[發明專利]一種基于GLRX3基因檢測豬產活仔數和仔豬出生窩重的方法及應用

在審

• 申請號: 202011010450.0
• 申請日: 2020-09-23
• 公開（公告）號: CN114250305A
• 公開（公告）日: 2022-03-29
• 發明（設計）人: 唐中林;賀婕妤;易國強;楊亞嵐
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院農業基因組研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 北京康思博達知識產權代理事務所(普通合伙) 11426
• 代理人: 潘煒;范國鋒

1.一種用于評估豬產活仔數和仔豬出生窩重的SNP標記，其特征在于，所述SNP標記在GLRX3基因內，位于國際豬基因組10.2版本參考序列14號染色體第151,219,997核苷酸處，具有T/C多態性。

2.根據權利要求1所述的SNP標記，其特征在于，所述位于國際豬基因組10.2版本參考序列14號染色體第151,219,997核苷酸處的SNP標記的等位基因為C和T，包括兩種基因型，分別為CC和TC，

所述SNP標記的基因型為TC的豬個體相較于該SNP位點的基因型為CC的豬個體，具有較高的產活仔數和較高的仔豬出生窩重。

3.根據權利要求2所述的SNP標記，其特征在于，所述SNP標記采用試劑盒進行基因分型，所述試劑盒包括PCR擴增引物和單堿基延伸引物，

所述PCR擴增引物為P1和P2，其核苷酸序列分別如SEQ ID NO：2和SEQ ID NO：3所示；

所述單堿基延伸引物為P3、P4和P5，其核苷酸序列分別如SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5和SEQ ID NO：6所示。

4.一種用于檢測權利要求1至3之一所述SNP標記的引物對，其特征在于，所述引物對包括引物P6和引物P7，

引物P6包括如SEQ ID NO：7所示的核苷酸序列；

引物P7包括如SEQ ID NO：8所示的核苷酸序列。

5.一種權利要求1至3之一所述的SNP標記或權利要求4所述的引物對在豬選育中的用途。

6.根據權利要求5所述的用途，其特征在于，所述豬為杜洛克豬、長白豬和約克夏豬中的一種或多種。

7.一種檢測豬產活仔數和仔豬出生窩重的方法，其特征在于，所述方法包括檢測豬GLRX3基因內、位于國際豬基因組10.2版本參考序列14號染色體第151,219,997核苷酸處的SNP標記的多態性或基因型的步驟。

8.根據權利要求7所述的方法，其特征在于，所述方法包括以下步驟：

步驟1，提取待測豬的基因組DNA；

步驟2，以基因組DNA為模板，進行PCR擴增；

步驟3，確定待測豬與產活仔數和仔豬出生窩重相關的SNP標記的基因型；

步驟4，根據基因型確定豬的產活仔數和仔豬出生窩重。

9.一種預測豬產活仔數和仔豬出生窩重的系統，其特征在于，所述系統包括依次連接的擴增單元、測序單元和預測單元，其中，

擴增單元，用于對待測豬的基因組DNA進行擴增；

測序單元，用于對擴增產物進行測序，確定SNP標記的多態性或基因型；

預測單元，用于根據SNP標記預測豬的產活仔數和仔豬出生窩重。

10.一種豬選育系統，其特征在于，所述系統包括：

候選豬獲取單元，用于提供多頭候選豬；

性狀預測單元，用于預測豬產活仔數和仔豬出生窩重；

培育單元，用于根據性狀預測單元的預測結果選育產活仔數和仔豬出生窩重高的候選豬。