[發(fā)明專利]一種鑒定或輔助鑒定豬眼肌面積的方法及其應(yīng)用

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202010940659.0
• 申請(qǐng)日: 2020-09-09
• 公開（公告）號(hào): CN114231639A
• 公開（公告）日: 2022-03-25
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 唐中林;陳慕雅;易國強(qiáng);王斌虎
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)基因組研究所
• 主分類號(hào): C12Q1/6888
• 分類號(hào): C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 北京紀(jì)凱知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11245
• 代理人: 王灝增

本發(fā)明涉及一種鑒定或輔助鑒定豬眼肌面積的方法及其應(yīng)用，供了與豬眼肌面積相關(guān)的SNP標(biāo)記及其應(yīng)用，基于豬10.2版參考基因組，檢測(cè)待測(cè)豬的4號(hào)染色體正義鏈第122,930,793位核苷酸的基因型是CC/CA/AA中的哪一種。CC基因型豬是該位點(diǎn)為堿基C的純合子；AA基因型豬是該位點(diǎn)為堿基A的純合子；CA基因型豬是該位點(diǎn)為堿基CA的雜合子。在三種基因型豬中，CC基因型豬眼肌面積顯著大于CA型和AA型。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種鑒定或輔助鑒定豬眼肌面積的方法及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

眼肌面積是豬背部最長(zhǎng)肌肉的橫截面積，是現(xiàn)代豬遺傳育種工作中衡量豬瘦肉率的重要指標(biāo)。在生豬生產(chǎn)過程中，瘦肉率是一類非常重要的經(jīng)濟(jì)性狀，該性狀與豬眼肌面積的大小呈顯著正相關(guān)，且直接影響豬肉在市場(chǎng)上的銷售和價(jià)格。因此提高家豬瘦肉率和眼肌面積是豬遺傳育種的重要工作內(nèi)容。瘦肉率和眼肌面積均屬于中高等遺傳力的復(fù)雜性狀。該類性狀一般需要屠宰后進(jìn)行測(cè)量，費(fèi)時(shí)費(fèi)力，且利用傳統(tǒng)育種方法的改良速度較慢，準(zhǔn)確度也比較低。更為重要的是，優(yōu)秀種豬屠宰后無法繼續(xù)利用，因而造成了嚴(yán)重的損失。隨著測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展，豬基因組測(cè)序圖譜、SNPs(單核苷酸多態(tài)性)標(biāo)記圖譜逐步完善，為豬基因組選擇研究提供了大量可以參考的遺傳標(biāo)記。利用SNP芯片分型技術(shù)進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析可以快速有效地挖掘出與豬眼肌面積大小相關(guān)的SNP位點(diǎn)，通過待測(cè)豬基因型的檢測(cè)可對(duì)豬眼肌面積進(jìn)行早期預(yù)測(cè)，節(jié)省生產(chǎn)成本并加速豬遺傳育種改良工作。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的是提供一種鑒定或輔助鑒定豬眼肌面積的方法及其應(yīng)用。

本發(fā)明提供一種產(chǎn)品，所述產(chǎn)品為用于檢測(cè)待測(cè)豬基因組中所述SNP標(biāo)記M1GA0006480的多態(tài)性或基因型的的物質(zhì)，所述SNP標(biāo)記M1GA0006480為豬參考基因組Sscrofa10.2中4號(hào)染色體正義鏈第122,930,793位核苷酸，其為C或A。

其中，所述檢測(cè)SNP標(biāo)記M1GA0006480的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)如下A1)或A2)或A3)或A4)：

A1)用于擴(kuò)增含有SNP標(biāo)記M1GA0006480的DNA片段的成套引物；

A2)含有A1)的PCR試劑；

A3)含有A1)或A2)的試劑盒；

A4)用于檢測(cè)SNP標(biāo)記M1GA0006480的多態(tài)性或基因型的SNP芯片。

所述的產(chǎn)品在鑒定或輔助鑒定豬眼肌面積中的應(yīng)用也應(yīng)在本發(fā)明的保護(hù)范圍之中。

所述的產(chǎn)品在豬育種中的應(yīng)用也應(yīng)在本發(fā)明的保護(hù)范圍之中。

本發(fā)明提供一種鑒定或輔助鑒定豬眼肌面積大小的方法，所述方法包括：檢測(cè)待測(cè)豬基因組中SNP標(biāo)記M1GA0006480的基因型，CA基因型與AA基因型的豬的豬眼肌面積小于CC基因型的豬的豬眼肌面積，AA基因型的豬的豬眼肌面積小于CA基因型的豬的豬眼肌面積；

其中，所述SNP標(biāo)記M1GA0006480為豬參考基因組Sscrofa10.2中4號(hào)染色體正義鏈第122,930,793位核苷酸，其為C或A；

所述CC基因型為SNP標(biāo)記M1GA0006480為C的純合型；

所述CA基因型為SNP標(biāo)記M1GA0006480為C和A的雜合型；

所述AA基因型為SNP標(biāo)記M1GA0006480為A的純合型。

所述的方法在鑒定或輔助鑒定豬眼肌面積中的應(yīng)用也應(yīng)在本發(fā)明的保護(hù)范圍之中。

所述的方法在豬育種中的應(yīng)用也應(yīng)在本發(fā)明的保護(hù)范圍之中。