[發明專利]與大白菜基因共分離的根腫病分子標記syau3008、引物及應用

有效

• 申請號: 202011251056.6
• 申請日: 2021-02-04
• 公開（公告）號: CN112553359B
• 公開（公告）日: 2023-05-05
• 發明（設計）人: 龐文星;張雪;郭嬙;張志民;樸鐘云
• 申請（專利權）人: 沈陽農業大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 西安銘澤知識產權代理事務所(普通合伙) 61223
• 代理人: 崔瑞迎

本發明屬于生物技術領域，具體涉及一種與大白菜基因共分離的根腫病分子標記syau3008、引物及應用。所述syau3008的核苷酸序列為SEQ?ID?NO.1或者為SEQ?ID?NO.2。所述分子標記syau3008的變異穩定存在于植株中，避免了因為復雜性和特異性導致的后續分析模糊。特異引物syau3008?F/R檢測含有QS_B3.1抗病基因，無論該基因為純合還是雜合都表現出抗病，為今后大白菜抗病育種提供了抗病基因輔助選擇的分子標記。通過本發明的特異引物syau3008?F/R可對待測植株進行苗期鑒定，檢測成本低、準確性高，大大提高育種效率，縮短育種進程。

技術領域

本發明屬于生物技術領域，具體涉及一種與大白菜基因共分離的根腫病分子標記syau3008、引物及應用。

背景技術

大白菜(Brassica?rapa?ssp.pekinesis)作為十字花科蕓薹屬重要的蔬菜作物之一，在我國甚至世界都占有十分重要的地位，種植面積大，營養價值極高。近年來，根腫病(Clubroot)在我國很多地區，例如東北地區、西南地區、長江中上游等地均有發現，并且面積有擴大的趨勢?，F在已成為我國十字花科蕓薹屬作物的主要病害之一，其中大白菜受到的危害最為嚴重。根腫病是由蕓薹根腫菌(Plasmodiophora?brassicae)侵染引起的一種傳染性非常強的土傳病害。根腫菌專性寄生在蕓薹屬、蘿卜屬以及擬南芥等十字花科活體植物的根部。一般認為根腫菌屬于原生動物界、絲足蟲門、植物寄生黏菌綱、根腫菌目、根腫菌科的一種有害菌。在世界各地每年因為根腫病的危害導致蕓薹屬作物減產多達10％-15％，發病嚴重時可導致作物絕收。

面對大白菜根腫病發病區域日益擴大的嚴峻形勢，現有的生物防治、化學防治、農業防治措施雖然可以在一定程度上減輕根腫病的危害，但同時存在土壤、環境污染，生產成本高等諸多問題。仍不能從根本上解決大白菜栽培所面臨的嚴重問題?？共∮N是防控根腫病危害最經濟和有效的途徑之一。分子標記由于與植物性狀緊密連鎖，所以常作為抗病育種的輔助手段。

自從1961年Thoday首次利用一對側翼標記定位一個QTL以來，數量性狀尤其是經濟性狀的QTL研究取得了巨大進展。然而QTL的初步定位在染色體上是一個比較寬的區間，精細定位就是在完成初定位的基礎上，通過在QTL區域內加密標記并結合作圖群體的表型差異分析，將目標QTL鎖定在一個更小的區域。QTL精細定位需要大量的染色體片段的重組，可靠的表型測定以及高密度的分子標記。用于精細定位的群體可以是F₂、回交群體、重組自交系和近等基因系等群體。其中，近等基因系由于只在少數幾個甚至一個區段存在彼此差異，而其他遺傳背景完全相同。其基因組中只存在一個或幾個QTL，可以消除其它背景干擾和消除微效QTL的影響，特別適合于進行QTL精細定位的群體。緊密連鎖標記的開發直接影響到精細定位的效果。雖然大白菜抗根腫病育種取得了一定的進展，但于根腫菌的變異以及土壤中多個生理小種混生，導致抗病品種在種植3-5年后喪失抗性。根腫菌群體結構及致病力的分化給抗病育種帶來了新的挑戰。

因此，利用1個主效抗病基因(Clubroot?resistance,CR)進行抗病育種已經面臨嚴峻挑戰，需要在以抗地區優勢生理小種作為主要育種目標的同時聚合抗更多生理小種的抗病基因。從而借助分子標記輔助選擇(marker-assisted?selection，MAS)技術進行聚合抗病基育種。因此，目前迫切需要在挖掘和定位更多的抗根腫病基因基礎上，開發精準的高通用性抗病基因連鎖標記。

發明內容

為了解決上述技術問題，本發明提供了一種與大白菜基因共分離的根腫病分子標記syau3008、引物及應用。

本發明提供了一種與大白菜基因共分離的根腫病分子標記syau3008，所述syau3008的核苷酸序列為SEQ?ID?NO.1或者為SEQ?ID?NO.2，其中SEQ?ID?NO.1是與大白菜抗根腫病QS_B3.1基因共分離的分子標記，SEQ?ID?NO.2存在于感病個體中。