表達(dá)進(jìn)行編碼處理,得到編碼后的特征表達(dá);

所述解碼模塊,基于各所述藥物對(duì)應(yīng)的所述編碼后的特征表達(dá)進(jìn)行解碼處理,生成并輸出對(duì)應(yīng)的所述訓(xùn)練靶點(diǎn)的預(yù)測(cè)藥物的信息。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其中,基于各所述訓(xùn)練靶點(diǎn)的藥物數(shù)據(jù)集,對(duì)所述藥物預(yù)測(cè)模型進(jìn)行訓(xùn)練,包括:

對(duì)于各所述訓(xùn)練靶點(diǎn)的藥物數(shù)據(jù)集,采用所述藥物預(yù)測(cè)模型生成并輸出對(duì)應(yīng)的所述訓(xùn)練靶點(diǎn)的預(yù)測(cè)藥物的信息;

基于所述預(yù)測(cè)藥物的信息和對(duì)應(yīng)的所述訓(xùn)練靶點(diǎn),檢測(cè)所述預(yù)測(cè)藥物與對(duì)應(yīng)的所述訓(xùn)練靶點(diǎn)的親和度;

基于所述藥物數(shù)據(jù)集、所述預(yù)測(cè)藥物的信息、判別器模型、所述預(yù)測(cè)藥物與對(duì)應(yīng)的所述訓(xùn)練靶點(diǎn)的親和度,構(gòu)建綜合損失函數(shù);

判斷所述綜合損失函數(shù)是否收斂;

若不收斂,調(diào)整所述藥物預(yù)測(cè)模型的參數(shù)和所述判別器模型的參數(shù),使得所述綜合損失函數(shù)收斂。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其中,基于所述藥物數(shù)據(jù)集、所述預(yù)測(cè)藥物的信息、判別器模型、所述預(yù)測(cè)藥物與對(duì)應(yīng)的所述訓(xùn)練靶點(diǎn)的親和度,構(gòu)建綜合損失函數(shù),包括:

基于所述藥物數(shù)據(jù)集中各藥物的信息、所述預(yù)測(cè)藥物的信息以及所述判別器模型,構(gòu)建第一子損失函數(shù),以表征所述判別器模型不能區(qū)分所述預(yù)測(cè)藥物和所述藥物數(shù)據(jù)集中的藥物;

基于所述藥物數(shù)據(jù)集中各藥物與對(duì)應(yīng)的所述訓(xùn)練靶點(diǎn)的親和度、所述預(yù)測(cè)藥物與對(duì)應(yīng)的所述訓(xùn)練靶點(diǎn)的親和度,構(gòu)造第二子損失函數(shù),以表征與所述藥物數(shù)據(jù)集中各藥物與對(duì)應(yīng)的所述訓(xùn)練靶點(diǎn)的親和度相比,所述預(yù)測(cè)藥物與對(duì)應(yīng)的所述訓(xùn)練靶點(diǎn)的親和度的期望值最高;

取所述第一子損失函數(shù)和所述第二子損失函數(shù)的加權(quán)和,作為所述綜合損失函數(shù)。

4.根據(jù)權(quán)利要求2或3所述的方法,其中,基于各所述訓(xùn)練靶點(diǎn)的藥物數(shù)據(jù)集,對(duì)所述藥物預(yù)測(cè)模型進(jìn)行訓(xùn)練之后,所述方法還包括:

將所述預(yù)測(cè)藥物的信息、所述預(yù)測(cè)藥物與對(duì)應(yīng)的所述訓(xùn)練靶點(diǎn)的親和度更新至所述訓(xùn)練靶點(diǎn)對(duì)應(yīng)的所述藥物數(shù)據(jù)集中。

5.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其中,對(duì)于各所述訓(xùn)練靶點(diǎn)的藥物數(shù)據(jù)集,采用所述藥物預(yù)測(cè)模型生成并輸出對(duì)應(yīng)的所述訓(xùn)練靶點(diǎn)的預(yù)測(cè)藥物的信息,包括:

對(duì)于各所述訓(xùn)練靶點(diǎn)的藥物數(shù)據(jù)集中的各藥物,采用所述藥物預(yù)測(cè)模型的特征處理模塊,將對(duì)應(yīng)的藥物的特征表達(dá)、所述藥物與對(duì)應(yīng)的所述訓(xùn)練靶點(diǎn)的特征表達(dá)以及所采用的隨機(jī)向量表達(dá)拼接,得到綜合特征表達(dá);

采用所述藥物預(yù)測(cè)模型的編碼模塊,對(duì)所述藥物數(shù)據(jù)集中的各所述藥物對(duì)應(yīng)的所述綜合特征表達(dá)進(jìn)行編碼處理,得到編碼后的特征表達(dá);

采用所述藥物預(yù)測(cè)模型的解碼模塊,基于各所述藥物對(duì)應(yīng)的所述編碼后的特征表達(dá)進(jìn)行解碼處理,生成并輸出對(duì)應(yīng)的所述訓(xùn)練靶點(diǎn)的所述預(yù)測(cè)藥物的信息。

6.一種藥物信息預(yù)測(cè)方法,其中,所述方法包括:

獲取預(yù)設(shè)靶點(diǎn)的藥物數(shù)據(jù)集;

基于所述預(yù)設(shè)靶點(diǎn)的藥物數(shù)據(jù)集,采用預(yù)先訓(xùn)練的藥物預(yù)測(cè)模型,預(yù)測(cè)所述預(yù)設(shè)靶點(diǎn)的預(yù)測(cè)藥物的信息;所述藥物預(yù)測(cè)模型包括特征處理模塊、編碼模塊和解碼模塊;其中,

所述特征處理模塊,對(duì)于所述預(yù)設(shè)靶點(diǎn)的藥物數(shù)據(jù)集中的各藥物,將所述藥物數(shù)據(jù)集中各藥物的特征表達(dá)、所述預(yù)設(shè)靶點(diǎn)的特征表達(dá)以及所采用的隨機(jī)向量表達(dá)拼接,得到綜合特征表達(dá);

所述編碼模塊,對(duì)所述藥物數(shù)據(jù)集中的各所述藥物對(duì)應(yīng)的所述綜合特征表達(dá)進(jìn)行編碼處理,得到編碼后的特征表達(dá);

所述解碼模塊,基于各所述藥物對(duì)應(yīng)的所述編碼后的特征表達(dá)進(jìn)行解碼處理,生成并輸出對(duì)應(yīng)的所述預(yù)設(shè)靶點(diǎn)的所述預(yù)測(cè)藥物的信息。

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