[發明專利]經由表面增強拉曼光譜法對核酸進行測序

在審

• 申請號: 202011304650.7
• 申請日: 2020-11-19
• 公開（公告）號: CN112824879A
• 公開（公告）日: 2021-05-21
• 發明（設計）人: G·門敦薩;E·K·沃德利;V·克里希納穆爾蒂;R·A·門敦薩;M·G·布拉伯;K·蘇布拉馬尼亞姆
• 申請（專利權）人: 希捷科技有限公司
• 主分類號: G01N21/65
• 分類號: G01N21/65;C12Q1/6869
• 代理公司: 上海專利商標事務所有限公司 31100
• 代理人: 何焜;周全

1.一種對DNA鏈進行測序的方法，包括：

使所述DNA鏈通過拉曼傳感器的由等離子體納米結構界定并由至少一個激光器激發的納米通道熱點；

通過拉曼標記圖來鑒定在第一時間段存在于所述通道中的所述DNA鏈的第一區段的核苷酸，并且通過第二拉曼標記圖來鑒定在第二時間段存在于所述通道中的所述DNA鏈的第二區段的核苷酸；以及

將經鑒定的所述第一區段的核苷酸與經鑒定的所述第二區段的核苷酸進行比較以鑒定變化。

2.如權利要求1所述的方法，其中使所述DNA鏈通過包括使DNA模板鏈通過。

3.如權利要求1所述的方法，其中使所述DNA鏈通過包括經由DNA核酸外切酶拉動所述DNA鏈。

4.如權利要求1所述的方法，還包括通過電泳或磁泳來將所述模板鏈移動至所述納米通道。

5.如權利要求1所述的方法，其中使所述DNA鏈通過包括使所述DNA鏈通過拉曼傳感器的由兩個金等離子體納米結構界定的納米通道熱點，每個金等離子體納米結構均由激光器激發。

6.一種對DNA鏈進行測序的方法，包括：

使所述DNA鏈通過拉曼傳感器的由等離子體納米結構界定并由至少一個激光器激發的納米通道熱點；

鑒定在第一時間段存在于所述通道中的所述DNA鏈的第一區段的至少一個核苷酸的拉曼標記圖，并且鑒定在第二時段存在于所述通道中的所述DNA鏈的第二區段的至少一個核苷酸的第二拉曼標記圖；

將所述第一區段的所述拉曼標記圖與所述第二區段的所述第二拉曼標記圖進行比較以鑒定所述拉曼標記圖中的變化；以及

使所述拉曼標記圖中的所述變化與單個核苷酸相關。

7.如權利要求6所述的方法，其中使所述DNA鏈通過包括使DNA模板鏈通過。

8.如權利要求7所述的方法，其中使所述DNA模板鏈通過包括經由DNA聚合酶拉動所述DNA模板鏈。

9.如權利要求8所述的方法，其中經由所述DNA聚合酶拉動所述DNA模板鏈包括從多個單獨的游離核苷酸構建互補鏈。

10.一種表面增強拉曼光譜法(SERS)傳感器，包括：

樣品裝載通道，所述樣品裝載通道用于接收待測序的DNA鏈；

由至少兩個等離子體納米結構限定的SERS熱點，每個等離子體納米結構使激光被聚焦在其上，所述SERS熱點被調整大小以通過其中接收所述DNA模板鏈；

拉曼光譜儀，所述拉曼光譜儀可操作地連接至所述SERS熱點以測量來自所述DNA鏈的核苷酸的拉曼光譜；以及

次級室，所述次級室在所述SERS熱點的下游。