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[發明專利]基于X光圖像的生物組織電鏡圖像校正方法、系統和裝置有效

專利信息
申請號: 202011372160.0 申請日: 2020-11-30
公開(公告)號: CN112396608B 公開(公告)日: 2021-05-04
發明(設計)人: 陳曦;周芳旭;韓華;李琳琳;馬宏圖 申請(專利權)人: 中國科學院自動化研究所
主分類號: G06T7/10 分類號: G06T7/10;G06T7/30
代理公司: 北京市恒有知識產權代理事務所(普通合伙) 11576 代理人: 郭文浩;尹文會
地址: 100190 *** 國省代碼: 北京;11
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 基于 圖像 生物 組織 校正 方法 系統 裝置
【權利要求書】:

1.一種基于X光圖像的生物組織電鏡圖像校正方法,其特征在于,所述方法包括:

步驟S10,將生物組織通過X射線顯微鏡獲取X射線圖像序列;

步驟S20,將所述生物組織切分成生物切片,并基于所述生物切片通過電子顯微鏡獲取電鏡圖像序列;

步驟S30,基于所述X射線圖像序列進行分割獲取第一細胞胞體圖像序列和第一血管二值化圖像序列;

基于所述電鏡圖像序列進行分割獲取第二細胞胞體圖像序列和第二血管二值化圖像序列;

步驟S40,基于所述第一細胞胞體圖像序列和第二細胞胞體圖像序列計算第一胞體質心集和第二胞體質心集;

對第一血管二值化圖像序列和第二血管二值化圖像序列進行圖像細化操作獲得第一血管網絡骨架圖像序列和第二血管網絡骨架圖像序列;基于所述第一血管網絡骨架圖像序列和第二血管網絡骨架圖像序列搜尋第一血管分叉點集和第二血管分叉點集;

步驟S50,將所述第一胞體質心集與第二胞體質心集進行點云匹配生成第一匹配點對集,將所述第一血管分叉點集與第二血管分叉點集進行匹配生成第二匹配點對集;

步驟S60,基于第一匹配點對集對應的質心三維坐標和第二匹配點對集對應的血管分叉點三維坐標獲取匹配點的映射關系,以所述X射線圖像序列為標準對所述電鏡圖像序列進行校正生成校正后三維電鏡圖像。

2.根據權利要求1所述的基于X光圖像的生物組織電鏡圖像校正方法,其特征在于,步驟S50包括:所述點云匹配方法為,若第一胞體質心與第二胞體質心屬于同一個細胞胞體質心,將對應的第一胞體質心和第二胞體質心設定為第一匹配點對集;若第一血管分叉點與第二血管分叉點屬于同一血管網絡分叉點時,將對應的第一血管分叉點與第二血管分叉點設定為第二匹配點對集。

3.根據權利要求1所述的基于X光圖像的生物組織電鏡圖像校正方法,其特征在于,所述映射關系,其計算方法為:

步驟B10,基于所述X射線圖像序列和電鏡圖像序列,計算單個像素包含的生物組織的物理尺寸之間的比例;

步驟B20,基于所述單個像素包含的生物組織的物理尺寸之間的比例,調整所述X射線圖像序列中的第一胞體質心坐標和第一血管分叉點坐標;

所述映射關系為調整后的第一胞體質心坐標和第一血管分叉點坐標作為第二胞體質心坐標和第二血管分叉點坐標的校正位置。

4.根據權利要求3所述的基于X光圖像的生物組織電鏡圖像校正方法,其特征在于,以所述X射線圖像序列為標準對所述電鏡圖像序列進行校正生成校正后三維電鏡圖像,其方法為:采用基于控制點的三維圖像形變方法,對所述電鏡圖像序列進行形變,使第二胞體質心坐標和第二血管分叉點坐標處于校正位置,生成校正后三維電鏡圖像序列,依據校正后電鏡圖像序列生成校正后的三維電鏡圖像。

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