[發明專利]與豬肉肌內脂肪相關的SNP分子標記及其應用

有效

• 申請號: 202011352506.0
• 申請日: 2020-11-27
• 公開（公告）號: CN112322753B
• 公開（公告）日: 2023-09-26
• 發明（設計）人: 趙云翔;田宏山;蘇曉彤;高廣雄;李斌;高寧;朱琳;周玉;鄭偉;羅秋菊
• 申請（專利權）人: 廣西揚翔股份有限公司;佛山科學技術學院;廣西揚翔農牧有限責任公司;廣西揚翔豬基因科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 廣西中知科創知識產權代理有限公司 45130
• 代理人: 牙斐穎

本發明屬于分子標記技術和遺傳育種領域，具體涉及一種與豬肉肌內脂肪相關的SNP分子標記及其應用。本發明提供的SNP分子標記為WU_10.2_10_48312614，其為國際豬參考基因組11.1版本10號染色體上第43603091個核苷酸位點，該位點堿基多態性為G和T。此外，本發明提供了檢測該位點的上下游引物序列，以便進行高效檢測。本發明通過優選該SNP分子標記的優勢等位基因及對該位點的快速檢測，能夠為豬肉中肌內脂肪含量調控相關的SNP分子標記輔助育種提供參考依據，同時對培育具有優良肉品質性狀的肉豬品種和豬肉品質改良具有重要意義。

技術領域

本發明涉及分子生物標記技術和遺傳育種領域，具體涉及一種與豬肉肌內脂肪相關的SNP分子標記及其應用。

背景技術

我國是肉類生產和消費大國，肉類總產量占世界總產量三分之一左右，其中豬肉占到一半以上。近年來，隨著人們生活水平的不斷提高，對豬肉的需求逐漸由“量”向“質”轉變，即豬肉的品質問題成為人們日益關注的重點，美味、營養、健康肉品已成為人們追求的新目標。在影響豬肉品質的諸多因素中，肌內脂肪(intramuscular?fat，IMF)含量發揮著重要作用，與豬肉的嫩度、多汁性和風味高度相關，是決定豬肉品質的決定因素。因此，通過提高豬肉中肌內脂肪含量對于改善豬肉肉質、提高食用價值、滿足廣大消費者的要求具有重要的現實意義。

IMF是豬肉中脂肪沉積的主要形式之一，它指的是同一部位肌肉內部、肌纖維之間沉積的脂肪，主要位于肌內膜、肌束膜或肌外膜上，主要成分是磷脂和甘油三酯。有研究表明，肌內脂肪的含量越低，肌肉的嫩度、多汁性、風味及總體可接受程度也越低，2％-3％的肌內脂肪含量是衡量肉質的一個理想標準。此外，豬的肌內脂肪性狀具有相對較高的遺傳力(h²＝0.52)。因此，研究肌內脂肪對改善豬肉品質、生產健康肉產品及提高豬產業經濟效益具有重要意義，開發和利用分子標記及相關檢測技術使得肌內脂肪性狀在遺傳育種改良中獲得較快進展。

豬的全基因組關聯分析(genome－wide?association?study，GWAS)是一種主要以單核苷酸多態性(single?nucleotide?polymorphism，SNP)為分子遺傳標記，充分利用群體水平的連鎖不平衡，來進行全基因組水平上的關聯分析以定位影響肉質性狀表型的分子標記及其效應的方法。目前，對于豬肉質性狀的全基因組關聯分析已越來越多。Casiró等在杜洛克×皮特蘭雜交系上進行GWAS分析發現了多個與肉質性狀相關的候選基因；van?Son等對杜洛克和長白公豬進行GWAS分析發現了影響豬皮下脂肪中脂肪酸組成的主效SNP分子標記；以及Pena等在伊比利亞豬上發現了5個影響豬脂肪組成的區域，其中包含了多個可以影響豬肌內脂肪含量的標記和基因。本發明通過GWAS分析篩選得到與肌內脂肪性狀相關的SNP分子標記，為豬肉質性狀的改良提供了新的遺傳資源。

發明內容

本發明的目的在于，提供一種與豬肉肌內脂肪相關的SNP分子標記及其應用。本發明提供的SNP分子標記WU_10.2_10_48312614，為國際豬參考基因組11.1版本10號染色體上第43603091個核苷酸位點，該位點堿基多態性為G和T。此外，本發明提供了檢測該位點的上下游引物序列，以便進行高效檢測。本發明通過優選該SNP分子標記的優勢等位基因及對該位點的快速檢測，能夠為豬肉中肌內脂肪含量調控相關的SNP分子標記輔助育種提供參考依據，同時對培育具有優良肉品質性狀的肉豬品種和豬肉品質改良具有重要意義。

為實現上述目的，本發明所采取的技術方案：

一種與豬肉肌內脂肪相關的SNP分子標記，所述SNP分子標記為WU_10.2_10_48312614，其為國際豬參考基因組11.1版本10號染色體上第43603091個核苷酸位點，該位點堿基是G或T。

優選地，所述SNP分子標記的序列如SEQ?ID?NO：1所示，所述SEQ?ID?NO：1所示序列自5′端起第101位堿基是G或T。其中序列中的第101位堿基是G或T，導致豬肉中肌內脂肪含量產生差異。