[發明專利]與棉花卷葉性狀相關的分子標記及其應用

在審

• 申請號: 202011326392.2
• 申請日: 2020-11-24
• 公開（公告）號: CN112226533A
• 公開（公告）日: 2021-01-15
• 發明（設計）人: 薛飛;喬艷清;李婧慧;石浩南;孫杰;楊永林;劉峰;張新宇;李艷軍
• 申請（專利權）人: 石河子大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 合肥中谷知識產權代理事務所(普通合伙) 34146
• 代理人: 洪玲

本發明涉及一種與棉花卷葉性狀相關的分子標記及其應用，該分子標記由2?5個特定的InDel/SNP分子標記組成，所述InDel/SNP分子標記均位于棉花第11號染色體上。與現有技術相比，SNP/InDel分子標記直接以DNA的形式表現，在棉花的各個組織和發育階段均可檢測，不受環境和季節限制，不存在表達與否等問題影響。棉花葉片的適當卷曲可使葉片維持直立，從而減少群體冠層蔭蔽，提高群體光能利用率。與棉花卷葉性狀緊密連鎖SNP/InDel分子標記，可用于棉花卷葉性狀的鑒定和棉花卷葉相關的株型輔助選擇育種，為棉花高光效育種提供可用標記和基因資源。

技術領域

本發明屬于植物分子生物學領域，具體涉及棉花卷葉性狀相關的分子檢測領域，尤其涉及一種與棉花卷葉性狀相關的分子標記及其應用。

背景技術

棉花作為棉紡織業的原材料，與人們的日常生活密切相關，是一種全球性的重要經濟作物，也是我國重要的經濟和戰略物資。棉花作為我國最大的商品棉生產基地，對新疆的經濟發展有至關重要的作用。然而，由于棉花自身生長特性導致棉花冠層蔭蔽，直接影響群體的光能利用效率，導致棉花高光效育種慢于其他模式植物。

作物株型是作物為適應環境而表現出的形態結構，直接決定棉花的品質與產量。葉片是光合作用的主要場所，是植物生長發育的主要源器官，承擔90％植物生長發育所需的有機物。葉片的形態對于棉花生長發育有重要影響，由于棉花自身生長習性，易造成冠層蔭蔽，使棉花群體光能利用率低，導致棉花高光效育種慢于其它模式作物，而適度卷曲的葉片可以維持葉片直立，可減少植株的陰影面積，以便在不影響光補償點的情況下提高光飽和點，從而提高群體光能利用率，達到提高干物質的積累以及作物產量的目的。另外，棉花卷曲葉片其蠟質含量高于普通闊葉，這有利于在干旱條件下減少植物的蒸騰作用，減少光輻射對葉片的傷害，同時對抗蟲也有非常重要的意義。

葉片是作物重要的株型性狀之一，對于構建棉花理想株型具有重要意義，目前尚無關于棉花卷葉緊密連鎖分子標記基因的相關報道，本發明通過篩選與棉花卷葉緊密連鎖的SNP/InDel位點，可以減少育種過程中的盲目性，提高棉花理想株型育種的效率。可為棉花高光效育種提供基因資源和種質資源，同時對探究棉花葉形形成的分子機制具有重要意義。

發明內容

本發明的目的就在于提供一種與棉花卷葉性狀相關的分子標記及其應用，以提供一種新的與棉花卷葉性狀緊密連鎖的SNP/InDel分子標記，為棉花卷葉性狀的檢測提供一種新的方法。

本發明通過以下技術方案來實現上述目的：

本發明提供了一種與棉花卷葉性狀相關的分子標記，該分子標記由一個InDel分子標記和4個SNP分子標記中的一個或多個InDel/SNP分子標記組成，命名為InDelNo.1、SNPIDNo.1-4，均位于棉花第11號染色體上，其中，InDelNo.1具有棉花第11號染色體第89027119位堿基及其上下游堿基組成的核苷酸序列，SNPIDNO.1具有棉花第11號染色體第89074679位堿基及其上下游堿基組成的核苷酸序列，SNPIDNO.2具有棉花第11號染色體第89074986位堿基及其上下游堿基組成的核苷酸序列，SNPIDNO.3具有棉花第11號染色體第89621017位堿基及其上下游堿基組成的核苷酸序列，SNPIDNO.4具有棉花第11號染色體第89736957位堿基及其上下游堿基組成的核苷酸序列，所述分子標記的突變形式如下表所示：

作為本發明的進一步優化方案，該分子標記由2-5個InDel/SNP分子標記組成。

本發明還提供上述分子標記在檢測棉花卷葉性狀或棉花分子標記輔助育種中的應用。

本發明還提供了用于檢測上述分子標記的特異性引物序列，如下表所示：