[發明專利]一種鑒定或輔助鑒定豬生長性狀的方法及其相關SNP標記

在審

• 申請號: 202010984206.8
• 申請日: 2020-09-18
• 公開（公告）號: CN114196760A
• 公開（公告）日: 2022-03-18
• 發明（設計）人: 唐中林;朱敏;易國強;王斌虎
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院農業基因組研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 王灝增

本發明公開了一種鑒定或輔助鑒定豬生長性狀的方法及其相關SNP標記，基于豬10.2版參考基因組，檢測待測豬的第10號染色體735574位基因型是CC/TC/TT中的哪一種。CC基因型豬是該位點為堿基C的純合子；TT基因型豬是該位點為堿基T的純合子；TC基因型豬是雜合子。在三種基因型豬中，TC基因型豬達100kg體重日齡顯著小于TT型和CC型。同時，TC基因型豬眼肌面積顯著大于TT型和CC型。

技術領域

本發明涉及生物技術領域，具體涉及一種鑒定或輔助鑒定豬生長性狀的方法及其相關SNP標記。

背景技術

豬的生產性能是評價生豬養殖效率的重要因素之一，生產性能可細分為瘦肉率、脂肪含量、肉的品質和飼料利用率等多項指標。其中瘦肉率是一類非常重要的生產指標，與之相關的活體測量指標包括背膘厚度、眼肌面積和達100kg體重日齡等。對這些性狀背后遺傳機制的研究具有非常重要的經濟價值和研究意義。

單核苷酸多態性(single nucleotide polymorphism，SNPs)是一種廣泛應用的生物學分子標記，常見于群體進化分析及全基因組關聯分析，能夠在單堿基精度上研究性狀與位點變異的關系。對于不同遺傳背景的豬，相同生長周期內影響體重的主要是自身遺傳因素，但是，目前豬遺傳育種領域多以肉質性狀、繁殖性狀和抗病性狀為主要研究對象，缺少對生長性狀關聯基因和位點的研究，本專利發現的SNP位點可以填充這方面的空白。

發明內容

本發明所要解決的技術問題在于，如何提供一種鑒別或者輔助鑒別生長性狀好的豬的方法。

本發明涉及檢測SNP標記735574的多態性或基因型的物質在如下A1-A3中的應用；所述SNP標記735574為位于10.2版豬參考基因組的第10號染色體735574位核苷酸，其為C或T：

A1，在鑒定或輔助鑒定豬達100kg體重日齡中的應用；

A2，在鑒定或輔助鑒定豬眼肌面積中的應用；

A3，在豬育種中的應用。

所述A3中的豬育種為培育豬達100kg體重日齡小和/或豬眼肌面積大的豬品種。

所述檢測SNP標記735574的多態性或基因型的物質如下B1)或B2)或B3)：

B1)用于擴增含有SNP標記735574的DNA片段的成套引物；

B2)含有A1)的PCR試劑；

B3)含有A1)或A2)的試劑盒。

所述成套引物由序列表中序列2所示的單鏈DNA分子和序列表中序列3所示的單鏈DNA分子組成。

本發明還要求保護一種產品，所述產品為檢測SNP標記735574的多態性或基因型的物質，具體為如下：下B1)或B2)或B3)：

B1)用于擴增含有SNP標記735574的DNA片段的成套引物；

B2)含有A1)的PCR試劑；

B3)含有A1)或A2)的試劑盒。

所述B1)中成套引物由序列表中序列2所示的單鏈DNA分子和序列表中序列3所示的單鏈DNA分子組成。

一種鑒定或輔助鑒定豬眼肌面積大小的方法，所述方法包括：檢測待測豬基因組中所述SNP標記735574的基因型，其中，CC基因型與TT基因型的豬的豬眼肌面積小于CT基因型的豬的豬眼肌面積，CC基因型與TT基因型的豬的豬眼肌面積差異不顯著；

所述純合CC基因型的豬為SNP標記735574位點均為C的豬；

所述雜合CT基因型的豬為SNP標記735574位點為C和T的豬；