[發(fā)明專(zhuān)利]預(yù)測(cè)鼻咽癌免疫治療療效的標(biāo)志物組及應(yīng)用

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202011220045.1
• 申請(qǐng)日: 2020-11-05
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN112280862B
• 公開(kāi)（公告）日: 2022-04-26
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 馬駿;陳雨沛;柳娜;孫穎;呂佳蔚;李君炎;王雅琴;黎映琴;何慶梅;楊曉靜
• 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人: 中山大學(xué)腫瘤防治中心（中山大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院;中山大學(xué)腫瘤研究所）
• 主分類(lèi)號(hào): C12Q1/6886
• 分類(lèi)號(hào): C12Q1/6886;C12N15/11
• 代理公司: 廣州市諾豐知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 44714
• 代理人: 任毅;黃國(guó)亮

本發(fā)明公開(kāi)了預(yù)測(cè)鼻咽癌免疫治療療效的標(biāo)志物組及應(yīng)用，所述標(biāo)志物組包括ABI3、ACP5等第一組50個(gè)基因。基于第一組50個(gè)基因組成的標(biāo)志物可有效將鼻咽癌患者進(jìn)行免疫分型，分為免疫富集型與免疫荒漠型，方便指導(dǎo)患者的免疫治療。結(jié)合由ACTN1、AEBP1等第二組50個(gè)基因組成的標(biāo)志物后，可將患者區(qū)分為免疫激活型，免疫逃避型，與免疫荒漠型三個(gè)亞組，可以更為準(zhǔn)確地指導(dǎo)患者的免疫治療。通過(guò)實(shí)驗(yàn)證實(shí)了鼻咽癌中免疫激活型患者接受PD?1單抗治療的反應(yīng)性顯著優(yōu)于其他兩型（P=0.002），證實(shí)了免疫激活型患者可從PD?1單抗免疫治療中獲益。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及腫瘤的免疫治療領(lǐng)域，具體涉及預(yù)測(cè)鼻咽癌免疫治療療效的標(biāo)志物組及應(yīng)用。

背景技術(shù)

鼻咽癌是我國(guó)最為常見(jiàn)的頭頸部腫瘤，尤為好發(fā)于華南地區(qū)，也被稱(chēng)之為“廣東瘤”，主要是以放療為核心，輔以化療、靶向治療等多學(xué)科綜合治療。隨著治療方式的革新以及規(guī)范化治療的推行，早期鼻咽癌患者的生存率以及生活質(zhì)量都獲得了提高，然而中晚期鼻咽癌患者的預(yù)后仍舊不佳。因此，延長(zhǎng)鼻咽癌患者，特別是分期較嚴(yán)重的中晚期患者的生存時(shí)間，提高治療相關(guān)的生活質(zhì)量，成為鼻咽癌治療研究的焦點(diǎn)之一。

近些年，腫瘤免疫治療取得飛速發(fā)展，引領(lǐng)了腫瘤治療領(lǐng)域的重大突破，特別是以PD-1/PD-L1為代表的免疫檢查點(diǎn)抑制劑是目前腫瘤免疫治療較為成功的領(lǐng)域以及研究的熱點(diǎn)。相關(guān)免疫治療藥物，如抗PD-1單抗納武單抗、派姆單抗、卡瑞利珠單抗等等均在臨床試驗(yàn)中證實(shí)可有效提高晚期鼻咽癌患者的生存率，使得鼻咽癌患者在治療中獲得更大的獲益。然而免疫治療僅對(duì)部分患者有效，亟需特異性的生物標(biāo)志物能夠篩選合適的鼻咽癌患者，接受免疫治療，提高治療獲益，避免過(guò)度治療，最終達(dá)到精準(zhǔn)醫(yī)療。而目前仍然缺乏可有效預(yù)測(cè)鼻咽癌免疫治療療效的標(biāo)志物。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的在于提供預(yù)測(cè)鼻咽癌免疫治療療效的標(biāo)志物組及應(yīng)用。

本發(fā)明所采取的技術(shù)方案是：

本發(fā)明的第一個(gè)方面，提供：

預(yù)測(cè)鼻咽癌免疫治療療效的標(biāo)志物組，包括如下第一組50個(gè)基因：ABI3、ACP5、ADAMDEC1、AIF1、ARRB2、C1QA、C1QC、C2、C3AR1、CARD16、CASP1、CCR1、CD14、CD4、CD68、CD86、CSF1R、CTSC、CTSS、CYBB、DOK2、FCER1G、FGL2、FPR3、GBP1、GBP5、GIMAP4、GIMAP6、GRN、HAVCR2、IFI30、IL10RA、ITGB2、LAIR1、LCP2、LILRB4、MNDA、MPEG1、MYO1F、PLA2G7、PLEKHO2、SLAMF8、SLC31A2、SLC7A7、SPI1、STAT1、TCN2、THEMIS2、TMEM176B和TYROBP。

在一些實(shí)例中，通過(guò)檢測(cè)腫瘤組織中第一組50個(gè)基因的mRNA表達(dá)情況，并對(duì)其進(jìn)行非負(fù)矩陣分解一致性聚類(lèi)法二聚類(lèi)將鼻咽癌患者區(qū)分為免疫富集型患者或免疫荒漠型患者。

在一些實(shí)例中，免疫富集型亞組患者高表達(dá)與免疫激活相關(guān)的指標(biāo)，如免疫富集標(biāo)簽、效應(yīng)CD8+T細(xì)胞等，而免疫荒漠型則缺乏這一特征。

在一些實(shí)例中，還包括如下第二組50個(gè)基因：ACTN1、AEBP1、BGN、CALD1、COL12A1、COL15A1、COL1A1、COL1A2、COL3A1、COL4A1、COL4A2、COL5A1、COL5A2、COL6A1、COL6A2、COL6A3、CTHRC1、CTSK、EMILIN1、EMP1、ENG、FBLN2、FILIP1L、FN1、FSTL1、FURIN、GGT5、GREM1、ISLR、LUM、METRNL、MFAP2、MMP11、MMP2、MXRA8、MYADM、MYL9、NBL1、PCOLCE、PDGFRB、PDLIM7、PMP22、POSTN、RAB31、SPARC、SPON2、SULF1、TIMP2、TPM2和TPM4。