[發明專利]一個鑒定陸地棉衣分的SNP分子標記

有效

• 申請號: 202011427663.3
• 申請日: 2020-12-07
• 公開（公告）號: CN112322775B
• 公開（公告）日: 2022-06-28
• 發明（設計）人: 賈曉昀;趙紅霞;朱繼杰;王士杰;李妙;王國印;和劍涵;郭亞興;潘秀芬;解輝;荊玲玲;王寒菊;牛立強;聶俊杰;李喜玲;沈金龍;焦秀芬;韓曉冉;白玥
• 申請（專利權）人: 河北省農林科學院糧油作物研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 成都方圓聿聯專利代理事務所(普通合伙) 51241
• 代理人: 李鵬

本發明公開了一個鑒定陸地棉衣分的SNP分子標記，所述分子標記位于SEQ ID No.1所示核苷酸序列的第501位置處，該處堿基為T或C。檢測待鑒定陸地棉基因組DNA中SNP位點的基因型，如果基因型為TT，則該陸地棉具有高衣分性狀；如果基因型為CC，則該陸地棉具有低衣分性狀。本發明的SNP分子標記可用于新品種選育，有助于打破遺傳連鎖、提高育種效率。

技術領域

本發明屬于分子生物學領域，具體涉及一種鑒定陸地棉衣分的SNP分子標記。

背景技術

棉花是世界上最重要的天然纖維作物，保證棉纖維產量對世界紡織業的穩定發展及人民生活有重要意義。因此，育種家在多年的育種實踐中，始終將高產作為育種目標孜孜以求。研究發現，產量是復雜的數量性狀，基因型和環境條件對產量的形成均有重要影響。衣分(lint percentage,LP)是棉花產量的重要構成因子，特別是對提高皮棉產量有重要價值，生產上更加偏愛高衣分品種。然而，衣分的提高是一個十分艱難的過程，特別是在傳統育種技術費時費力、親本材料遺傳同質化嚴重的情況下。龔舉武等(2019)研究認為，衣分主要為2點主基因+多基因遺傳模型，而不同環境條線下存在較大差異，因此，需要經過多環境鑒定才能提高選育效率、增加皮棉產量(龔舉武等，陸地棉衣分性狀的主基因-多基因遺傳分析，棉花學報，2019，31(3)：192-200)。Wang et al.(2015)和Su et al.(2016)等研究發現，衣分的廣義遺傳力超過60％，具有較強的遺傳控制(Wang et al.QTL mapping forfiber and yield traits in upland cotton under multiple environments,PloS ONE,2015,10(6):e0130742；Su et al.Detection of favorable QTL alleles and candidategenes for lint percentage by GWAS in Chinese upland cotton,Frontiers in PlantScience,2016,7:1576)。因此，通過分子標記輔助篩選技術，可以直接在后代篩選高衣分材料，提高育種效率。

數量性狀基因座定位(quantitative trait loci mapping,QTLmapping)是進行數量性狀遺傳基礎分析、挖掘候選基因的重要方法；單核苷酸多態性(single nucleotidepolymorphism，SNP)是植物基因組內數量最多、分布最廣的分子標記，在構建高密度遺傳圖譜、精細定位基因等方面具有較大的應用價值；將SNP用于QTL定位，通過構建高密度遺傳圖譜，能夠顯著提高定位的準確性。基于定位結果，篩選有效的分子標記，進而用于新品種選育，有助于打破遺傳連鎖、提高育種效率。

發明內容

本發明所要解決的技術問題為：如何提供一個與陸地棉衣分性狀相關的SNP分子標記。

本發明的技術方案為：一個鑒定陸地棉衣分的SNP分子標記，所述分子標記位于SEQ ID No.1所示核苷酸序列的第501位置處，該處堿基為T或C，導致衣分出現多態性。

該SNP分子標記可應用在棉花衣分性狀選育上。比如棉花種質資源衣分的早期預測或篩選，棉花衣分標記輔助選擇等。

鑒定陸地棉衣分性狀的方法，檢測待鑒定陸地棉基因組DNA中SNP位點的基因型，如果基因型為TT，則該陸地棉具有高衣分性狀；如果基因型為CC，則該陸地棉具有低衣分性狀。

與現有技術相比，本發明具有以下有益效果：

本發明的SNP分子標記可用于新品種選育，有助于打破遺傳連鎖、提高育種效率。

附圖說明

圖1為構建的高密度遺傳圖譜；

圖2為不同基因型亞群之間衣分的差異比較。

具體實施方式