[發明專利]一種代謝途徑預測方法、系統、終端設備及可讀存儲介質

在審

• 申請號: 202011509783.8
• 申請日: 2020-12-18
• 公開（公告）號: CN112530516A
• 公開（公告）日: 2021-03-19
• 發明（設計）人: 紀超杰;吳紅艷;蔡云鵬;鄭奕嘉
• 申請（專利權）人: 深圳先進技術研究院
• 主分類號: G16B5/00
• 分類號: G16B5/00;G16C20/30;G06N3/04
• 代理公司: 北京市誠輝律師事務所 11430
• 代理人: 范盈

1.一種代謝途徑預測方法，其特征在于，所述方法包括：

根據第一物質對第二物質進行裁剪獲得第一結構，所述第一結構為所述第一物質與所述第二物質的共同分子子結構；將所述第二物質轉換為聯合樹一，所述聯合樹一為所述第一物質中非共同分子子結構的聯合樹表示；將所述聯合樹一與所述第一結構拼接得到結構確定的所述第一物質；

將所述結構確定的第一物質作為第二物質二，根據第一物質二重復以上過程得到結構確定的第一物質二。

2.如權利要求1所述的代謝途徑預測方法，其特征在于，所述裁剪包括獲取所述第二物質的待裁剪區域，根據所述帶裁剪區域確定裁剪中心，根據所述裁剪中心確定裁剪分支，對所述裁剪分支進行裁剪獲得所述第一結構。

3.如權利要求2所述的代謝途徑預測方法，其特征在于，將所述第二物質轉換為聯合樹一包括：

將所述第二物質轉換為聯合樹二；

對所述第二物質進行編碼轉換為節點向量表示一，對所述聯合樹二進行編碼轉換為節點向量表示二；

將所述節點向量表示一與所述節點向量表示二進行樹解碼轉換為所述聯合樹一。

4.如權利要求3所述的代謝途徑預測方法，其特征在于，所述樹解碼包括從樹根節點開始遞歸第一節點，判斷所述第一節點是否為新節點，如果所述第一節點為新節點，獲取所述新節點的化學子結構；循環以上步驟，返回根節點得到所述聯合樹一。

5.如權利要4所述的代謝途徑預測方法，其特征在于，所述樹根節點為所述裁剪中心；通過拓撲結構預測所述第一節點是否為新節點；通過標簽預測所述新節點的化學子結構。

6.如權利要1所述的代謝途徑預測方法，其特征在于，將所述聯合樹一轉換為分子圖包括：

對所述聯合樹一中所有可能的分子結構組合進行表示得到分子結構組合集；根據第一物質子圖，從所述分子結構組合集中選取最優分子結構組合。

7.如權利要1所述的代謝途徑預測方法，其特征在于，將所述第一結構與所述聯合樹一拼接獲得所述第一物質包括將所述聯合樹一轉換為分子圖；將所述分子圖與所述第一結構進行合并，生成所述結構確定的所述第一物質，得到第二物質代謝為第一物質的模式，依次類推，得到代謝途徑。

8.一種代謝途徑預測系統，其特征在于，所述系統包括：

分子剪裁單元，用于確定第一結構，所述第一結構為第一物質與第二物質的共同分子子結構；

轉換單元，用于將所述第二物質轉換為聯合樹一，所述聯合樹一為所述第一物質中非共同分子子結構部分；

分子拼接單元，用于將所述第一結構與所述聯合樹一拼接獲得結構確定的所述第一物質；

數據輸出單元，用于輸出物質的代謝途徑。

9.一種終端設備，包括存儲器、處理器以及存儲在所述存儲器中并可在所述處理器上運行的計算機程序，其特征在于，所述處理器執行所述計算機程序時實現如權利要求1至7任一項所述的方法。

10.一種計算機可讀存儲介質，所述計算機可讀存儲介質存儲有計算機程序，其特征在于，所屬計算機程序被處理器執行時實現如權利要求1至7任一項所述的方法。