[發(fā)明專利]一種用于檢測抗稻瘟病Pik基因的SNP分子標(biāo)記及其應(yīng)用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 202011566147.9
• 申請日: 2020-12-25
• 公開（公告）號: CN112695114B
• 公開（公告）日: 2022-05-20
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 彭佩;鄭秀婷;江南;唐順學(xué);肖金華;田冰川
• 申請（專利權(quán)）人: 華智生物技術(shù)有限公司
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 廣州嘉權(quán)專利商標(biāo)事務(wù)所有限公司 44205
• 代理人: 肖云

1.一種SNP分子標(biāo)記，所述SNP分子標(biāo)記的多態(tài)性位于MSU7.0基因組版本中水稻第11號染色體第27998933位點(diǎn)處堿基為T/C。

2.用于擴(kuò)增權(quán)利要求1所述SNP分子標(biāo)記的引物，其特征在于，所述引物的序列如下所示：

特異性引物：

Primer X：5’-GCCCACAATATTCATATCAGGT-3’（SEQ ID NO.1）；

Primer Y：5’-CCCACAATATTCATATCAGGC-3’（SEQ ID NO.2）；

通用引物：

Primer C：5’-ACCTTGATTGTAGGCAGCTT-3’（SEQ ID NO.3）。

3.一種試劑盒，其特征在于，包含權(quán)利要求2所述引物。

4.權(quán)利要求1所述分子標(biāo)記在輔助鑒定抗稻瘟病Pik基因和/或輔助育種中的應(yīng)用。

5.權(quán)利要求2所述引物或權(quán)利要求3所述試劑盒在檢測抗稻瘟病Pik基因和/或輔助育種中的應(yīng)用。

6.一種檢測抗稻瘟病Pik基因型的方法，其特征在于，包括如下步驟：

S1：采用權(quán)利要求2所述引物或權(quán)利要求3所述試劑盒對水稻樣品基因組進(jìn)行KASP反應(yīng)檢測；其中，兩條特異性引物分別連接不同的熒光接頭序列；

S2：若只檢測到引物Primer Y所連熒光接頭序列對應(yīng)的熒光信號，則判斷水稻樣品為具有抗稻瘟病的純合Pik基因型；若只檢測到引物Primer X所連熒光接頭序列對應(yīng)的熒光信號，則判斷水稻樣品為不具有抗稻瘟病的純合pik基因型；若同時(shí)檢測到兩種熒光，則判斷水稻樣品為具有抗稻瘟病的雜合Pik基因型。

7.權(quán)利要求1所述分子標(biāo)記或權(quán)利要求2所述引物或權(quán)利要求3所述試劑盒在水稻種質(zhì)資源改良中的應(yīng)用。

8.權(quán)利要求1所述分子標(biāo)記或權(quán)利要求2所述引物或權(quán)利要求3所述試劑盒在水稻稻瘟病的抗性改良中的應(yīng)用。

9.權(quán)利要求1所述分子標(biāo)記或權(quán)利要求2所述引物或權(quán)利要求3所述試劑盒在培育具有抗稻瘟病能力水稻中的應(yīng)用。