[發明專利]一種與豬乳頭數性狀相關的SNP標記引物對及其應用

有效

• 申請號: 202011509529.8
• 申請日: 2020-12-18
• 公開（公告）號: CN112501311B
• 公開（公告）日: 2022-04-01
• 發明（設計）人: 李平華;黃瑞華;尹彥鎮;周天威;劉晨曦;王彬彬;蒲廣;陶偉
• 申請（專利權）人: 南京農業大學;淮安沐林新農村發展研究有限公司
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 南京天華專利代理有限責任公司 32218
• 代理人: 傅婷婷;徐冬濤

本發明涉及一種與豬乳頭數性狀相關的SNP標記引物對及其應用。所述SNP標記位于豬1號染色體上的SAMD4A基因的核苷酸序列上，所述SNP標記的位點為國際豬基因組11.1版本參考序列豬1號染色體rs80844123核苷酸位點的分子標記，且具有A/G多態性，所述SNP標記與蘇淮豬乳頭數極顯著相關(P0.01)。一種用于檢測所述的SNP標記的引物對，上游引物為：SEQ ID NO：2，下游引物為：SEQ ID NO：3。本發明提供的SNP標記與蘇淮豬乳頭數極顯著相關，通過鑒定該SNP標記的基因型來篩選具有多乳頭的蘇淮豬品系。該品系的建立能夠提高蘇淮豬的繁殖性能，并且產生更多的社會和經濟效益。

技術領域

本發明屬于分子生物學技術領域，涉及一種與豬乳頭數性狀相關的SNP標記引物對及其應用。

背景技術

在我國，豬肉是人們主要消費的肉類食品。隨著經濟的發展和生活質量的不斷提升，人們對于豬肉的需求量日益增加。如何提高母豬的繁殖性能以增加商品肉豬的出欄量是目前育種工作的重點。

在豬生產中，乳頭數(Teat Number)是最重要的繁殖性狀之一。根據分布位置的不同，乳頭可以分為左乳頭和右乳頭。根據生理結構和功能的差異，乳頭可分為有效乳頭、翻乳頭、副乳頭。其中，僅有效乳頭具備正常的泌乳功能。因此，乳頭數一般指母豬擁有的有效乳頭的數目。哺乳仔豬通過乳汁獲取維持自身生長發育所需的營養物質。這就意味著母豬的乳頭數對于其能夠哺育的仔豬數量具有重要影響。如果出生仔豬的數目超過了母豬的乳頭數目，就會導致一部分仔豬必須通過寄養或人工哺乳的方式才能存活，大大增加了仔豬哺育的成本。同時，有研究表明，每頭仔豬獲得的母體的乳頭數與仔豬的成活率密切相關，并對最終的生豬出欄量產生影響。由此可見，改善母豬的乳頭數性狀對于提高母豬的繁殖性能具有重要的意義。

蘇淮豬是以南京農業大學為技術依托單位，以淮安市淮陰種豬場為育種基地，會同淮安市農委、江蘇省畜牧總站等多家單位自1998年開始，歷時12年，聯合攻關培育而成的國家級畜禽遺傳資源新品種。蘇淮豬是在新淮豬的基礎上導入了大白豬的血統，同時具有耐粗飼、肉質優良、繁殖性能好的特點。通過對764 頭蘇淮豬乳頭數性狀進行統計分析發現，蘇淮豬左、右、總乳頭數的變異系數分別為8.50％、8.10％、7.23％，群體內存在一定的表型變異，說明蘇淮豬乳頭數存在提升的空間。因此，利用分子生物學技術提高蘇淮豬的乳頭數性狀具有重要的育種價值。

乳頭數屬于中等遺傳力(0.2-0.5)的數量性狀，遺傳機理相對復雜。常規的選育方法進展緩慢。利用主效SNP位點作為分子遺傳標記對乳頭數性狀進行選育有利于加快遺傳進展。在QTL數據庫中 (http://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/SS/index)，除Y染色體外的所有染色體上都鑒定到與乳頭數相關的QTL區域。這些QTL大都是通過微衛星標記基于連鎖分析定位得到，存在較大的置信區間，難以挖掘關鍵的主效基因和因果位點，很難直接應用于該性狀的遺傳改良。同時，大部分QTL的研究主要集中在西方商業豬種，如杜洛克、長白、大白及其與梅山豬雜交的資源群體中，對于中國地方培育品種如蘇淮豬的研究還很少。因此，鑒定與蘇淮豬乳頭數相關的 SNP標記，利用標記輔助選擇技術對蘇淮豬乳頭數性狀進行遺傳改良具有重要意義。

發明內容

本發明的目的在于針對傳統豬乳頭數選育耗時費力，選育效果慢，提供與豬乳頭數相關的SNP標記開發而成的選育分子標記。

本發明的另一個目的在于提供用于檢測上述SNP標記的引物對和檢測方法。

本發明的另一個目的在于提供上述SNP標記、分子標記、引物的用途。

本發明的目的可通過以下技術方案實現：