[發明專利]豬OLR1基因中與繁殖性狀相關的復等位基因分子標記及應用

有效

• 申請號: 202010980723.8
• 申請日: 2020-09-17
• 公開（公告）號: CN112126688B
• 公開（公告）日: 2022-05-17
• 發明（設計）人: 喬木;武華玉;彭先文;梅書棋;吳俊靜;周佳偉;張宇;徐忠;孫華;劉貴生;董斌科;宋忠旭;趙海忠;李良華;李梓芃
• 申請（專利權）人: 湖北省農業科學院畜牧獸醫研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 武漢智嘉聯合知識產權代理事務所(普通合伙) 42231
• 代理人: 易賢衛

本發明公開了一種豬OLR1基因中與繁殖性狀相關的復等位基因分子標記及應用，其中所述繁殖性狀為總產仔數性狀和產活仔數性狀；所述分子標記位于豬OLR1基因第四內含子的部分DNA序列中，分子標記的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示，在該序列的第122bp處存在AC，AT，CT三種類型的堿基突變；本發明還提供了擴增該分子標記的引物對及其應用。本發明首次發掘了豬OLR1基因中與豬繁殖性狀相關的復等位基因分子標記g.61808357AC或AT或CT，為豬的總產仔數性狀和產活仔數性狀標記輔助選擇育種提供了一個新的分子育種標記，實現了對豬繁殖性狀進行早期篩選，篩選方法簡單快速。

技術領域

本發明涉及豬分子標記技術領域，具體涉及一種豬OLR1基因中與繁殖性狀相關的復等位基因分子標記及應用。

背景技術

豬的產仔數，包括總產仔數和產活仔數，是直接關系到養豬業的經濟收益的重要經濟性狀，提高豬產仔數對提高養豬業的總體經濟效益意義重大。但由于其遺傳力低(0.1左右)，導致母豬繁殖性狀常規選擇進展緩慢。隨著分子生物學技術的興起和迅速發展，發展了常規育種與標記輔助選擇(MAS)相結合的方法，可以有效地加快豬產仔數性狀的選擇進展。因此，尋找控制豬產仔數性狀的關鍵分子遺傳標記，并將其用于分子標記輔助育種，對提高豬產仔數具有重要意義。

復等位基因(multiple allelism)是指同源染色體上同一位置上的等位基因的數目在兩個以上，任何一個雜合的二倍體個體都只存在復等位基中的二個不同的等位基因。復等位基因是由基因突變形成的，它在同一位點存在兩個以上的單核苷酸多態性(SingleNucleotide Polymorphsim，SNP)，因此可以用作分子標記。復等位基因在植物中比較常見，在人中常見的為ABO血型，在家畜中十分少見。

OLR1基因(oxidized low-density lipoprotein receptor1,OLR1)具有結合、氧化低密度脂蛋白的作用。大量研究表明，它與人類的心腦血管疾病形成有關；在脂肪細胞分化和增殖過程中有一定作用；此外，OLR1基因與脂肪沉積、牛的乳脂率、牛肉品質等性狀相關。而有關OLR1基因對繁殖性能的影響還未見報道。

發明內容

本發明的目的在于克服現有技術的缺陷，提供了一種豬OLR1基因中與繁殖性狀相關的復等位基因分子標記及應用，本發明發掘了OLR1基因第四內含子中與豬總產仔數和產活仔數性狀關聯的復等位基因分子標記，為豬繁殖性狀的分子標記輔助育種提供了一種新的分子標記。

本發明的目的之一在于提供一種與豬繁殖性狀相關的復等位基因分子標記，所述分子標記位于豬OLR1基因的部分DNA序列中，所述分子標記的核苷酸序列如序列表SEQ IDNO.1所示，在該序列的第122bp處存在AC，AT，CT三種類型的堿基突變。

進一步的，所述序列中第122bp處的A或C或T的堿基多態性位點，表現為AA、AC、CC、AT或TC五種基因型，其中A等位基因為優勢等位基因。

本發明的目的之二在于提供一種上述復等位基因分子標記在豬總產仔數性狀和產活仔數性狀標記輔助選擇中的應用。

本發明的目的之三在于提供一種用于擴增所述復等位基因分子標記的引物對，包括：上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。

本發明的目的之四在于提供一種上述引物對在豬總產仔數性狀和產活仔數性狀標記輔助選擇中的應用。

本發明的目的之五在于提供一種豬的選育方法，包括：

S1、提取豬的基因組DNA；

S2、以步驟S1得到的基因組DNA作為模板，采用上述引物對進行PCR擴增，得到復等位基因分子標記并純化；