[發(fā)明專利]含有特異性分子靶標(biāo)的銀白色葡萄球菌標(biāo)準(zhǔn)參考菌株及其檢測(cè)和應(yīng)用

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202011619201.1
• 申請(qǐng)日: 2020-12-30
• 公開（公告）號(hào): CN112575100B
• 公開（公告）日: 2022-06-14
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 吳詩;吳清平;丁郁;陳謀通;薛亮;張菊梅;代京莎;王涓;葉青華;蔡芷荷;龐銳;雷濤;楊小鵑;張淑紅;古其會(huì);韋獻(xiàn)虎;張友雄;張峰;黃嘉慧;陳魯
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 廣東省微生物研究所（廣東省微生物分析檢測(cè)中心）;廣東環(huán)凱生物科技有限公司
• 主分類號(hào): C12Q1/689
• 分類號(hào): C12Q1/689;C12Q1/14;C12N15/11;C12N1/20;C12N1/04;C12R1/44
• 代理公司: 廣州三環(huán)專利商標(biāo)代理有限公司 44202
• 代理人: 顏希文;周全英

本發(fā)明涉及生物工程技術(shù)領(lǐng)域，具有涉及3株我國自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的、符合國內(nèi)傳播規(guī)律的銀白色葡萄球菌標(biāo)準(zhǔn)參考菌株，可用作食品、藥品、臨床檢驗(yàn)等不同領(lǐng)域的標(biāo)準(zhǔn)參考菌株。其保藏號(hào)分別為：GDMCC 60854、GDMCC 60948和GDMCC 60949。本發(fā)明的3株銀白色葡萄球菌菌株，遺傳背景清晰，且樣品來源、耐藥性和分子檢測(cè)靶標(biāo)等信息清晰，完全滿足食品、藥品、臨床檢驗(yàn)方面對(duì)于標(biāo)準(zhǔn)菌株的要求。本發(fā)明還涉及一組用于檢測(cè)、鑒別上述3株銀白色葡萄球菌標(biāo)準(zhǔn)菌株的特異性靶標(biāo)基因以及對(duì)應(yīng)的PCR引物。最后，本發(fā)明還提供了一種存活率高、特異性的銀白色葡萄球菌凍干保護(hù)劑，可用于本發(fā)明標(biāo)準(zhǔn)菌株的長(zhǎng)期儲(chǔ)存。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及生物工程技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及含有特異性分子靶標(biāo)的銀白色葡萄球菌標(biāo)準(zhǔn)參考菌株及其檢測(cè)和應(yīng)用。

背景技術(shù)

銀白色葡萄球菌(Staphylococcus argenteus,S.argenteus)是近年來在葡萄球菌屬中發(fā)現(xiàn)的一個(gè)新種，此前，由于其生化反應(yīng)與金黃色葡萄球菌非常相似，一直被認(rèn)為是金黃色葡萄球菌的一個(gè)亞型。通過全基因組測(cè)序，發(fā)現(xiàn)這兩個(gè)物種雖然16S rRNA的核酸序列一樣，但平均核苷酸一致性僅87％，而DNA-DNA雜交僅34％同源性。此外，銀白色葡萄球菌缺乏金黃色素，在表型上與金黃色葡萄球菌有著明顯的區(qū)別。與金葡菌類似，該菌同樣會(huì)引起細(xì)菌性食物中毒，同樣可導(dǎo)致中毒性休克綜合征、骨髓炎、化膿性心內(nèi)膜炎、菌血癥及致死性肺炎等多種感染，威脅人類健康。了解該菌的傳播規(guī)律以及致病性進(jìn)化是有效防控該菌所致的疾病的基礎(chǔ)，而是否使用了合適的標(biāo)準(zhǔn)菌株決定了研究結(jié)果的可靠性。

由于該菌一直與金黃色葡萄球菌未進(jìn)行完全區(qū)別，在我國也僅零星報(bào)告，而目前研究該菌的進(jìn)化規(guī)律和致病性使用的標(biāo)準(zhǔn)菌株為國外臨床來源的菌株，并不能很好地反映該菌在我國的實(shí)際情況，缺乏代表性的分離株來研究該菌在中國食品和環(huán)境中的遺傳結(jié)構(gòu)和傳播規(guī)律，為相關(guān)科研工作帶來困難。

目前報(bào)道的所采用的保護(hù)劑基本用于定性儲(chǔ)存金黃色葡萄球菌，未見于定性存儲(chǔ)銀白色葡萄球菌。因此，提供一種可長(zhǎng)期保存定量化銀白色葡萄球菌的凍干保護(hù)劑具有重要意義。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的在于克服現(xiàn)有技術(shù)的不足，提供一種銀白色葡萄球菌標(biāo)準(zhǔn)參考菌株及檢測(cè)該菌株的特異性分子靶標(biāo)和應(yīng)用。本發(fā)明提供的3株中國地區(qū)食源性銀白色葡萄球菌分離菌株，這些菌株具有典型的銀白色葡萄球菌特性，且能較好地反映該菌在中國地區(qū)的遺傳背景。

為實(shí)現(xiàn)上述目的，本發(fā)明采取的技術(shù)方案為：

提供一株銀白色葡萄球菌，是銀白色葡萄球菌(Staphylococcus argenteus)Sta180-0，分離自大頭魚樣品中，其分類命名為銀白色葡萄球菌(Staphylococcusargenteus)，已于2020年1月8號(hào)保藏于廣東省微生物菌種保藏中心，保藏編號(hào)為GDMCC60854。

提供一株銀白色葡萄球菌，是銀白色葡萄球菌(Staphylococcus argenteus)Sta226-0，分離自魷魚樣品中，其分類命名為銀白色葡萄球菌(Staphylococcusargenteus)，已于2020年1月8號(hào)保藏于廣東省微生物菌種保藏中心，保藏編號(hào)為GDMCC60948。

提供一株銀白色葡萄球菌，是銀白色葡萄球菌(Staphylococcus argenteus)Sta3513A1，分離自西紅柿樣品中，其分類命名為銀白色葡萄球菌(Staphylococcusargenteus)，已于2020年1月8號(hào)保藏于廣東省微生物菌種保藏中心，保藏編號(hào)為GDMCC60949。

進(jìn)一步地，所述保藏編號(hào)為GDMCC60854的銀白色葡萄球菌的分子型別為ST2250-t701，耐受的抗生素為泰利霉素。

進(jìn)一步地，所述保藏編號(hào)為GDMCC60948的銀白色葡萄球菌的分子型別為ST2250-t127，耐受的抗生素包括：氨芐西林、青霉素G、氯霉素和四環(huán)素。