[發明專利]分子特征的提取及三維定量構效關系的計算方法及裝置

在審

• 申請號: 202011025440.4
• 申請日: 2020-09-25
• 公開（公告）號: CN112185477A
• 公開（公告）日: 2021-01-05
• 發明（設計）人: 賈伯陽
• 申請（專利權）人: 北京望石智慧科技有限公司
• 主分類號: G16C20/20
• 分類號: G16C20/20;G06F17/16;G06N3/04
• 代理公司: 北京三聚陽光知識產權代理有限公司 11250
• 代理人: 李博洋

1.一種分子特征的提取方法，其特征在于，包括：

獲取分子的第一特征矩陣，所述第一特征矩陣用以表征所述分子的初始特征維度以及原子數目；

根據所述第一特征矩陣以及預設圖卷積神經網絡模型，生成所述分子的第二特征矩陣；所述第二特征矩陣用以表征所述分子的第一特征維度以及原子數目；

根據預設正方體像素模型以及所述第二特征矩陣，生成第三特征矩陣，所述第三特征矩陣用以表征所述分子中各原子在空間坐標系的坐標信息以及第一特征維度；

根據所述第三特征矩陣以及預設三維圖卷積神經網絡模型，生成第四特征矩陣，所述第四特征矩陣用以表征所述分子中各原子在空間坐標系的坐標信息以及第二特征維度；

根據所述第三特征矩陣以及所述第四特征矩陣，計算生成用以表征所述分子特征的第五特征矩陣；或

根據所述第四特征矩陣，計算生成用以表征所述分子特征的第五特征矩陣。

2.根據權利要求1所述的方法，其特征在于，所述獲取分子的第一特征矩陣，具體包括：

獲取分子中的多個原子及原子數目；

根據預設編碼方式將各原子編碼，生成各原子對應的編碼向量；

根據各編碼向量，確定分子的初始特征維度；

根據所述原子數目以及初始特征維度，確定所述分子的第一特征矩陣。

3.根據權利要求1所述的方法，其特征在于，所述根據預設正方體像素模型以及所述第二特征矩陣，生成第三特征矩陣的步驟中，包括：

將所述預設正方體像素模型劃分為多個三維像素；

當所述原子在所述三維像素的中心時，將所述原子填充至所述三維像素，并確定所述原子在空間坐標系的坐標信息。

4.根據權利要求1所述的方法，其特征在于，還包括：

根據第一維度參數確定所述第一特征維度，根據第二維度參數確定第二特征維度。

5.一種分子三維定量構效關系的計算方法，其特征在于，包括：

獲取分子的計算層次參數；

根據所述計算層次參數確定分子的目標特征矩陣，所述目標特征矩陣是通過多個計算單元生成的，所述計算單元用于執行如權利要求1-4任一項所述的分子特征的提取方法；

根據預設的全聯接層函數，將所述目標特征矩陣轉換為一維特征矩陣；

根據所述一維特征矩陣，計算生成所述分子的三維定量構效關系值。

6.一種分子特征的提取裝置，其特征在于，包括：

第一特征矩陣獲取模塊，用于獲取分子的第一特征矩陣，所述第一特征矩陣用以表征所述分子的初始特征維度以及原子數目；

第二特征矩陣獲取模塊，用于根據所述第一特征矩陣以及預設圖卷積神經網絡模型，生成所述分子的第二特征矩陣；所述第二特征矩陣用以表征所述分子的第一特征維度以及原子數目；

第三特征矩陣獲取模塊，用于根據預設正方體像素模型以及所述第二特征矩陣，生成第三特征矩陣，所述第三特征矩陣用以表征所述分子中各原子在空間坐標系的坐標信息以及第一特征維度；

第四特征矩陣獲取模塊，用于根據所述第三特征矩陣以及預設三維圖卷積神經網絡模型，生成第四特征矩陣，所述第四特征矩陣用以表征所述分子中各原子在空間坐標系的坐標信息以及第二特征維度；

第五特征矩陣獲取模塊，用于根據所述第三特征矩陣以及所述第四特征矩陣，計算生成用以表征所述分子特征的第五特征矩陣；或根據所述第四特征矩陣，計算生成用以表征所述分子特征的第五特征矩陣。

7.一種分子三維定量構效關系的計算裝置，其特征在于，包括：

計算層次參數獲取模塊，用于獲取分子的計算層次參數；

目標特征矩陣確定模塊，用于根據所述計算層次參數確定分子的目標特征矩陣，所述目標特征矩陣是通過多個計算單元生成的，所述計算單元用于執行如權利要求1-4任一項所述的分子特征的提取方法；

轉換模塊，用于根據預設的全聯接層函數，將所述目標特征矩陣轉換為一維特征矩陣；

計算模塊，用于根據所述一維特征矩陣，計算生成所述分子的三維定量構效關系值。