[發明專利]檢測腫瘤生物標志物的探針庫、方法及試劑盒在審
| 申請號： | 202011024931.7 | 申請日： | 2020-09-25 |
| 公開（公告）號： | CN112176058A | 公開（公告）日： | 2021-01-05 |
| 發明（設計）人： | 許明炎;陳實富;張曉妮;周衍慶 | 申請（專利權）人： | 深圳市海普洛斯生物科技有限公司 |
| 主分類號： | C12Q1/6886 | 分類號： | C12Q1/6886;C12N15/11;C40B40/06;C12Q1/6827 |
| 代理公司： | 深圳舍穆專利代理事務所(特殊普通合伙) 44398 | 代理人： | 黃賢炬 |
| 地址： | 518000 廣東省深圳市高新*** | 國省代碼： | 廣東;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 檢測 腫瘤 生物 標志 探針 方法 試劑盒 | ||
1.一種檢測腫瘤生物標志物的探針庫，所述腫瘤生物標志物包括腫瘤突變負荷和微衛星不穩定性，所述探針庫包括多條捕獲探針，其特征在于：包括針對人類全外顯子的蛋白編碼區設計的野生型探針、針對插入和/或缺失突變位點設計的野生型探針、針對第一特定基因的全長序列設計的野生型探針、針對第二特定基因的突變位點設計的突變型探針以及針對微衛星不穩定性位點設計的野生型探針，所述第一特定基因包括EGFR、MET、ERBB2、BRCA1、BRCA2、MSH2、MSH6、MLH1、PMS2和AR，所述插入和/或缺失突變位點包括表a所示的位點，所述第二特定基因包括如表b所示的基因，所述微衛星不穩定性位點包括NR21、NR25、NR27、BAT25和BAT26，并且在所述多條捕獲探針的上游設置有第一附加序列，在所述多條捕獲探針的下游設置有與所述第一附加序列不同的第二附加序列，所述第一附加序列和所述第二附加序列均具有與通用引物結合的位點。
表a
表b
AKT1 AKT2 AKT3 ALK APC ARAF ATM BCL2L11 BMPR1A BRAF BRCA BRCA2 BRIP CCND1 CCND CCND3 CCNE1 CDK4 CDK6 CDKN1B CHEK1 CHEK2 CTNNB1 DDR2 EGFR ERBB2 ERBB3 CDKN2A EPCAM ERCC3 FANCA FBXW7 FGFR FGFR2 FGFR FOXA1 GNA1 GNAQ HDAC HRAS IGF1R JAK1 JAK JAK3 KIT KRAS MAP2K MAP2K2 MAPK1 MDM MET MLH1 MRE11A MSH2 MSH6 MTOR MYC NBN NF NOTCH1 NRAS NRG1 NTRK1 NTRK2 NTRK3 PALB2 PDGFRA PDGFRB PIK3CA PMS2 POLD1 POLE PTCH1 PTEN RAD51 RAD51C RAD51D RAF1 RB1 RET RICTOR RIT1 ROS1 SMAD4 SMARCA4 SMO STK11 TP53 TSC1 TSC2
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