[發明專利]基于BD單細胞轉錄組測序數據的分析方法、裝置及設備

在審

• 申請號: 202011177914.7
• 申請日: 2020-10-29
• 公開（公告）號: CN112270953A
• 公開（公告）日: 2021-01-26
• 發明（設計）人: 劉志巖;郭方;劉珍;鄭青松
• 申請（專利權）人: 哈爾濱因極科技有限公司
• 主分類號: G16B20/20
• 分類號: G16B20/20;G16B25/10;G06K9/62
• 代理公司: 深圳中細軟知識產權代理有限公司 44528
• 代理人: 孫凱樂

本發明實施例公開了一種基于BD單細胞轉錄組測序數據的分析方法、裝置及設備，包括：獲取BD單細胞轉錄組測序的樣本池，所述樣本池中包括多個樣本；根據樣本標簽將所述樣本池中的樣本進行拆分，獲取每個樣本的細胞測序數據；對所述細胞測序數據進行特征提取，所述特征包括：UMIs序列；基于基因在每個細胞中的UMIs數目，計算得到每個細胞的基因表達向量；根據每個細胞的基因表達向量進行細胞聚類，根據聚類結果將細胞進行分群，每個細胞群對應一個類別；針對不同的細胞群進行差異基因分析，并將分析得到的差異基因進行可視化展示。該分析方法具有完整的分析流程，有利于準確地識別差異基因。

技術領域

本發明涉及基因分析技術領域，尤其涉及一種基于BD單細胞轉錄組測序數據的分析方法、裝置、計算機設備及存儲介質。

背景技術

BD單細胞轉錄組是在單個細胞水平對mRNA進行高通量測序的一項新技術，將多細胞生物分離的單個細胞中微量的轉錄組mRNA通過高效擴增后再進行高通量測序，BD單細胞轉錄組測序能夠有效解決組織樣本無法破解的細胞異質性問題，有助于發現新的稀有細胞類型，并深入了解發育過程中的表達調控機制反映細胞間的異質性，在腫瘤、發育生物學、微生物學、神經科學等領域發揮重要作用，正成為生命科學研究的焦點。

BD單細胞轉錄組測序技術的實施主要分兩部分，一是實驗樣本建庫測序，二是測序數據的生物信息分析。目前實驗樣本建庫測序主要依靠BD平臺和測序平臺完成，而對實驗數據的分析主要依靠測序數據的生物信息分析，目前生物信息分析技術尚未有完整的分析方法，即使有，但分析流程過于簡單，導致不能很好地識別差異基因。

發明內容

基于此，有必要針對上述問題，提出一種基于BD單細胞轉錄組測序數據的分析方法、裝置、計算機設備及存儲介質，該分析方法具有完整的分析流程，有利于準確地識別差異基因。

一種基于BD單細胞轉錄組測序數據的分析方法，包括：

獲取BD單細胞轉錄組測序的樣本池，所述樣本池中包括多個樣本；

根據樣本標簽將所述樣本池中的樣本進行拆分，獲取每個樣本的細胞測序數據；

對所述細胞測序數據進行特征提取，所述特征包括：UMIs序列；

基于基因在每個細胞中的UMIs數目，計算得到每個細胞的基因表達向量；

根據每個細胞的基因表達向量進行細胞聚類，根據聚類結果將細胞進行分群，每個細胞群對應一個類別；

針對不同的細胞群進行差異基因分析，并將分析得到的差異基因進行可視化展示。

一種基于BD單細胞轉錄組測序數據的分析裝置，包括：

獲取模塊，用于獲取BD單細胞轉錄組測序的樣本池，所述樣本池中包括多個樣本；

拆分模塊，用于根據樣本標簽將所述樣本池中的樣本進行拆分，獲取每個樣本的細胞測序數據；

提取模塊，用于對所述細胞測序數據進行特征提取，所述特征包括：UMIs序列；計算模塊，用于基于基因在每個細胞中的UMIs數目，計算得到每個細胞的基因表達向量；

聚類模塊，用于根據每個細胞的基因表達向量進行細胞聚類，根據聚類結果將細胞進行分群，每個細胞群對應一個類別；

分析模塊，用于針對不同的細胞群進行差異基因分析，并將分析得到的差異基因進行可視化展示。

一種計算機設備，包括存儲器和處理器，所述存儲器存儲有計算機程序，所述計算機程序被所述處理器執行時，使得所述處理器執行以下步驟：

獲取BD單細胞轉錄組測序的樣本池，所述樣本池中包括多個樣本；

根據樣本標簽將所述樣本池中的樣本進行拆分，獲取每個樣本的細胞測序數據；