[發明專利]數字切片掃描儀中蓋玻片邊界移除的方法及裝置

在審

• 申請號: 202011463301.X
• 申請日: 2020-12-09
• 公開（公告）號: CN112580663A
• 公開（公告）日: 2021-03-30
• 發明（設計）人: 耿世超
• 申請（專利權）人: 山東志盈醫學科技有限公司
• 主分類號: G06K9/46
• 分類號: G06K9/46;G16H30/40
• 代理公司: 濟南誠智商標專利事務所有限公司 37105
• 代理人: 李修杰

本發明公開了一種數字切片掃描儀中蓋玻片邊界移除的方法及裝置，方法包括以下步驟：獲得原始的切片導航預覽圖；對切片導航預覽圖進行二值化處理獲得二值化圖像；利用輪廓檢測函數對二值化圖像進行檢測并分離樣本；對樣本中輪廓進行邊界移除處理；將邊界移除處理后的二值化圖像繪制成最終的切片導航預覽圖。本發明數字切片掃描儀對樣本區域識別過程中，需要將蓋玻片的位置識別出來，并將邊界移除，提高了樣本區域識別的準確性。

技術領域

本發明涉及一種數字切片掃描儀中蓋玻片邊界移除的方法及裝置，屬于掃描儀圖像處理技術領域。

背景技術

數字切片掃描儀就是將數字圖像技術、機械控制與顯微光學技術相結合，把物理切片數字化的裝置。數字圖像技術負責采集識別樣本區域圖像；采集顯微光學放大的圖像，對圖像進行配準拼接形成高分辨率全信息圖像。機械控制完成對平臺的移動，通過移動使樣本區域逐次被顯微光學技術放大。顯微光學技術主要用來對樣本區域進行放大。

數字切片掃描儀中，切片放入設備形成導航預覽圖。導航預覽圖與設備移動對應，預覽圖上一個像素對應設備移動步數。通過導航預覽圖可以得到樣本區域，基本方法可以利用閾值分割得到二值圖像的方法。但在識別樣本區域的過程中，由于切片蓋玻片邊界透光性差，正好與樣本區域的透光性近似，這樣通過閾值不能很好的識別并去除蓋玻片的邊界。手動去除邊界的方法將嚴重影響掃描切片的效率。

傳統方法在進行玻片識別時，會有大量的蓋玻片位置存在，需要手動刪除；如果不刪除蓋玻片的位置也會被看作是組織區域被掃描，這樣會增加相應的掃描時間，同時文件中存了大量的不必要的數據；醫生在看數字病理切片時也會看到多余部分，影響病理醫生閱片。

發明內容

為了解決上述問題，本發明提出了一種數字切片掃描儀中蓋玻片邊界移除的方法及裝置，能夠提高樣本區域識別的準確性。

本發明解決其技術問題采取的技術方案是：

第一方面，本發明實施例提供的一種數字切片掃描儀中蓋玻片邊界移除的方法，包括以下步驟：

獲得原始的切片導航預覽圖；

對切片導航預覽圖進行二值化處理獲得二值化圖像；

利用輪廓檢測函數對二值化圖像進行檢測并分離樣本；

對樣本中輪廓進行邊界移除處理；

將邊界移除處理后的二值化圖像繪制成最終的切片導航預覽圖。

作為本實施例一種可能的實現方式，所述對切片導航預覽圖進行二值化處理獲得二值化圖像，包括：

對原始的預覽導航圖進行灰度化處理；

根據設定的閾值對灰度化處理后預覽導航圖進行預覽導航圖得到二值化圖像。

作為本實施例一種可能的實現方式，所述利用輪廓檢測函數對二值化圖像進行檢測并分離樣本，包括：

從二值圖像中利用Opencv的輪廓檢測函數檢測分離樣本；

將得到所有樣本的輪廓信息存入vectorvectorcv::Point類型的向量數組vectorContours中。

作為本實施例一種可能的實現方式，所述對樣本中輪廓進行邊界移除處理，包括：

利用函數contourarea計算向量數組vectorContours中所有樣本的像素面積大小，計算出樣本像素面積最大值AreaMax；將像素面積小于AreaMax*n的所有樣本從向量數組vectorContours中刪除，并得到刪除小樣本后的向量數組vectorContours，0.01＜n＜0.2。