[發明專利]一種與豬背膘厚相關的SNP標記及其應用

有效

• 申請號: 202010930129.8
• 申請日: 2020-09-07
• 公開（公告）號: CN114150068B
• 公開（公告）日: 2023-10-13
• 發明（設計）人: 唐中林;王斌虎;易國強;劉毓文
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院深圳農業基因組研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11;C12N15/10
• 代理公司: 北京康思博達知識產權代理事務所(普通合伙) 11426
• 代理人: 潘煒;范國鋒

1.一種與豬背膘厚相關的分子標記，其特征在于，所述分子標記為SNP標記，其位于國際豬基因組10.2版本參考序列2號染色體上第161,686,082bp處，存在T/G多態性。

2.根據權利要求1所述的分子標記，其特征在于，所述位于國際豬基因組10.2版本參考序列2號染色體上第161,686,082bp處的SNP標記的等位基因為G和T，其對應的基因型有三種，分別為GG基因型、TG基因型和TT基因型，

優選地，所述位于國際豬基因組10.2版本參考序列2號染色體上第161,686,082bp處的SNP標記的基因型為TT的豬的背膘厚度顯著低于基因型為TG和GG的豬。

3.一種權利要1或2所述分子標記的獲得方法，其特征在于，所述方法包括以下步驟：

步驟1，選擇豬群體，提取基因組DNA；

步驟2，測定表型性狀；

步驟3，進行基因分型；

步驟4，進行表型性狀的全基因組關聯分析。

4.根據權利要求3所述的方法，其特征在于，步驟1中，所述豬群體中的豬種選自杜洛克豬、長白豬和大白豬中的一種或多種。

5.根據權利要求3所述的方法，其特征在于，步驟3中，所述基因分型采用直接測序法、限制性片段長度多態性聚合酶鏈式反應、飛行時間質譜技術和芯片技術中的一種或多種。

6.一種預測豬背膘厚的方法，其特征在于，所述方法包括通過對待測豬進行所述SNP標記的檢測，預測待測豬的背膘厚的步驟；

優選地，所述方法包括以下步驟：

步驟I，提取待測豬的基因組DNA；

步驟II，對基因組DNA進行擴增，獲得PCR產物；

步驟III，對PCR產物進行測序，確定豬的背膘厚。

7.一種預測豬背膘厚的系統，其特征在于，所述系統包括：

擴增單元，用于對待測豬的基因組DNA進行擴增；

測序單元，其與擴增單元相連，用于對擴增得到的產物進行測序；

預測單元，其與測序單元相連，用于根據測序結果預測豬背膘厚度。

8.一種權利要求1或2所述分子標記或權利要求3至5之一所述方法獲得的SNP標記或權利要求7所述的預測豬背膘厚的系統在鑒定豬背膘厚或篩選低背膘厚豬品種方面的應用。

9.一種權利要求1或2所述分子標記或權利要求3至5之一所述方法獲得的SNP標記或權利要求7所述的預測豬背膘厚的系統在豬育種中的應用。

10.根據權利要求9所述的應用，其特征在于，所述應用包括以下步驟：

步驟i，獲取豬的基因組DNA；

步驟ii，檢測豬位于國際豬基因組10.2版本參考序列2號染色體上第161,686,082bp處的SNP標記的基因型；

步驟iii，根據基因型選擇低背膘厚的豬作為種豬，以進行育種。