[發(fā)明專利]與棉花卷葉性狀相關(guān)的分子標(biāo)記及其應(yīng)用

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• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202011326392.2
• 申請(qǐng)日: 2020-11-24
• 公開（公告）號(hào): CN112226533A
• 公開（公告）日: 2021-01-15
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 薛飛;喬艷清;李婧慧;石浩南;孫杰;楊永林;劉峰;張新宇;李艷軍
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 石河子大學(xué)
• 主分類號(hào): C12Q1/6895
• 分類號(hào): C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 合肥中谷知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 34146
• 代理人: 洪玲

本發(fā)明涉及一種與棉花卷葉性狀相關(guān)的分子標(biāo)記及其應(yīng)用，該分子標(biāo)記由2?5個(gè)特定的InDel/SNP分子標(biāo)記組成，所述InDel/SNP分子標(biāo)記均位于棉花第11號(hào)染色體上。與現(xiàn)有技術(shù)相比，SNP/InDel分子標(biāo)記直接以DNA的形式表現(xiàn)，在棉花的各個(gè)組織和發(fā)育階段均可檢測(cè)，不受環(huán)境和季節(jié)限制，不存在表達(dá)與否等問題影響。棉花葉片的適當(dāng)卷曲可使葉片維持直立，從而減少群體冠層蔭蔽，提高群體光能利用率。與棉花卷葉性狀緊密連鎖SNP/InDel分子標(biāo)記，可用于棉花卷葉性狀的鑒定和棉花卷葉相關(guān)的株型輔助選擇育種，為棉花高光效育種提供可用標(biāo)記和基因資源。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于植物分子生物學(xué)領(lǐng)域，具體涉及棉花卷葉性狀相關(guān)的分子檢測(cè)領(lǐng)域，尤其涉及一種與棉花卷葉性狀相關(guān)的分子標(biāo)記及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

棉花作為棉紡織業(yè)的原材料，與人們的日常生活密切相關(guān)，是一種全球性的重要經(jīng)濟(jì)作物，也是我國(guó)重要的經(jīng)濟(jì)和戰(zhàn)略物資。棉花作為我國(guó)最大的商品棉生產(chǎn)基地，對(duì)新疆的經(jīng)濟(jì)發(fā)展有至關(guān)重要的作用。然而，由于棉花自身生長(zhǎng)特性導(dǎo)致棉花冠層蔭蔽，直接影響群體的光能利用效率，導(dǎo)致棉花高光效育種慢于其他模式植物。

作物株型是作物為適應(yīng)環(huán)境而表現(xiàn)出的形態(tài)結(jié)構(gòu)，直接決定棉花的品質(zhì)與產(chǎn)量。葉片是光合作用的主要場(chǎng)所，是植物生長(zhǎng)發(fā)育的主要源器官，承擔(dān)90％植物生長(zhǎng)發(fā)育所需的有機(jī)物。葉片的形態(tài)對(duì)于棉花生長(zhǎng)發(fā)育有重要影響，由于棉花自身生長(zhǎng)習(xí)性，易造成冠層蔭蔽，使棉花群體光能利用率低，導(dǎo)致棉花高光效育種慢于其它模式作物，而適度卷曲的葉片可以維持葉片直立，可減少植株的陰影面積，以便在不影響光補(bǔ)償點(diǎn)的情況下提高光飽和點(diǎn)，從而提高群體光能利用率，達(dá)到提高干物質(zhì)的積累以及作物產(chǎn)量的目的。另外，棉花卷曲葉片其蠟質(zhì)含量高于普通闊葉，這有利于在干旱條件下減少植物的蒸騰作用，減少光輻射對(duì)葉片的傷害，同時(shí)對(duì)抗蟲也有非常重要的意義。

葉片是作物重要的株型性狀之一，對(duì)于構(gòu)建棉花理想株型具有重要意義，目前尚無(wú)關(guān)于棉花卷葉緊密連鎖分子標(biāo)記基因的相關(guān)報(bào)道，本發(fā)明通過篩選與棉花卷葉緊密連鎖的SNP/InDel位點(diǎn)，可以減少育種過程中的盲目性，提高棉花理想株型育種的效率。可為棉花高光效育種提供基因資源和種質(zhì)資源，同時(shí)對(duì)探究棉花葉形形成的分子機(jī)制具有重要意義。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的就在于提供一種與棉花卷葉性狀相關(guān)的分子標(biāo)記及其應(yīng)用，以提供一種新的與棉花卷葉性狀緊密連鎖的SNP/InDel分子標(biāo)記，為棉花卷葉性狀的檢測(cè)提供一種新的方法。

本發(fā)明通過以下技術(shù)方案來(lái)實(shí)現(xiàn)上述目的：

本發(fā)明提供了一種與棉花卷葉性狀相關(guān)的分子標(biāo)記，該分子標(biāo)記由一個(gè)InDel分子標(biāo)記和4個(gè)SNP分子標(biāo)記中的一個(gè)或多個(gè)InDel/SNP分子標(biāo)記組成，命名為InDelNo.1、SNPIDNo.1-4，均位于棉花第11號(hào)染色體上，其中，InDelNo.1具有棉花第11號(hào)染色體第89027119位堿基及其上下游堿基組成的核苷酸序列，SNPIDNO.1具有棉花第11號(hào)染色體第89074679位堿基及其上下游堿基組成的核苷酸序列，SNPIDNO.2具有棉花第11號(hào)染色體第89074986位堿基及其上下游堿基組成的核苷酸序列，SNPIDNO.3具有棉花第11號(hào)染色體第89621017位堿基及其上下游堿基組成的核苷酸序列，SNPIDNO.4具有棉花第11號(hào)染色體第89736957位堿基及其上下游堿基組成的核苷酸序列，所述分子標(biāo)記的突變形式如下表所示：

作為本發(fā)明的進(jìn)一步優(yōu)化方案，該分子標(biāo)記由2-5個(gè)InDel/SNP分子標(biāo)記組成。

本發(fā)明還提供上述分子標(biāo)記在檢測(cè)棉花卷葉性狀或棉花分子標(biāo)記輔助育種中的應(yīng)用。

本發(fā)明還提供了用于檢測(cè)上述分子標(biāo)記的特異性引物序列，如下表所示：