[發(fā)明專利]使用熒光PCR技術(shù)篩查和鑒定Ph樣ALL相關(guān)融合基因的引物及探針、組合物和方法

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 202011121074.2
• 申請日: 2020-10-19
• 公開（公告）號: CN112143812A
• 公開（公告）日: 2020-12-29
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 鄒媛;杜翠;董越;張辰
• 申請（專利權(quán)）人: 杭州艾迪康醫(yī)學(xué)檢驗中心有限公司
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12Q1/686;C12N15/11
• 代理公司: 浙江杭州金通專利事務(wù)所有限公司 33100
• 代理人: 黃素萍;徐關(guān)壽

1.用多重?zé)晒釶CR技術(shù)篩查及鑒定ETV6-ABL1、NUP214-ABL1、EML1-ABL1、RANBP2-ABL1、RCSD1-ABL1、SNX2-ABL1、ZMIZ1-ABL1、FOXP1-ABL1、SFPQ-ABL1、PAG1-ABL2、RCSD1-ABL2、ZC3HAV1-ABL2、EBF1-PDGFRB、TNIP1-PDGFRB、SSBP2-PDGFRB、ZEB2-PDGFRB、ATF7IP-PDGFRB、ZMYND8-PDGFRB、SSBP2-CSF1R、TBL1XR1-CSF1R、MEF2D-CSF1R、ETV6-JAK2、BCR-JAK2、EBF1-JAK2、SSBP2-JAK2、PAX5-JAK2、STRN3-JAK2、TERF2-JAK2、ATF7IP-JAK2、TPR-JAK2、P2RY8-CRLF2、IQGAP2-TSLP、MYH9-IL2RB、MYB-TYK2和ETV6-NTRK3共35種Ph-like ALL相關(guān)融合基因的引物及探針，所述引物和探針的核苷酸序列如下：

ABL1-A2R：5'-TCCAACGAGCGGCTTCAC-3'

ABL1-A2P：5'-FAM-TCAGCGGCCAGTAGCATCTGACTT-TAMRA-3'

ABL1-A3R：5'-TTTTGGTTTGGGCTTCACAC-3'

ABL1-A3P：5'-FAM-CTCCGGGTCTTAGGCTATAATCAC-TAMRA-3'

ABL1-A4R：5'-CCGTTGAATGATGATGAACCA-3'

ABL1-A4P：5'-FAM-CCTCCGAGAGCCGCTTCAACACC-TAMRA-3'

ABL2-3R：5'-CTCCACCTGATAGCCTCATTT-3'

ABL2-3P：5'-FAM-CATCGTCCCTATGGTTGTGATGTTGAACC-TAMRA-3'

ABL2-5R：5'-CCACTGTGGAGTGATGGTGTA-3'

ABL2-5P：5'-FAM-ATGTGACTGCTGAGAGCCGCTTCAG-TAMRA-3'

PDFGRB-9R：5'-GGACTGTCTGTTCCCCACTGT-3'

PDFGRB-9P：5'-FAM-TCCGAGTGCTGGAGCTAAGTGAGAGC-TAMRA-3'

PDFGRB-11R：5'-AGGGAGATGATGGTGAGCAC-3'

PDFGRB-11P：5'-FAM-CCCTTTAAGGTGGTGGTGATCTCAGCCATC-TAMRA-3'

CSF1R-12R：5'-CGTGGGGTCGATGAAAGTATAA-3'

CSF1R-12P：5'-HEX-CCCAAGTACCAGGTCCGCTGGAAGAT-TAMRA-3'

JAK2-12R：5'-TGGTGAGGTTGGTACATCAGA-3'

JAK2-12P：5'-FAM-CACCATTCGTTCTGAAGACTAGAAGGTTTGA-TAMRA-3'

JAK2-17R：5'-CTCCATTTGTCTGTTGCCAAA-3'

JAK2-17P：5'-FAM-CAATGCATTCAGGTGGTACCCATGGTATTCT-TAMRA-3'

JAK2-19R：5'-GGTCTTCAAAGGCACCAGAAAA-3'

JAK2-19P：5'-FAM-CCAGGGCACCTATCCTCATATTTGGTAACAT-TAMRA-3'

CRLF2-R：5'-AGCCTCCCAGCAGAAAGAC-3'

TSLP-1R：5'-CTGAGATAGGCTGCTTTAATCT-3'

TSLP-1P：5'-HEX-GCCCTACAAGTTGTAAGATGAAGATTTTCCTGAAA-TAMRA-3'

TSLP-3R：5'-GGCAGCCTTAGTTTTCATGG-3'

TSLP-3P：5'-HEX-CACATTGCCTTACTGAAATCCAGAGCCTAAC-TAMRA-3'

IL2RB-2R：5'-ATGCCCAAGAGGTAGCCAG-3'

IL2RB-2P：5'-HEX-GCTTCCTTCCTCGGCTCCACCCTGTG-TAMRA-3'

TYK2-18R：5'-GCCTCTGGTAGAAATGCTCCT-3'

NTRK3-15R：5'-TGGTCGGGCTGAGGTTGTA-3'

NTRK3-15P：5'-HEX-GCACATTAAGAGGAGAGACATCGTGCTGAAGC-TAMRA-3'

NTRK3-15bR：5'-GGTAAGACACTTCCCCACTCTG-3'

NTRK3-15bP：5'-HEX-GGGTCTTTTCAAACATAGACAATCATGGGATAT-TAMRA-3'

ETV6-4F1：5'-CCACCCTGGAAACTCTATACACAC-3'

ETV6-5F1：5'-CTCTGTCTCCCCGCCTGAA-3'

ETV6-4F2：5'-CACAGCCGGAGGTCATACTG-3'

ETV6-5F2：5'-CCATGCCCATTGGGAGAAT-3'

NUP214-23F：5'-CCTTCCCACCCCATCTCA-3'

NUP214-28F：5'-TGGGATAATCACACCAACACC-3'

NUP214-29F：5'-GGGTTCAGCTTTTGCCAAG-3'

NUP214-31F：5'-CCAACAAAAACCCATTCAGC-3'

NUP214-34F：5'-GGACCCAGAGTAGCGGATTC-3'

EML1-17F：5'-TGGAAACGAACAGCTCTCTG-3'

RANBP2-18F：5'-GGACCAGACTCAGTGCCTGAT-3'

RCSD1-2F：5'-ATGTGGACAACTCGGCGTC-3'

RCSD1-3F：5'-AGACCTGGGCCAGAATGGT-3'

SNX2-3F：5'-TCTGCTCCCGTGATCTTTGA-3'

ZMIZ1-14F：5'-CAGCCAAGGGAATGTCAAC-3'

ZMIZ1-18F：5'-CTGCCCGCAGAGCACTGTAT-3'

FOXP1-19F：5'-CCTACTGCACACCTCTCAATGC-3'

SFPQ-9F：5'-GAAGCTAATCCTGGCGTTCC-3'

PAG1-8F：5'-GACCCCACTCTCACAGAAGAA-3'

ZC3HAV1-12F：5'-CCGTGCCTATGTGGAATCTAT-3'

SSBP2-10F：5'-AACCCAACAAATGCCAATTC-3'

SSBP2-16F：5'-CAAGGGATGATGGCGAAAT-3'

TBL1XR1-7F：5'-CCAAGCAACAAGGATGTCAC-3'

MEF2D-7F：5'-GGCAGGAAAGGGGTTAATG-3'

EBF1-14F：5'-ACCTTCCTCAACGGCTCAG-3'

EBF1-15F：5'-AGTCGTCAGACCCCAGACCT-3'

TNIP1-15F：5'-AAGCCCTCAGACAGCAGAAGA-3'

TNIP1-17F：5'-TCCCAAGTGATGGACCCTC-3'

ZEB2-9F：5'-CCCTTCTGCGACATAAATACG-3'

ATF7IP-13F：5'-GCAGGTCAATCCCCAAAA-3'

ZMYND8-17F：5'-AAACACTACTGGAAGCACAATAGC-3'

BCR-1F：5'-CTGGCCCAACGATGGCGA-3'

BCR-13F：5'-CATTCCGCTGACCATCAATAAG-3'

BCR-14F：5'-AGCCACTGGATTTAAGCAGAG-3'

PAX5-5F：5'-ACTCCATCAGCGGCATCCT-3'

STRN3-9F：5'-GAAGGTGCAAGAGCAGAGGA-3'

TERF2-8F：5'-TGGGTGGAAGAGGATGAACTG-3'

TPR-39F：5'-CAGGATTCTCAAGATTCCATTG-3'

P2RY8-F：5'-TACCTGGAGACCCTCTGAGC-3'

P2RY8-P：5'-FAM-CCTGCTACTTCTGCCGCTGCTTCTGC-TAMRA-3'

IQGAP2-1F：5'-CAGGATGCCACACGAAGAG-3'

MYH9-1F：5'-AAGCAAGGCTGACCTGCTG-3'

MYB-6F：5'-ATGGGTTTTGCTCAGGCTC-3'

MYB-6P：5'-HEX-CAACGACTATTCCTATTACCACATTTCTGAAGCA-TAMRA-3'。