[發(fā)明專利]與小麥赤霉病抗性相關(guān)的SNP分子標(biāo)記1995及應(yīng)用

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202011606320.3
• 申請(qǐng)日: 2020-12-30
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN112522437B
• 公開(kāi)（公告）日: 2022-09-23
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 鄧志英;趙云哲;王德華;趙新穎;方文琪
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 山東農(nóng)業(yè)大學(xué)
• 主分類號(hào): C12Q1/6895
• 分類號(hào): C12Q1/6895;C12N15/11;A01H1/04
• 代理公司: 濟(jì)南竹森知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 37270
• 代理人: 朱家富;孫憲維

本發(fā)明提了與小麥赤霉病抗性相關(guān)的SNP分子標(biāo)記及應(yīng)用，所述SNP分子標(biāo)記Kukri_c14239_1995位于小麥的1B染色體上，該分子標(biāo)記的核苷酸序列如SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.2所示，且第51位堿基為T或C，所述SNP分子標(biāo)記，第51位堿基為C的小麥具有赤霉病抗性；本發(fā)明涉及的SNP位點(diǎn)對(duì)于檢測(cè)小麥抗赤霉病品種、品系、育種材料的抗性具有重要意義，可根據(jù)其開(kāi)發(fā)分子標(biāo)記，加快小麥育種效率。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于小麥育種技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及與小麥赤霉病抗性相關(guān)的SPN分子標(biāo)記1995及應(yīng)用。

背景技術(shù)

小麥(Triticum aestivum L.)作為三大糧食作物之一，是重要的食用和飼用來(lái)源。然而，小麥生育期較長(zhǎng)，容易受到生物(病害、蟲害等)和非生物(干旱、凍害等)脅迫。小麥赤霉病(Fusarium headblight，F(xiàn)HB)由真菌鐮刀菌引起的一種小麥穗部病害，不僅造成小麥嚴(yán)重減產(chǎn)，而且鐮刀菌侵染產(chǎn)生的脫氧腐鐮刀菌烯醇(DON)等毒素，污染小麥籽粒。由于至今未發(fā)現(xiàn)完全免疫的品種，它已成為世界最具毀滅性的小麥病害，嚴(yán)重威脅糧食生產(chǎn)與食品安全。培育抗病品種，發(fā)掘抗病基因，是解決赤霉病問(wèn)題的最有效途徑。

現(xiàn)有技術(shù)中，利用遺傳連鎖分析和全基因組關(guān)聯(lián)分析對(duì)小麥赤霉病抗性進(jìn)行了廣泛的研究，發(fā)現(xiàn)與赤霉病抗性相關(guān)的QTL有200多個(gè)，分布在21條染色體上。目前，小麥赤霉病抗性分為5種類型，即抗侵染(TypeⅠ)、抗擴(kuò)展(TypeⅡ)、抗毒素積累(TypeⅢ)、籽粒抗性(TypeⅣ)和耐病性或耐產(chǎn)量損失(TypeⅤ)。其中，以抗侵染的TypeI型和抗擴(kuò)展的TypeII型被廣泛研究。目前已發(fā)現(xiàn)7個(gè)抗性基因(Fhb1到Fhb7)，其中Fhb1、Fhb2、Fhb4和Fhb5分別位于普通小麥的3BS、6BS、4BL和5AS染色體上，其余基因來(lái)源于小麥近緣種。除了這7個(gè)FHB基因外，還發(fā)現(xiàn)了一些重要的抗性位點(diǎn)。例如，QFhb.mgb-2A被鑒定為WAK2基因，其功能已得到證實(shí)。在5B染色體上，有明顯的抗性QFhb.mbr-5B被發(fā)現(xiàn)可以解釋高達(dá)36％的表型變異。

發(fā)明內(nèi)容

針對(duì)現(xiàn)有技術(shù)的不足，本發(fā)明提了與小麥赤霉病抗性相關(guān)的SNP分子標(biāo)記1995及應(yīng)用。

本發(fā)明以205份小麥材料構(gòu)成的自然群體為實(shí)驗(yàn)材料，在三個(gè)不同環(huán)境下對(duì)小麥赤霉病抗性進(jìn)行表型鑒定，結(jié)合90K小麥基因芯片進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析，并通過(guò)優(yōu)異等位基因鑒定和關(guān)聯(lián)位點(diǎn)表型分析，發(fā)掘出抗性優(yōu)異等位基因，為小麥赤霉病抗性基因發(fā)掘和分子標(biāo)記輔助選擇抗性育種提供了理論指導(dǎo)和基礎(chǔ)。

本發(fā)明的技術(shù)方案如下：

一種與小麥赤霉病抗性相關(guān)的SNP分子標(biāo)記Kukri_c14239_1995，其位于小麥的1B染色體上，該分子標(biāo)記的核苷酸序列如SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.2所示。

所述SNP分子標(biāo)記Kukri_c14239_1995的核苷酸序列第51位堿基為T或C。

根據(jù)本發(fā)明優(yōu)選的，所述SNP分子標(biāo)記的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，即該序列第51位堿基為C的小麥具有赤霉病抗性。

根據(jù)本發(fā)明優(yōu)選的，所述SNP分子標(biāo)記的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，即該序列第51位堿基為C時(shí)，SNP分子標(biāo)記的基因型為CC型；所述SNP分子標(biāo)記的核苷酸序列如SEQID NO.2所示，即該序列第51位堿基為T時(shí)，SNP分子標(biāo)記的基因型為TT，所述SNP分子標(biāo)記的TT基因型個(gè)體的小麥赤霉病發(fā)病率顯著高于CC基因型個(gè)體。

一種利用SNP分子標(biāo)記在選育具有赤霉病抗性的小麥品種或品系中的用途，所述SNP分子標(biāo)記至少包括上述的SNP分子標(biāo)記Kukri_c14239_1995。

根據(jù)本發(fā)明優(yōu)選的，上述用途中，所述SNP分子標(biāo)記還包括SNP分子標(biāo)記Kukri_c4143_1055和RAC875_c5646_774；