[發明專利]一種用于鑒別高齡個體的生物種群標志物及其獲得方法和應用

有效

• 申請號: 202011133628.0
• 申請日: 2020-10-21
• 公開（公告）號: CN112410443B
• 公開（公告）日: 2023-08-25
• 發明（設計）人: 秦環龍;許謙
• 申請（專利權）人: 上海市第十人民醫院
• 主分類號: C12Q1/689
• 分類號: C12Q1/689;C12Q1/10;C12Q1/06;G16B30/10;C12R1/19;C12R1/01
• 代理公司: 上海申新律師事務所 31272
• 代理人: 郎祺

本發明涉及一種用于鑒別高齡個體的生物種群標志物，所述生物種群標志物包括：大腸桿菌Escherichia?coli、昂氏另枝菌Alistipes?onderdonkii、沙氏另枝菌Alistipes?shahii、梵氏另枝菌Alistipes?finegoldii、另枝菌Alistipes_sp_AP11、糞擬桿菌Bacteroides?caccae、內臟臭氣桿菌Odoribacter?splanchnicus、魚腥味錐形桿菌Pyramidobacter?piscolens、戈氏副擬桿菌Parabacteroides?goldsteinii和偽小球菌Subdoligranulum_sp_4_3_54A2FAA。本發明的生物種群標志物是發明人通過對高齡個體和非高齡個體(其健康子女或年齡相當的健康個體)的糞便樣本中各種腸道微生物豐度的差異比較分析以及驗證而確定下來的，利用所述生物種群標志物能夠確定個體處于超高齡狀態的概率。

技術領域

本發明涉及生物標志物技術領域，尤其涉及一種用于鑒別高齡個體的生物種群標志物及其獲得方法和應用。

背景技術

隨著社會經濟的發展，中國人的預期壽命穩步增加，老年人比例不斷升高。老年人群中往往有較高的幾率發生多種亞健康狀態，如衰弱(frailty)與炎性衰老(inflammaging)，因此，提升老年人的健康水平，從而促進他們的社會經濟參與已經成為當代的一項重要課題。在改善老年人亞健康狀態的各種選項中，微生態方法是一種相對溫和、侵入性低、風險小的干預手段，但這需要對有關人群、特別是高齡老人的菌群特征及其它相關因素進行全面深入的研究。高齡的相關性因子包括遺傳、社會經濟、環境等大類，同時越來越多的證據表明腸道菌群與高齡密切相關。腸道微生物對于腸道上皮細胞起到重要作用，包括形成微生物屏障防止病原菌定植、參與免疫調節及代謝功能。有研究表明腸道菌群失衡會通過不同形式導致機體的損傷，病原微生物會通過激活識別受體、吸附、分泌腸毒素或侵入等方式引起腸道炎癥反應。腸道微生物數量、結構及穩定性的改變，尤其是菌群的失衡會改變正常的生理功能從而引發腸道疾病，從而影響健康乃至預期壽命。

我們的高齡老人宏基因組研究表明與對照組相比，高齡個體的腸道菌群特征呈現總體的惡化趨勢，明顯的特征包括大腸桿菌的增加、兩個主要益生菌普氏棲糞桿菌Faecalibacterium?prausnitzii與長雙歧桿菌Bifidobacteriumlongum的下降、以及功能元件中脂多糖(lipolysaccharide)合成通路和陰離子抗菌肽(Cationic?antimicrobialpeptide)抗性通路的上升。因此，我們推測在高齡個體中高度富集的微生物中，多個種株與老年人的亞健康狀態有著密切關聯。由此，高齡菌群標志物并不僅僅提供了一個超高齡個體的鑒別手段，也可以產生針對炎性衰老的微生態診斷干預制劑。

發明內容

本發明的目的是針對現有技術中的不足，提供一種用于鑒別高齡個體的生物種群標志物及其獲得方法和鑒別方法。

為實現上述目的，本發明采取的技術方案是：

本發明的第一方面是提供一種用于鑒別高齡個體的生物種群標志物，所述生物種群標志物包括：

大腸桿菌Escherichia?coli、昂氏另枝菌Alistipes?onderdonkii、沙氏另枝菌Alistipes?shahii、梵氏另枝菌Alistipes?finegoldii、另枝菌Alistipes_sp_AP11、糞擬桿菌Bacteroides?caccae、內臟臭氣桿菌Odoribacter?splanchnicus、魚腥味錐形桿菌Pyramidobacter?piscolens、戈氏副擬桿菌Parabacteroides?goldsteinii和偽小球菌Subdoligranulum_sp_4_3_54A2FAA；