[發明專利]高級別漿液性卵巢癌的預后方法

在審

• 申請號: 202080033355.4
• 申請日: 2020-05-01
• 公開（公告）號: CN113785075A
• 公開（公告）日: 2021-12-10
• 發明（設計）人: A·范德斯托爾佩;W·F·J·費爾哈格
• 申請（專利權）人: 皇家飛利浦有限公司
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886
• 代理公司: 永新專利商標代理有限公司 72002
• 代理人: 劉兆君

本申請主要涉及一種用于確定被診斷為高級別漿液性卵巢癌的對象的預后的方法。所述方法包括基于對象樣本中至少兩種細胞信號傳導路徑的活性來確定預后，所述至少兩種細胞信號傳導路徑包括磷脂酰肌醇3?激酶(PI3K)路徑和核因子?kappa B(NFkB或NFκB)路徑。本申請還涉及一種用于識別將適合PI3K路徑靶向治療或NFkB路徑靶向治療的被診斷患有高級別漿液性卵巢癌的對象的方法。所述方法包括基于對象樣本中的包括PI3K路徑和NFkB路徑的至少兩種細胞信號傳導路徑的活性來識別對象。本申請還涉及相應的裝置、非瞬態存儲介質、計算機程序和套件。

技術領域

本文中描述的主題主要涉及生物信息學、基因組處理領域、蛋白質組處理領域和相關領域。更具體地，本發明涉及用于確定被診斷患有高級別漿液性卵巢癌的對象的預后的方法，以及用于識別將適合PI3K路徑靶向治療或NFkB路徑靶向治療的被診斷患有高級別漿液性卵巢癌的對象的方法。本發明還涉及一種裝置，一種非瞬態存儲介質和計算機程序，其用于確定被診斷患有高級別漿液性卵巢癌的對象的預后，或者用于識別將適合PI3K路徑靶向治療或NFkB路徑靶向治療的被診斷患有高級別漿液性卵巢癌的對象。更本發明還涉及一種用于確定被診斷患有高級別漿液性卵巢癌的對象的預后或者用于識別將適合PI3K路徑靶向治療或NFkB通路靶向治療的被診斷患有高級別漿液性卵巢癌的對象的套件。最后，本發明涉及所述套件在執行任何上述方法中的使用。所述預后和所述識別是基于細胞信號傳導路徑活性的組合來執行的。

背景技術

卵巢癌(OVC)是最致命的婦科惡性腫瘤，也是全球女性癌癥死亡的最常見原因之一。最常見和最致命的卵巢癌亞型是高級別漿液性卵巢癌(HGSOC)，其約占卵巢癌的75％。對于高級別漿液性卵巢癌的處置，除了手術減瘤(其中大部分腫瘤負荷被取走)外，還使用標準化療。化療方案通常包含順鉑或卡鉑，但發現許多患者對這些化合物表現出抗藥性。

在減瘤手術后的標準化療后，高級別漿液性卵巢癌的無病生存期(DFS)高度變化，并且目前尚無方法區分預后不良和無病生存期短的患者與預后較好和無病生存期較長的患者。

發明內容

根據一方面，本發明涉及一種用于確定針對被診斷患有高級別漿液性卵巢癌的對象的預后的方法，其中，所述方法包括：

基于對象樣本中至少兩種細胞信號傳導路徑的活性來確定預后，所述至少兩種細胞信號傳導路徑包括磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)路徑和核因子-kappa B(NFkB或NFκB)路徑，

其中，所述細胞信號傳導路徑活性基于針對所述細胞信號傳導路徑的三個或更多個靶基因的表達水平，并且其中，

所述三個或更多個PI3K靶基因選自包括以下項的組：AGRP、BCL2L11、BCL6、BNIP3、BTG1、CAT、CAV1、CCND1、CCND2、CCNG2、CDK 1A、CDK 1B、ESRl、FASLG、FBX032、GADD45A、INSR、MXIl、NOS3、PCKl、POMC、PPARGCIA、PRDX3、RBL2、SOD2、以及TNFSF10，或者選自包括以下項的組：ATP8A1、BCL2L11、BNIP3、BTGl、C10orf10、CAT、CBLB、CCNDl、CCND2、CDKNIB、DDB1、DYRK2、ERBB3、EREG、ESRl、EXT1、FASLG、FGFR2、GADD45A、IGF1R、IGFBP1、IGFBP3、INSR、LGMN、MXI1、PPM1D、SEMA3C、SEPP1、SESN1、SLC5A3、SMAD4、SOD2、TLE4、以及TNFSF10，或者選自包括以下項的組：SOD2、BNIP3、MXI1、PCK1、PPARGC1A和CAT，并且

所述三個或更多個NFkB靶基因選自包括以下項的組：BCL2L1、BIRC3、CCL2、CCL3、CCL4、CCL5、CCL20、CCL22、CX3CL1、CXCL1、CXCL2、CXCL3、ICAM1、IL1B、IL6、IL8、IRF1、MMP9、NFKB2、NFKBIA、NFKBIE、PTGS2、SELE、STAT5A、TNF、TNFAIP2、TNIP1、TRAF1、以及VCAM1，并且