[發(fā)明專利]一種檢測MECP2基因拷貝數(shù)變異的試劑盒

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 202011453523.3
• 申請日: 2020-12-11
• 公開（公告）號: CN112522386A
• 公開（公告）日: 2021-03-19
• 發(fā)明（設計）人: 代冰;周梅華;余艷;龔強;陳鵬;唐春燕;譚兵健
• 申請（專利權）人: 長沙金域醫(yī)學檢驗實驗室有限公司
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 長沙優(yōu)企知識產(chǎn)權代理事務所(普通合伙) 43243
• 代理人: 周棟

本發(fā)明公開了一種檢測MECP2基因拷貝數(shù)變異的試劑盒。所述試劑盒中含有如下引物對：Q?MECP2?LF：CATCACAGCCAATGACGCCC，Q?MECP2?LR：accccgcacggccgacgtCG，Q?MECP2?MF：CAAAATGTCCCAAATAGCCCACG，Q?MECP2?MR：CAAAgcaggaactggtgagAcAg，Q?MECP2?RF：CTGCCTCTGCTCACTTGTTGAG，Q?MECP2?RR：cctggaggtcctggtcttcAgTc。本發(fā)明簡單快捷，預實驗成本低，適用于小批量檢測和驗證。

技術領域

本發(fā)明屬于生物醫(yī)學檢測技術領域，具體涉及一種檢測MECP2基因拷貝數(shù)變異的試劑盒。

背景技術

MECP2重復綜合癥是一種嚴重的神經(jīng)發(fā)育障礙疾病，其主要特征為早發(fā)性肌張力減退、進食困難、胃食管反流和便秘、精神運動發(fā)育遲緩導致嚴重智力障礙、語言發(fā)育不良、進行性痙攣、反復呼吸道感染和癲癇發(fā)作等。MECP2重復綜合癥致病機制為MECP2基因的雜合全基因重復。該病主要以X連鎖的方式遺傳，多數(shù)男性患者遺傳自母親(雜合變異攜帶者)，少數(shù)為新發(fā)突變。女性攜帶者通常無癥狀，但也有文獻報道女性攜帶者表現(xiàn)出輕度智力障礙以及類似于男性患者的癥狀。

拷貝數(shù)變異(Copy number variation，CNV)一般是指長度為1kb以上的基因組大片段的拷貝數(shù)增加或者減少，主要表現(xiàn)為亞顯微水平的缺失、重復和倒位。與SNP相比，CNV數(shù)量雖然不多，但涉及更多的基因組序列，突變率更高。CNV是人類遺傳多樣性和個體間遺傳差異的一個重要原因，除了一部分會致病以外也可以作為遺傳多態(tài)性的一種。2004年，兩項里程碑式的研究發(fā)現(xiàn)這種DNA拷貝數(shù)亞微觀的變異(500kb)廣泛存在于正常人類基因組中。

CNV是基因組結構變異(Structural variation，SV)的重要組成部分，過去幾年中，隨著基因組信息的不斷挖掘以及檢測技術的進步，CNV在遺傳病發(fā)病中的作用越來越受到重視，其致病機制可能與基因劑量效應、基因斷裂、基因融合和位置效應等有關。對CNV的深入研究，可能有助于更好的理解遺傳性疾病的發(fā)病機制，有利于分子診斷和治療手段的研究和開發(fā)。

基于PCR技術的方法中應用最為廣泛的是qPCR，它利用相對定量實時PCR系統(tǒng)，對檢測樣本的目標基因(具有拷貝數(shù)多態(tài))以及參照基因(無拷貝數(shù)多態(tài))，利用2^-ΔΔCt相對定量分析法(Livak and Schmittgen，2001)進行拷貝數(shù)的分析。該方法簡單易于操作，敏感性高，重復性好，速度快和污染少，但是不適合大樣本的高通量檢測。

發(fā)明內容

本發(fā)明旨在克服現(xiàn)有技術中的不足，提供一種檢測MECP2基因拷貝數(shù)變異的試劑盒。

為了達到上述目的，本發(fā)明提供的技術方案為：

所述檢測MECP2基因拷貝數(shù)變異的試劑盒中含有如下引物對：

Q-MECP2-LF：CATCACAGCCAATGACGCCC(SEQ ID NO.1)

Q-MECP2-LR：ACCCCGCACGGCCGACGTCG(SEQ ID NO.2)

Q-MECP2-MF：CAAAATGTCCCAAATAGCCCACG(SEQ ID NO.3)

Q-MECP2-MR：CAAAGCAGGAACTGGTGAGACAG(SEQ ID NO.4)

Q-MECP2-RF：CTGCCTCTGCTCACTTGTTGAG(SEQ ID NO.5)

Q-MECP2-RR：CCTGGAGGTCCTGGTCTTCAGTC(SEQ ID NO.6)。

優(yōu)選地，所述試劑盒中還含有內參引物對：