[發明專利]用于鑒定尖孢鐮刀菌番茄頸腐根腐病的分子標記及其應用

有效

• 申請號: 202011145147.1
• 申請日: 2020-10-23
• 公開（公告）號: CN112176090B
• 公開（公告）日: 2022-06-10
• 發明（設計）人: 王輝;王富;王宇;朱文瑩;李文麗
• 申請（專利權）人: 青島農業大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/04;C12N15/11
• 代理公司: 青島合創知識產權代理事務所(普通合伙) 37264
• 代理人: 王曉曉

本發明公開了用于鑒定尖孢鐮刀菌番茄頸腐根腐病的分子標記及其應用。所述分子標記FrlDel30?1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其為鑒定尖孢鐮刀菌番茄頸腐根腐專化型的分子標記；所述分子標記FrlDel30?2的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，其為鑒定尖孢鐮刀菌番茄枯萎病致病菌生理小種3型的分子標記，并且用于檢測分子標記的引物對包括FrlDel30F：5’?GAGCGGGAGTTGAATTCTTG?3’；FrlDel30R：5’?AAGAGCCTGCTCCA GTTGAA?3’。本發明的分子標記能夠簡答、快速準確的區分尖孢鐮刀菌番茄頸腐根腐病專化型菌株及尖孢鐮刀菌番茄枯萎病致病菌生理小種3型病菌，其對于感病番茄中尖孢鐮刀菌的類型的鑒定以及感病番茄發病部位或組織的檢測具有重要的作用。

技術領域

本發明屬于分子標記技術領域，具體涉及用于鑒定尖孢鐮刀菌番茄頸腐根腐病的分子標記及其應用。

背景技術

由尖孢鐮刀菌引起的番茄頸腐根腐病（Fusarium Crown and Root Rot, FCRR），俗稱“死棵病”，是繼根結線蟲病、黃化曲葉病毒病等毀滅性病害爆發后的另一種極具破壞性的番茄主要病害。番茄頸腐根腐病尤其對我國設施番茄的安全生產造成嚴重威脅，其中日光溫室番茄發病率能夠達80%以上，致死率達30%以上。據報道，目前至少有120種尖孢鐮刀菌專化型和尖孢鐮刀菌生理小種，而引起番茄FCRR的病原菌主要為尖孢鐮刀菌番茄頸腐根腐專化型（Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici，Forl）。我國對番茄FCRR研究相對較少，特別是針對該病害的病原菌的鑒定尚未有十分明確的方法，這限制了番茄抗病材料的篩選和利用。尖孢鐮刀菌番茄頸腐根腐專化型與枯萎病生理小種3在表型上非常接近而難以辨別，主要依賴于對特殊寄主的致病性或較窄的寄主范圍來區分和鑒定，而且目前尚未有公認的Forl的鑒別寄主材料，這使得傳統接種鑒定方法不能明確尖孢鐮刀菌番茄頸腐根腐轉化型。

分子標記技術已被廣泛用于植物病原真菌的相關研究，為鑒定和檢測病原菌提供了很好的基礎。近年來，許多分子標記成功地應用在多種植物病原真菌的病原鑒定和診斷中，如香蕉枯萎病生理小種、尖孢鐮刀菌菠菜專化型、黃瓜專化型、絲瓜專化型、苦瓜專化型等。但依據目前現有的鑒別方法或鑒定特異引物，鑒定結果多為陰性或在技術上還存在缺陷，因此現在更需要開發更加高效、穩定的，能夠準確鑒別檢測番茄頸腐根腐病致病菌的分子標記。

發明內容

本發明提供了用于鑒定尖孢鐮刀菌番茄頸腐根腐病的分子標記及其應用。所述的分子標記能夠準確鑒定出番茄頸腐根腐病病菌，并將其應用到鑒別感病番茄中尖孢鐮刀菌病原菌類型中以及檢測感病番茄發病部位。

為實現上述發明目的，本發明采用以下技術方案予以實現：

本發明提供了用于鑒定尖孢鐮刀菌番茄頸腐根腐病的分子標記FrlDel30-1，所述分子標記FrlDel30-1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。

進一步的，所述分子標記FrlDel30-1為鑒定尖孢鐮刀菌番茄頸腐根腐專化型的分子標記。

進一步的，所述分子標記FrlDel30-1的長度為204bp。

本發明還提供了用于鑒定尖孢鐮刀菌番茄頸腐根腐病的分子標記FrlDel30-2，所述分子標記FrlDel30-2的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。

進一步的，所述分子標記FrlDel30-2為鑒定尖孢鐮刀菌番茄枯萎病致病菌生理小種3型的分子標記。

進一步的，所述分子標記FrlDel30-2的長度為234bp。

進一步的，所述分子標記FrlDel30-1或所述分子標記FrlDel30-2為InDel類型。