[發(fā)明專利]用于鑒定壇紫菜薄葉品系HR-5的InDel分子標記和方法

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 202011042739.0
• 申請日: 2020-09-28
• 公開（公告）號: CN112029895B
• 公開（公告）日: 2023-07-25
• 發(fā)明（設計）人: 費勤嬌;丁洪昌;嚴興洪
• 申請（專利權(quán)）人: 上海海洋大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 上海伯瑞杰知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 31227
• 代理人: 周一新

本發(fā)明公開了用于鑒定壇紫菜薄葉品系HR?5的InDel分子標記和方法，屬于植物分子生物學領(lǐng)域。本發(fā)明的InDel分子標記序列如SEQ?ID?NO:1所示，用于擴增該標記的引物InDel?3，其序列為F:ggggatggcagttttac；R:gaatcttcatttcgtggtg。方法如下：提取壇紫菜的絲狀體或葉狀體基因組DNA，使用InDel?3引物進行PCR擴增，擴增產(chǎn)物電泳檢測，若可檢測到一條長度為89bp的特異性條帶，則判斷該壇紫菜為HR?5品系。本方法只需一次簡單的PCR擴增和聚丙烯酰胺凝膠電泳即可鑒別HR?5品系，操作簡單，快速，不受環(huán)境因素影響。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于植物分子生物學領(lǐng)域，具有涉及一種用于鑒定壇紫菜薄葉品系 HR-5的InDel分子標記和方法。

背景技術(shù)

紫菜（ Pyropia/? Porphyra?spp.）因味道鮮美、營養(yǎng)價值高，被人們廣泛食用，在中日韓三國被大規(guī)模栽培。紫菜栽培不僅產(chǎn)生了較大的經(jīng)濟價值，而且對栽培海區(qū)的生態(tài)修復也具有重要效果。目前，在我國被大規(guī)模人工栽培的紫菜有溫水性的壇紫菜（ Pyropia?haitanensis）和偏冷水性的條斑紫菜（ Pyropia?yezoensis），前者主要被栽培在福建、浙江和廣東三省，后者被栽培于江蘇和山東二省。2017年，我國紫菜產(chǎn)業(yè)規(guī)模達72977?hm²,?年產(chǎn)量135251?t,?居世界首位，其中壇紫菜的產(chǎn)量約占全國紫菜總產(chǎn)量的78%。但它的產(chǎn)值卻與產(chǎn)量只占22％左右的條斑紫菜相當，其主要原因是兩種紫菜所適用的加工方式不同所致。

紫菜的藻體厚薄不僅制約著初級產(chǎn)品的加工方式，也影響了二次產(chǎn)品的附加值提升。條斑紫菜因藻體薄，適合于全自動機械化加工，初級產(chǎn)品經(jīng)二次精深加工后，可被制成高附加值的可用于制作壽司等的菜餅。壇紫菜則因藻體較厚，絕大部分被加工成價值低廉的初級餅菜進行銷售，無法再次加工成具有高附加值的二次產(chǎn)品。近年來，以厚度為選育目標，已選育出數(shù)個薄葉型的壇紫菜新品系，其中 HR-5品系的藻體厚度遠低于傳統(tǒng)的壇紫菜栽培種，且具有生長快、主要光合色素和色素蛋白含量高以及殼孢子放散量大等優(yōu)良特性（ Ding?HC,?Lv?F,?Wu?HX,?Yan?XH.?Selection?and?characterization?of?an?improved?strain?produced?by?interspecies?hybridization?between?Pyropia?sp.?from?India?and?Pyropia?haitanensis?from?China.?Aquaculture,?2018,?491:?177-183）。 HR-5品系的初步海區(qū)中試結(jié)果顯示，該品系適宜大規(guī)模的生產(chǎn)栽培，其鮮菜有望被二次深加工成具有較高附加值的產(chǎn)品（ Ding?HC,?Wang?TG,?Zhang?P,?Lu?YD,?Yan?XH.?High-temperature?resistance?of?the?thin-blade?strain?of?Pyropia?haitanensis?and?its?pilot?cultivation?in?mariculture?farm.?Journal?of?Applied?Phycology,?2020,?32:?2261-2270）。為了將 HR-5品系培育成一個可推廣的新品種，需要得到該品系的可靠特異性標記，用于種質(zhì)鑒定和產(chǎn)權(quán)保護。