[發(fā)明專利]一種鑒定西瓜種質(zhì)真實(shí)性的SNP位點(diǎn)引物組合及應(yīng)用有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 202011134940.1 | 申請日： | 2020-10-21 |
| 公開（公告）號： | CN112080497B | 公開（公告）日： | 2021-04-27 |
| 發(fā)明（設(shè)計）人： | 溫常龍;許勇;楊靜靜;張建;張曉飛;趙泓;王超;羅江 | 申請（專利權(quán)）人： | 北京市農(nóng)林科學(xué)院 |
| 主分類號： | C12N15/11 | 分類號： | C12N15/11;C12Q1/6895;C12Q1/6869;C12Q1/6858 |
| 代理公司： | 北京五洲洋和知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 11387 | 代理人： | 劉春成;榮紅穎 |
| 地址： | 100097 *** | 國省代碼： | 北京;11 |
| 權(quán)利要求書： | 查看更多 | 說明書： | 查看更多 |
| 摘要： | |||
| 搜索關(guān)鍵詞： | 一種 鑒定 西瓜 種質(zhì) 真實(shí)性 snp 引物 組合 應(yīng)用 | ||
1.鑒定西瓜種質(zhì)資源真實(shí)性的核心SNP組合，所述SNP組合由如下第一SNP位點(diǎn)到第三十二SNP位點(diǎn)組成：
第一SNP位點(diǎn)，所述第一SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第1染色體第4526336位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為A或G；
第二SNP位點(diǎn)，所述第二SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第1染色體第23878795位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為G或A；
第三SNP位點(diǎn)，所述第三SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第1染色體第28158005位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為G或C；
第四SNP位點(diǎn)，所述四第SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第2染色體第16364441位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為T或G；
第五SNP位點(diǎn)，所述第五SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第3染色體第86105位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為C或T；
第六SNP位點(diǎn)，所述第六SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第3染色體第9256863位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為C或T；
第七SNP位點(diǎn)，所述第七SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第3染色體第23275656位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為T或C；
第八SNP位點(diǎn)，所述第八SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第4染色體第17907037位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為G或A；
第九SNP位點(diǎn)，所述第九SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第4染色體第21912721位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為T或C；
第十SNP位點(diǎn)，所述第十SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第5染色體第13129098位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為T或C；
第十一SNP位點(diǎn)，所述第十一SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第5染色體第13782320位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為T或C；
第十二SNP位點(diǎn)，所述第十二SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第5染色體第31499847位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為A或G；
第十三SNP位點(diǎn)，所述第十三SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第5染色體第34817034位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為C或T；
第十四SNP位點(diǎn)，所述第十四SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第6染色體第23082328位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為A或G；
第十五SNP位點(diǎn)，所述第十五SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第6染色體第25600073位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為T或C；
第十六SNP位點(diǎn)，所述第十六SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第6染色體第29181381位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為A或G；
第十七SNP位點(diǎn)，所述第十七SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第7染色體第18367106位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為C或G；
第十八SNP位點(diǎn)，所述第十八SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第7染色體第26651873位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為T或C；
第十九SNP位點(diǎn)，所述第十九SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第7染色體第29557232位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為T或C；
第二十SNP位點(diǎn)，所述第二十SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第8染色體第5677147位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為G或A；
第二十一SNP位點(diǎn)，所述第二十一SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第8染色體第9651210位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為A或G；
第二十二SNP位點(diǎn)，所述第二十二SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第8染色體第13297080位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為C或T；
第二十三SNP位點(diǎn)，所述第二十三SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第9染色體第7240244位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為A或G；
第二十四SNP位點(diǎn)，所述第二十四SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第9染色體第21279593位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為T或C；
第二十五SNP位點(diǎn)，所述第二十五SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第9染色體第21714653位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為G或A；
第二十六SNP位點(diǎn)，所述第二十六SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第9染色體第31408858位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為T或G；
第二十七SNP位點(diǎn)，所述第二十七SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第10染色體第15398308位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為A或G；
第二十八SNP位點(diǎn)，所述第二十八SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第10染色體第31904564位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為A或G；
第二十九SNP位點(diǎn)，所述第二十九SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第10染色體第32423039位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為A或T；
第三十SNP位點(diǎn)，所述第三十SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第11染色體第1426039位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為C或T；
第三十一SNP位點(diǎn)，所述第三十一SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第11染色體第7206213位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為C或T；
第三十二SNP位點(diǎn)，所述第三十二SNP位點(diǎn)位于西瓜參考基因組第11染色體第24910574位，或其種質(zhì)資源間同源基因組片段上的相應(yīng)位點(diǎn)，該位點(diǎn)的核苷酸堿基為T或C；
其中，所述西瓜參考基因組為97103 V2西瓜參考基因組。
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