[發明專利]用于堪薩斯分枝桿菌檢測的試劑盒及系統

有效

• 申請號: 202011356474.1
• 申請日: 2020-11-26
• 公開（公告）號: CN112538540B
• 公開（公告）日: 2022-11-22
• 發明（設計）人: 賈鑫淼;楊啟文;陳非;李翠丹
• 申請（專利權）人: 中國醫學科學院北京協和醫院
• 主分類號: C12Q1/689
• 分類號: C12Q1/689;C12Q1/04;C12M1/34;C12M1/00;C12R1/32
• 代理公司: 北京英創嘉友知識產權代理事務所(普通合伙) 11447
• 代理人: 耿超

本公開涉及一種用于堪薩斯分枝桿菌檢測的試劑盒及系統，該試劑盒包括用于檢測分子標志物的試劑，其中，所述分子標志物包括pfkA2基因、MKAN_11495基因、rrl G2923A位點、rrl T3022C位點和Rv1461 G2427C位點中的至少一種。通過識別上述分子標志物，本公開能夠實現堪薩斯分枝桿菌的精確檢測。

技術領域

本公開涉及生物技術領域，具體地，涉及用于堪薩斯分枝桿菌檢測的試劑盒、用于檢測分子標志物的試劑在制備用于堪薩斯分枝桿菌檢測的試劑盒中的用途以及用于堪薩斯分枝桿菌檢測的系統。

背景技術

非結核分枝桿菌(Non-tuberculous Mycobacterium，NTM)是指除結核分枝桿菌復合群(Mycobacterium tuberculosis(Mtb)complex)和麻風分枝桿菌(Mycobacteriumleprae)以外的分枝桿菌，廣泛存在于自然環境中。約三分之一的NTM可引起動物或人感染，例如堪薩斯分枝桿菌、鳥分枝桿菌、胞內分枝桿菌、膿腫分枝桿菌和龜分枝桿菌等。

NTM感染常見于結構性肺部疾病患者，感染人體后，NTM多侵犯患者肺組織，導致支氣管和肺泡組織發生進行性破壞，引起與肺結核相似的癥狀，影響患者的呼吸功能，嚴重時可造成宿主死亡。近年來，NTM感染率逐年上升，且多個研究表明NTM可在人與人之間傳染，因此，及時且準確地進行NTM檢測，具有重要的社會和臨床價值。

相關技術中，NTM檢測多依賴于靶基因測序和質譜檢測，其中，常見的靶基因有16SrRNA、16S-23S rRNA基因間隔區(ITS)、RNA聚合酶β亞基(rpoB)、熱休克蛋白65(hsp65)和DNA解旋酶(gyrA/gyrB)的編碼基因、sodA基因、recA基因等基因。

然而，在實現本公開的過程中，發明人發現現有NTM檢測技術的分辨率較低，無法準確分辨親緣關系較近的NTM菌株。

發明內容

本公開的目的是解決現有NTM檢測技術中存在的分辨率較低的問題，提供一種能夠精確檢測堪薩斯分枝桿菌的試劑盒及系統。

為了實現上述目的，第一方面，本公開提供一種用于堪薩斯分枝桿菌檢測的試劑盒，該試劑盒包括用于檢測分子標志物的試劑，其中，所述分子標志物包括pfkA2基因、MKAN_11495基因、rrl G2923A位點、rrl T3022C位點和Rv1461 G2427C位點中的至少一種。

可選地，所述用于檢測分子標志物的試劑包括能夠特異性擴增所述分子標志物的引物對，和/或，能夠與所述分子標志物特異性雜交的探針。

可選地，所述引物對包括SEQ ID NO:1～2、SEQ ID NO:3～4、SEQ ID NO:5～6、SEQID NO:7～8和SEQ ID NO:9～10所示引物中的至少一對。

第二方面，本公開提供用于檢測分子標志物的試劑在制備用于堪薩斯分枝桿菌檢測的試劑盒中的用途，所述分子標志物包括pfkA2基因、MKAN_11495基因、rrl G2923A位點、rrl T3022C位點和Rv1461 G2427C位點中的至少一種。

可選地，所述用于檢測分子標志物的試劑，包括能夠特異性擴增所述分子標志物的引物對，和/或，能夠與所述分子標志物特異性雜交的探針。

可選地，所述引物對包括SEQ ID NO:1～2、SEQ ID NO:3～4、SEQ ID NO:5～6、SEQID NO:7～8和SEQ ID NO:9～10所示引物中的至少一對。

第三方面，本公開提供用于堪薩斯分枝桿菌檢測的系統，該系統包括測序裝置、計算裝置和輸出裝置；

所述測序裝置用于對待測樣本的總核酸進行核酸序列測序，得到總核酸序列；