[發(fā)明專利]一種影響靶向治療藥物療效的評估模型

有效

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• 申請日: 2020-11-05
• 公開（公告）號: CN112289389B
• 公開（公告）日: 2022-08-30
• 發(fā)明（設計）人: 吳嘉;田曉明;熊旺平;余庚花
• 申請（專利權）人: 中南大學
• 主分類號: G16C20/70
• 分類號: G16C20/70;G16C20/80;G06N7/00
• 代理公司: 北京風雅頌專利代理有限公司 11403
• 代理人: 曾志鵬

本申請涉及一種影響靶向治療藥物療效的評估模型，所述評估模型用于檢測拷貝數改變對靶向治療藥物療效的影響，所述評估模型的構建包括以下步驟：獲取靶向治療中曲妥珠單抗受拷貝數改變的影響作用機制；構建所述拷貝數改變的條件概率函數，從所述條件概率函數中獲取變量M得分和R值；根據所述M得分和R值獲取期望最大化算法，利用所述期望最大化算法構建所述評估模型。證明了所提出的EM算法在估計條件概率參數方面可以優(yōu)于其他基于閾值的離散化方法，并通過EM算法的這些條件概率估計，進一步認識到了拷貝數改變干擾靶向治療過程中藥物療效的治療效果，提高了對于癌癥治療過程的醫(yī)學認識，推動了腫瘤醫(yī)學的發(fā)展和進步。

技術領域

本申請涉及生物醫(yī)藥技術領域，特別是涉及一種影響靶向治療藥物療效的評估模型。

背景技術

靶向療法包括小分子和單克隆抗體抑制劑，是新興的用于治療癌癥的腫瘤藥物。與化學療法全面攻擊包括腫瘤以及骨髓和毛囊等正常器官的快速分裂細胞不同，靶向治療直接影響失調的生物途徑以阻止腫瘤生長，提高治療效果并降低毒性。迄今為止，許多靶向藥物已被FDA批準。例如貝伐單抗，是一種人源化藥物，可通過干擾血管內皮生長因子的功能并減少新血管的形成而發(fā)揮作用，已被證明是臨床有效的，目前被用于治療轉移性結直腸癌。例如，腫瘤樣本中拷貝數改變與基因表達失調之間的頻繁一致性揭示了拷貝數改變定量影響基因轉錄的能力：拷貝數的得失可能分別導致過表達(激活)和下調(失活)，且現(xiàn)有技術中一致性關系可能并不總是成立。

此外，參與信號轉導途徑的拷貝數改變如何干擾信號轉導從而影響治療效果，目前仍不清楚。下游基因的拷貝數改變是否通常會導致比上游基因更大的信號偏離也是不確定的，沿路徑積累的拷貝數改變數量是否與偏離線性相關都未經過科學證明。

發(fā)明內容

基于此，有必要針對上述技術問題，提供一種影響靶向治療藥物療效的評估模型。

本發(fā)明實施例公開了一種影響靶向治療藥物療效的評估模型，所述評估模型用于檢測拷貝數改變對靶向治療藥物療效的影響，所述評估模型的構建包括以下步驟：

獲取靶向治療中曲妥珠單抗受拷貝數改變的影響作用機制；

構建所述拷貝數改變的條件概率函數，從所述條件概率函數中獲取變量M得分和R值；

根據所述M得分和R值獲取期望最大化算法，利用所述期望最大化算法構建所述評估模型。

進一步的，所述條件概率函數中包括影響所述拷貝數改變的串擾參數η_i、條件參數δ_i、串擾偏置Δ_i、條件偏置Δ’_i，所述M得分和R值為所述串擾參數η_i、條件參數δ_i、串擾偏置Δ_i、條件偏置Δ’_i的函數。

進一步的，所述M得分為所述拷貝數改變干擾效應的評分函數，所述M得分的評分函數為：

進一步的，所述R值為所述拷貝數改變干擾效應的方差函數，所述R值的方差函數為：

進一步的，所述評估模型基于貝葉斯網絡檢測基因表達失調之間的頻繁一致性，通過所述拷貝數改變定量影響基因轉錄的能力，并通過藥物靶點在信號傳導途徑中基因表達的激活和失活確定所述評估模型對藥物療效的影響效果。

進一步的，所述藥物靶點的信號傳導途徑為串結點結構，所述信號轉導途徑共有n+1個蛋白質參與者，包括從藥物靶點的根X₀傳導到葉X_n，任一所述蛋白質參與者X_i對應于特定基因G_i。