[發明專利]一種合成基因回路模型及構建方法在審
| 申請號： | 202011483822.1 | 申請日： | 2020-12-16 |
| 公開（公告）號： | CN112562782A | 公開（公告）日： | 2021-03-26 |
| 發明（設計）人： | 傅雄飛;袁慧麗;白陽 | 申請（專利權）人： | 中國科學院深圳先進技術研究院 |
| 主分類號： | G16B5/00 | 分類號： | G16B5/00;G16B20/00 |
| 代理公司： | 深圳市科進知識產權代理事務所(普通合伙) 44316 | 代理人： | 魏毅宏 |
| 地址： | 518055 廣東省深圳*** | 國省代碼： | 廣東;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 一種 合成 基因 回路 模型 構建 方法 | ||
1.一種合成基因回路模型的構建方法，其特征在于，該方法包括：
建立基因回路干預資源分配的流量平衡分析方法，并根據該基因回路干預資源分配的流量平衡分析方法模擬細胞生長速率；
將所述細胞生長速率代入基因回路動力學模型中，構建生長速率調控的基因回路模型，根據所述生長速率調控的基因回路模型模擬基因回路的動力學行為，獲得模擬結果；
對基因回路的動力學行為進行定量實驗，獲得實驗結果，通過對比所述模擬結果和實驗結果來修正所述基因回路耦合模型。
2.根據權利要求1所述合成基因回路模型的構建方法，其特征在于，所述基因回路干預資源分配的流量平衡分析方法以含有外源基因回路的蛋白質組分配作為流量平衡分析方法的額外限制條件，結合細菌的基因組代謝網絡模型構建。
3.根據權利要求1所述合成基因回路模型的構建方法，其特征在于，所述基因回路模型基于大腸桿菌細胞的基因組代謝網絡模型。
4.根據權利要求1所述合成基因回路模型的構建方法，其特征在于，所述合成基因回路的類型包括振蕩回路、撥動開關回路和邏輯門回路。
5.一種合成基因回路模型，其特征在于，其通過如權利要求1～4任一項所述合成基因回路模型的構建方法構建得到。
6.一種合成基因回路模型，其特征在于，包含了底盤細胞的代謝特性及蛋白質組資源分配生理狀態和外源基因回路的動力學行為。
7.一種電子設備，其特征在于，包括處理器，存儲器及存儲在所述存儲器上并可在所述處理器上運行的程序或指令，所述程序或指令被所述處理器執行時實現如權利要求1～4中任一所述合成基因回路模型的構建方法的步驟。
8.一種可讀存儲介質，其特征在于，所述可讀存儲介質上存儲程序或指令，所述程序或指令被處理器執行時實現如權利要求1～4中任一所述合成基因回路模型的構建方法的步驟。
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