[發明專利]一種SSR引物組及其應用

在審

• 申請號: 202011144623.8
• 申請日: 2020-10-23
• 公開（公告）號: CN112080581A
• 公開（公告）日: 2020-12-15
• 發明（設計）人: 徐德林;鄧寬平;陳榮輝;張宏揚;楊丹;周超;史軍華
• 申請（專利權）人: 遵義醫科大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/11;G16B40/00
• 代理公司: 北京高沃律師事務所 11569
• 代理人: 瞿曉晶

1.一種SSR引物組，其特征在于，所述SSR引物組包括22對SSR引物：Rubus166b、Rubus1b、Rubus105b、Rubus153a、Rubus25a、Rubus223a、Rubus22a、Rubus167a、Rubus253a、Rubus24a、Rubus110a、Rubus260a、ZA005、ZA004、Rubus263f、Rubus279a、Rubus285a、Rubusr56a、Rubus45c、Rubusr35a、Rubusr19a和Rubus243a；所述Rubus166b的引物對的核苷酸序列分別如SEQ ID NO.1和2所示；所述Rubus1b的引物對的核苷酸序列分別如SEQ IDNO.3和4所示；所述Rubus105b的引物對的核苷酸序列分別如SEQ ID NO.5和6所示；所述Rubus153a的引物對的核苷酸序列分別如SEQ ID NO.7和8所示；所述、Rubus25a的引物對的核苷酸序列分別如SEQ ID NO.9和10所示；所述Rubus223a的引物對的核苷酸序列分別如SEQ ID NO.11和12所示；所述Rubus22a的引物對的核苷酸序列分別如SEQ ID NO.13和14所示；所述Rubus167a的引物對的核苷酸序列分別如SEQ ID NO.15和16所示；所述Rubus253a的引物對的核苷酸序列分別如SEQ ID NO.17和18所示；所述Rubus24a的引物對的核苷酸序列分別如SEQ ID NO.19和20所示；所述Rubus110a的引物對的核苷酸序列分別如SEQ IDNO.21和22所示；所述Rubus260a的引物對的核苷酸序列分別如SEQ ID NO.23和24所示；所述ZA005的引物對的核苷酸序列分別如SEQ ID NO.25和26所示；所述ZA004的引物對的核苷酸序列分別如SEQ ID NO.27和28所示；所述Rubus263f的引物對的核苷酸序列分別如SEQID NO.29和30所示；所述Rubus279a的引物對的核苷酸序列分別如SEQ ID NO.31和32所示；所述、Rubus285a的引物對的核苷酸序列分別如SEQ ID NO.33和34所示；所述Rubusr56a的引物對的核苷酸序列分別如SEQ ID NO.35和36所示；所述Rubus45c的引物對的核苷酸序列分別如SEQ ID NO.37和38所示；所述Rubusr35a的引物對的核苷酸序列分別如SEQ IDNO.39和40所示；所述Rubusr19a的引物對的核苷酸序列分別如SEQ ID NO.41和42所示；所述Rubus243a的引物對的核苷酸序列分別如SEQ ID NO.43和44所示。

2.權利要求1所述SSR引物組在樹莓種質資源鑒定中的應用。

3.權利要求1所述SSR引物組在樹莓品系鑒別中的應用。

4.權利要求1所述SSR引物組在樹莓遺傳多樣性分析中的應用。

5.權利要求1所述SSR引物組在樹莓分子輔助育種中的應用。

6.根據權利要求1～5任一項所述的應用，其特征在于，所述應用包括以下步驟：

1)提取樹莓基因組DNA；

2)以步驟1)得到的樹莓基因組DNA為模板，分別利用權利要求1所述SSR引物組中的引物對進行PCR擴增，得到擴增產物；

3)將步驟2)得到的擴增產物分別進行電泳分離，根據擴增條帶的多態性進行標記和處理、分析。

7.根據權利要求6所述的應用，其特征在于，所述電泳包括非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳。

8.根據權利要求7所述的應用，其特征在于，所述電泳為利用8％非變性聚丙烯酰胺凝膠進行電泳分離，150V 90min。

9.根據權利要求6所述的應用，其特征在于，所述處理的方法包括：對擴增條帶的多態性進行標記后，以擴增條帶的出現頻率及大小為參考進行人工讀帶，有帶記為“1”，條帶不清或缺失記為“0”，以此建立原始(0,1)矩陣。

10.根據權利要求6或9所述的應用，其特征在于，所述分析包括：根據原始(0,1)矩陣的結果，利用NTsys2.10e軟件得出樣品之間的遺傳相似系數和upgma聚類圖，進而得出樣品之間的遺傳關系，實現種質資源鑒定多樣性分析和分子育種。