[發明專利]多模態的自動化腦室分割系統及其使用方法在審
| 申請號: | 202011062511.8 | 申請日: | 2020-09-30 |
| 公開(公告)號: | CN112200810A | 公開(公告)日: | 2021-01-08 |
| 發明(設計)人: | 夏軍;楊光;牛張明;江熒輝;葉晴昊;王旻皓 | 申請(專利權)人: | 深圳市第二人民醫院(深圳市轉化醫學研究院) |
| 主分類號: | G06T7/10 | 分類號: | G06T7/10;G06N3/04;G06K9/62 |
| 代理公司: | 上海智晟知識產權代理事務所(特殊普通合伙) 31313 | 代理人: | 張東梅 |
| 地址: | 518037 廣東省深*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 多模態 自動化 腦室 分割 系統 及其 使用方法 | ||
1.一種多模態的自動化腦室分割系統,其特征在于,包括:
收集模塊,被配置為收集已手動分割的厚層掃描數據集D1和未分割的薄層掃描數據集D2;
構建模塊,被配置為導入預訓練模型構建編碼器ER,通過亞像素卷積層構建解碼器DR,結合編碼器ER和解碼器DR構建多模態的腦室分割模型M;
監督模塊,被配置為使用厚層掃描數據集D1中的已分割信息生成監督信號S;
輸入模塊,被配置為將厚層掃描數據集D1及薄層掃描數據集D2作為輸入,提取特征F,和監督信號S一同,輸入解碼器DR;
損失函數模塊,被配置為聯合厚層掃描數據集D1產生的損失函數L1和薄層掃描數據集D2產生的損失函數L2,得到腦室分割模型M的損失函數L;
訓練模塊,被配置為根據損失函數L,不斷訓練優化腦室分割模型M;
分割模塊,被配置為使用訓練好的腦室分割模型M,對多模態不同掃描方法的腦部圖像進行自動分割。
2.如權利要求1所述的多模態的自動化腦室分割系統,其特征在于,厚層掃描數據集根據厚切圖片集合形成,厚切圖片集合為:
薄層掃描數據集根據薄切圖片集合形成,薄切圖片集合為:
3.如權利要求2所述的多模態的自動化腦室分割系統,其特征在于,構建編碼器ER包括:
利用在ImageNet數據集上預訓練的ResNet-34殘差神經網絡作為編碼器;
分別通過殘差模塊提取各個層的信息;
厚切圖片集合和薄切圖片集合作為輸入的提取特征F,將提取特征F分別輸入解碼器中。
4.如權利要求3所述的多模態的自動化腦室分割系統,其特征在于,對于解碼器,采用亞像素卷積層進行圖片的重建與恢復,其數學表達為:
FL=SP(WL*FL-1+bL)
其中SP(·)操作將形狀為H×W×C×r2的張量進行重新排列,使得其排列為形狀為rH×rW×C的張量,FL-1和FL是分別為該層的輸入特征和輸出特征,WL和bL為亞像素卷積的可訓練參數;
經過解碼器后,得到每個類別的預測概率。
5.如權利要求1所述的多模態的自動化腦室分割系統,其特征在于,采用厚切圖片集合和薄切圖片集合作為腦室分割模型的輸入,并加以厚切的標注信息作為監督信號,通過損失函數優化腦室分割模型,所述損失函數為:
其中λ是超參數,用于調節和的影響,ps和pt是腦室分割模型對于厚切圖片和薄切圖片的預測概率,均形狀為H×W×C的張量,其中C代表類別數量;是交叉熵損失函數,其形式為:
6.如權利要求5所述的多模態的自動化腦室分割系統,其特征在于,表示為薄切圖片的預測概率分布與均勻概率分布的距離,均勻概率分布為:
最小化使得預測概率的類別的區分性更大,隱式地將圖像特征推離決策邊界,使得兩個分布對齊;在數學上表示為:
其中C為類別數量。
7.如權利要求6所述的多模態的自動化腦室分割系統,其特征在于,采用皮爾遜χ2散度作為的具體表現形式,皮爾遜χ2散度的梯度表示為:
其梯度具有常數的增長率,不隨著變化而變化。
8.如權利要求7所述的多模態的自動化腦室分割系統,其特征在于,皮爾遜χ2散度為f(x)=x2-1。
9.一種多模態的自動化腦室分割系統的使用方法,其特征在于,包括:
收集模塊收集已手動分割的厚層掃描數據集D1和未分割的薄層掃描數據集D2;
構建模塊導入預訓練模型構建編碼器ER,通過亞像素卷積層構建解碼器DR,結合編碼器ER和解碼器DR構建多模態的腦室分割模型M;
監督模塊使用厚層掃描數據集D1中的已分割信息生成監督信號S;
輸入模塊將厚層掃描數據集D1及薄層掃描數據集D2作為輸入,提取特征F,和監督信號S一同,輸入解碼器DR;
損失函數模塊聯合厚層掃描數據集D1產生的損失函數L1和薄層掃描數據集D2產生的損失函數L2,得到腦室分割模型M的損失函數L;
訓練模塊根據損失函數L,不斷訓練優化腦室分割模型M;
分割模塊使用訓練好的腦室分割模型M,對多模態不同掃描方法的腦部圖像進行自動分割。
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