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[發(fā)明專利]基于四面體三腳架輔助的多發(fā)夾串級聯(lián)組裝構(gòu)建通用型電化學生物傳感器超靈敏檢測靶在審

專利信息
申請?zhí)枺?/td> 202011346179.8 申請日: 2020-11-25
公開(公告)號: CN112649479A 公開(公告)日: 2021-04-13
發(fā)明(設(shè)計)人: 易鋼;黃玉麒;趙書慧;張文秀 申請(專利權(quán))人: 重慶醫(yī)科大學
主分類號: G01N27/26 分類號: G01N27/26;G01N27/30;G01N27/327;C12Q1/6825
代理公司: 暫無信息 代理人: 暫無信息
地址: 400016*** 國省代碼: 重慶;50
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摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 基于 四面體 三腳架 輔助 多發(fā) 級聯(lián) 組裝 構(gòu)建 通用型 電化學 生物 傳感器 靈敏 檢測
【權(quán)利要求書】:

1.基于構(gòu)建一種穩(wěn)定堅固的四面體三腳架輔助于多發(fā)夾串級聯(lián)組裝雜交反應(yīng)超靈敏的電化學生物傳感器優(yōu)于檢測核酸DNA和甲基化DNA,其方法技術(shù)都將進行在后詳細說明。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述“四面體三腳架”3條55堿基鏈和82堿基長鏈通過高溫變性穩(wěn)定形成,3條鏈5’端修飾巰基,合成后TECP還原于電極上穩(wěn)定修飾。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述多發(fā)夾串級聯(lián)組裝的均勻溶液各單獨發(fā)夾通過高溫變性后置室溫過夜穩(wěn)定形成,序列有效設(shè)計為靶標存在時促發(fā)逐個發(fā)夾后形成多發(fā)夾級聯(lián)雜交鏈。

4.根據(jù)權(quán)利要求2所述四面體三腳架凸出頂端部分穩(wěn)定識別捕獲靶標,權(quán)利要求2所述發(fā)夾H1第一結(jié)構(gòu)域在靶標存在時被催化打開,兩者穩(wěn)定雜交后順利促發(fā)多發(fā)夾串級聯(lián)雜交反應(yīng)。

5.同時靶標和四面體凸出端含5’-CCGG-3’結(jié)合后在Hpa Ⅱ酶識別驗證DNA甲基化,靶標:5’-TCTCAAGGACCACCGCATCTCTACCGCAGGCCGG AGCTGCCGAGCTTT-3’;四面體三腳架:5’-ACATTCCTAAGTCTGAAACATTACAGCTTGCTACACGAGAAGAGCCGCCATAGTATTTAAAGCTCGGCAGCTCCGGCCTGCG-3’。

6.根據(jù)權(quán)利要求3所述4發(fā)夾雜交鏈串聯(lián)組裝,各發(fā)夾各部分的堿基互補配對部分層層級聯(lián)反應(yīng)形成樹枝狀雜交鏈,穩(wěn)定于四面體支架,發(fā)夾H1:5’-GTAGAGATGCGGTGGTCCTTGAGAGAATTCTTAACGTCGCCTCATACTGTCTCAAGGACCACCGCAT-3’;

發(fā)夾H2:5’-TCTCAAGGACCACCGCATCTCTACATGCGGTGGTCCTTGAGACAGTATGCCTAGCAGAGTT-3’;

發(fā)夾H3:5’-TCGCCTCCTAGCAGAGTTACTTTGAAACTCTGCTAGGAGGCGACGTTAAGAATTC-3’;

發(fā)夾H4:5’-TCAAAGTAACTCTGCTAGGAGGCGAGAATTCTTAACGTCGCCTCCTAGCAGAGTT-3’。

7.根據(jù)權(quán)利要求5,因RuHex的電活性,超靈敏吸附于負載面積很大的多分支串級聯(lián)雜交鏈上,穩(wěn)定2分鐘,無光照下檢測DPV響應(yīng)信號。

8.根據(jù)權(quán)利要求1所述電化學生物傳感器制備方法,技術(shù)如下:

(1)四面體四條S鏈在含30mM TCEP巰基還原劑的TM反應(yīng)緩沖液中放置1小時充分還原,后95℃ 5分鐘一步合成1μM四面體三腳架穩(wěn)定存在并于-4℃儲存待用,總體積100μL;

(2)在0.5 M H2SO4中活化電極直到15個可重復(fù)CV后進行下述實驗,掃描電壓設(shè)置范圍為-0.2V-1.6V;

(3)發(fā)夾干粉溶解后需各自95℃ 5分鐘后室溫過夜形成終濃度1μM發(fā)夾結(jié)構(gòu),稀釋于雜交鏈緩沖液(SPSC)中,并混合儲存在-4℃,沒有靶DNA存在和相應(yīng)溫度條件時無法促發(fā)雜交鏈反應(yīng),SPSC緩沖液包含1 M NaCl 和50 mM NaH2PO4

(4)0.05μm氧化鋁粉末少量超純水中溶解混勻后拋光布上打磨金電極5分鐘,分別超純水、乙醇、超純水超聲儀中超聲5分鐘,食人魚溶液以3:1的98% H2SO4和30% H2O2 活化電極15分鐘后可備用;

(5)10μL四面體0.5μM滴加電極上室溫修飾過夜反;

(6)6μL 1mM MCH 滴加4℃封閉電極半小時;

(7)10μL靶DNA在DNA結(jié)合緩沖液中稀釋(血清實驗在10%血清中)滴加后37℃反應(yīng)2小時,事先制備好的1μM發(fā)夾混合物滴加37℃反應(yīng)5小時,DNA結(jié)合緩沖包括0.1M PB, 1 MNaCl 和20mM MgCl2?6H2O,PB 緩沖液包括0.2 M Na2HPO4和0.2 M NaH2PO4

滴加10μL靶甲基化DNA 2h反應(yīng)后加10μL一定酶活的HpaⅡ酶切37℃反應(yīng)2h,后多發(fā)夾串級聯(lián)組裝反應(yīng);

在含有5mM(Fe(CN)6)3?/4?的0.1MKCl溶液中進行循環(huán)伏安(CV)和電化學阻抗譜(EIS)的表征;

(10)在相應(yīng)濃度RuHex的10 mM Tri-HCl工作液中檢測DPV,先穩(wěn)定2分鐘后開始檢測,無明燈條件下檢測。

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