[發明專利]一種控制小麥籽粒粒長的主效QTL位點及緊密連鎖的KASP引物和應用

有效

• 申請號: 202011627384.1
• 申請日: 2020-12-31
• 公開（公告）號: CN112760399B
• 公開（公告）日: 2022-05-20
• 發明（設計）人: 任天恒;范濤;李治;歐霞;譚飛泉
• 申請（專利權）人: 四川農業大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 北京眾合誠成知識產權代理有限公司 11246
• 代理人: 戚星

1.針對SNP分子標記AX-109894590的KASP引物，其特征在于，該KASP引物的正向引物1的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，其正向引物2的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，其反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示；其中，所述正向引物1和正向引物2的5’端連接有不同的熒光標簽序列。

2.一種鑒定小麥粒長主效QTL QKl.sau-6A的試劑盒，其特征在于，該試劑盒中的引物為權利要求1所述的KASP引物；所述主效QTL QKl.sau-6A在小麥的6A染色體上的遺傳位置為16.78-31.64 cM。

3.一種鑒定小麥粒長主效QTL QKl.sau-6A的方法，其特征在于，該方法包含：

利用如權利要求1所述的KASP引物進行熒光定量PCR擴增，根據PCR擴增結果對待測小麥材料進行基因分型，為：

若待測小麥材料出現KASP引物的正向引物2的熒光探針的熒光信號，而不含有正向引物1的熒光探針的熒光信號，則該待測小麥材料含有所述的小麥粒長主效QTL QKl.sau-6A；

若待測小麥材料出現KASP引物的正向引物1的熒光探針的熒光信號，而不含有正向引物2的熒光探針的熒光信號，則該待測小麥材料不含所述的小麥粒長主效QTL QKl.sau-6A；

其中，所述主效QTL QKl.sau-6A在小麥的6A染色體上的遺傳位置為16.78-31.64 cM；

所述小麥的品種為T1208或川農18。

4.根據權利要求3所述的方法，其特征在于，含有所述的小麥粒長主效QTL QKl.sau-6A的待測小麥材料的基因型記為B基因型，不含所述的小麥粒長主效QTL QKl.sau-6A的待測小麥材料的基因型記為A基因型，所述B基因型小麥株系的籽粒粒長顯著性高于A基因型小麥株系。

5.根據權利要求3所述的方法，其特征在于，所述熒光定量PCR擴增的反應體系包含：KASP Mastermix、如權利要求1所述的KASP引物、待測小麥材料的基因組DNA、RNase-free去離子水；其中，所述KASP引物中，正向引物1、正向引物2和反向引物的體積比為2:2:5。

6.根據權利要求3所述的方法，其特征在于，所述熒光定量PCR擴增的反應程序包含：95℃預變性10min；95℃變性20s，61℃退火延伸40s，循環10次，每次循環退火延伸溫度下降0.6℃；95℃變性20s，55℃退火延伸40s，循環30次；25℃保溫，采集熒光信號。

7.如權利要求3所述的鑒定小麥粒長主效QTL QKl.sau-6A的方法的應用，其特征在于，該應用包含以下任意一種：

（1）在選育和創制不同籽粒粒長的小麥資源中的應用；

（2）在用于推廣粒長主效QTL QKl.sau-6A與小麥的其它優良性狀位點間聚合育種的應用。