[發明專利]一種水稻粒型相關基因GLW2的SNP分子標記及其應用

有效

• 申請號: 202011443769.2
• 申請日: 2020-12-11
• 公開（公告）號: CN112609018B
• 公開（公告）日: 2022-09-13
• 發明（設計）人: 彭佩;李文博;鄭秀婷;周霆;唐順學;肖金華;田冰川
• 申請（專利權）人: 華智生物技術有限公司
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 廣州嘉權專利商標事務所有限公司 44205
• 代理人: 肖云

本發明公開了一種水稻粒型相關基因GLW2的SNP分子標記及其應用。所述SNP分子標記為K_020501，K_020501的多態性為G或T。利用所述分子標記，可快速、精準的檢測水稻粒型相關基因GLW2。本發明在檢測過程中不需要酶切、電泳及測序等繁瑣的程序，減少氣溶膠的污染以及EB等有毒物的使用，有利于GLW2基因高效、環保的應用于水稻商業化分子育種中。

技術領域

本發明涉及水稻育種領域，具體涉及一種水稻粒型相關基因GLW2的SNP(單核苷酸多態性)分子標記及其應用。

背景技術

水稻是我國重要的糧食作物，其產量高低涉及糧食安全。近年來，隨著全球人口的激增,耕地面積的逐年減少，土地流轉與非糧化趨勢加劇，糧食短缺仍舊是困擾許多國家的重大問題。因此，開展水稻遺傳育種研究一直成為國家的重中之重，保持糧食的穩產及高產成為農作物品種選育的首要目標并亟需解決。

水稻產量構成要素主要包含有效穗數、穗粒數、粒重、結實率等，其中粒重主要是受粒型和灌漿影響。水稻的產量性狀是由多基因決定的復雜性狀，主要受單株有效穗數、每穗有效粒數和千粒重3個因素共同調控，千粒重遺傳力最高，主要由灌漿程度和粒型控制，粒型性狀又由粒長、粒寬和粒厚共同構成，通過分子標記對水稻粒型相關基因進行選擇可以在水稻苗期即對粒重進行選擇，可以大大提高育種效率。

發明內容

本發明旨在至少解決現有技術中存在的技術問題之一。為此，本發明提出一種水稻粒型相關基因GLW2的SNP分子標記。

本發明還提出用于檢測上述SNP分子標記K_020501的引物組。

本發明還提出上述SNP分子標記的檢測方法。

本發明還提出上述SNP分子標記的應用。

根據本發明的第一方面實施方式的SNP分子標記，所述SNP分子標記為K_020501，其中K_020501的多態性為G或T。

根據本發明的一些實施方式，所述SNP分子標記K_020501的多態性位點位于chr2.28865722(MSU7.0 position)。

根據本發明第二方面實施方式的用于檢測上述SNP分子標記K_020501的引物組，所述引物組包括特異性引物和通用引物，其中，特異性引物序列包括Primer Seq Allele X和Primer Seq Allele Y，所述Primer Seq Allele X的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；所述Primer Seq Allele Y的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；所述通用引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。

根據本發明的一些實施方式，優選地，所述Primer Seq Allele X的5’端連接FAM或HEX熒光序列，Primer Seq Allele Y的5’端分別連接FAM和HEX熒光序列。

根據本發明的一些實施方式，所述引物組在水稻育種中的應用。

根據本發明的第三方面實施方式的上述SNP分子標記的檢測方法，所述檢測方法包括以下步驟：

S1、從水稻葉片中提取基因組DNA；

S2、以步驟S1中提取的基因組DNA為模板，利用SNP分子標記K_020501的引物，對K_020501分子標記進行檢測；

S3、若K_020501的SNP位點堿基為G，判定測試的水稻樣品含有純合的GLW2基因；若檢測位點堿基為T，判定測試的水稻樣品含有純合的GLW2基因；若檢測位點同時檢測到G、T，判斷待測水稻含有雜合的GLW2基因。

根據本發明的一些實施方式，優選地，步驟S1中，水稻葉片中提取基因組DNA采用簡化CTAB法(十六烷基三甲基溴化銨法)。