[發明專利]一種檢測蝦夷扇貝的實時熒光PCR引物探針及方法在審
| 申請號: | 202011213818.3 | 申請日: | 2020-11-04 |
| 公開(公告)號: | CN112176074A | 公開(公告)日: | 2021-01-05 |
| 發明(設計)人: | 王慶志;楊滴;李華琳;滕煒鳴;劉項峰;于佐安;謝璽;李大成;傅志宇;張明 | 申請(專利權)人: | 遼寧省海洋水產科學研究院 |
| 主分類號: | C12Q1/6888 | 分類號: | C12Q1/6888;C12Q1/6851;C12N15/11 |
| 代理公司: | 錦州遼西專利事務所(普通合伙) 21225 | 代理人: | 王佳佳 |
| 地址: | 116023 遼寧*** | 國省代碼: | 遼寧;21 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 檢測 扇貝 實時 熒光 pcr 引物 探針 方法 | ||
1.一種檢測蝦夷扇貝的實時熒光PCR引物探針及方法,其特征是:
分別為:
上游引物P1:TGGCTTCTGCCTTTGTTGTTG;
下游引物P2:GCAAAAGGGACAAGCCAAAA;
帶有熒光染料的探針序列為:AGATTCCCTCGGGTCAACGCTCTGA。
2.根據權利要求1所述的檢測蝦夷扇貝的實時熒光PCR引物探針及方法,其特征是:所述的熒光染料,5’端為FAM標記,3’端TAMRA標記。
3.一種利用如權利要求1所述實時熒光PCR引物探針檢測蝦夷扇貝的實時熒光PCR方法,其特征是:
其步驟如下:
a.提取待檢樣品基因組DNA;
b.以所提取的DNA作為模板,加入實時熒光PCR引物探針以及酶反應液進行實時熒光PCR反應,記錄樣品反應的Ct值;
所述的實時熒光PCR反應體系為:
4.根據權利要求3所述的檢測蝦夷扇貝的實時熒光PCR方法,其特征是:所述實時熒光PCR反應條件為:95℃ 20s,1個循環;95℃ 3s、60℃ 30s,40個循環。
5.根據權利要求4所述的檢測蝦夷扇貝的實時熒光PCR方法,其特征是:所述實時熒光PCR方法設置空白對照、陰性對照、陽性對照,判定標準為:
空白對照:以ddH2O為模板,按照所述實時熒光PCR反應體系和所述實時熒光PCR反應條件,進行實時熒光PCR反應,檢測Ct值大于或等于40;
陰性對照:以非蝦夷扇貝物種基因組DNA為模板,按所述實時熒光PCR反應體系和所述實時熒光PCR反應條件,進行實時熒光PCR反應,檢測Ct值大于或等于40;
陽性對照:以蝦夷扇貝物種基因組DNA為模板,按所述實時熒光PCR反應體系和所述實時熒光PCR反應條件,進行實時熒光PCR反應,檢測Ct值小于或等于30;
待測樣品蝦夷扇貝基因檢測Ct值大于等于40,陰性對照、陽性對照和空白對照結果正常者,判定該樣品未檢出蝦夷扇貝基因;待測樣品蝦夷扇貝基因檢測Ct值小于等于36,陰性對照、陽性對照和空白對照結果正常者,判定該樣品檢出蝦夷扇貝基因;待測樣品蝦夷扇貝基因檢測Ct值在36~40之間,重做實時熒光PCR擴增,再次擴增后結果Ct值大于40且陰性對照、陽性對照和空白對照結果正常,判定該樣品未檢出蝦夷扇貝基因;再次擴增后結果Ct值仍小于40且陰性對照、陽性對照和空白對照結果正常,判定該樣品檢出蝦夷扇貝基因。
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