[發(fā)明專利]一種與小麥穗發(fā)芽抗性相關(guān)的SNP分子標(biāo)記及其應(yīng)用有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 202011088002.2 | 申請日: | 2020-10-13 |
| 公開(公告)號: | CN112266973B | 公開(公告)日: | 2022-03-11 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 曹佳佳;常成;張海萍;盧杰;馬傳喜 | 申請(專利權(quán))人: | 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) |
| 主分類號: | C12Q1/6895 | 分類號: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 安徽匯樸律師事務(wù)所 34116 | 代理人: | 朱克儉 |
| 地址: | 230061 *** | 國省代碼: | 安徽;34 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 麥穗 發(fā)芽 抗性 相關(guān) snp 分子 標(biāo)記 及其 應(yīng)用 | ||
1.一種與小麥穗發(fā)芽抗性相關(guān)的SNP分子標(biāo)記,其特征在于,其SNP位點對應(yīng)于參考基因組IWGSC RefSeq v1.0版本的小麥4B染色體661498776bp處的C/T堿基突變。
2.一種根據(jù)權(quán)利要求1所述的SNP分子標(biāo)記開發(fā)的用于鑒定小麥抗穗發(fā)芽品種的CAPS標(biāo)記,其特征在于,所述CAPS標(biāo)記被命名為TaE3,所述TaE3的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示的核苷酸序列或者如SEQ ID NO.6所示。
3.一種使用權(quán)利要求2所述的CAPS標(biāo)記鑒定小麥抗穗發(fā)芽品種的方法,其特征在于,具體步驟如下:
S1、根據(jù)權(quán)利要求2所述的序列SEQ ID NO.5和序列SEQ ID NO.6設(shè)計特異性引物,根據(jù)權(quán)利要求2所述的序列SEQ ID NO.5和序列SEQ ID NO.6的差異挑選限制性內(nèi)切酶,使得序列SEQ ID NO.5和序列SEQ ID NO.6能夠被切割成不同數(shù)量的片段;
S2、提取待檢測的小麥基因組DNA;
S3、以步驟S2提取的DNA為模板,步驟S1設(shè)計的特異性引物為引物進行PCR擴增,得到PCR擴增產(chǎn)物;
S4、使用步驟S1挑選的限制性內(nèi)切酶對步驟S3獲得的PCR擴增產(chǎn)物進行酶切,并對酶切產(chǎn)物進行電泳檢測,根據(jù)條帶數(shù)判定小麥品種。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的CAPS標(biāo)記鑒定小麥抗穗發(fā)芽品種的方法,其特征在于,步驟S1中設(shè)計的特異性引物中的上游引物如SEQ ID NO.3所示核苷酸序列,下游引物如SEQ IDNO.4所示核苷酸序列。
5.根據(jù)權(quán)利要求3或4所述的CAPS標(biāo)記鑒定小麥抗穗發(fā)芽品種的方法,其特征在于,步驟S3中使用的限制性內(nèi)切酶為AccII,若步驟S4中的酶切產(chǎn)物的電泳條帶為一條則為感穗發(fā)芽品種,若為若干條則為抗穗發(fā)芽品種。
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