[發(fā)明專利]與新型冠狀病毒肺炎重癥相關(guān)的21q22.3區(qū)域的多態(tài)性的檢測方法、試劑盒及其應(yīng)用

在審

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• 申請日: 2020-08-27
• 公開（公告）號: CN112458159A
• 公開（公告）日: 2021-03-09
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 周鋼橋;李元豐;王長軍
• 申請（專利權(quán)）人: 中國人民解放軍軍事科學院軍事醫(yī)學研究院
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12Q1/6858
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

本發(fā)明涉及與新型冠狀病毒(Coronavirus Disease 2019，COVID?19)重癥風險相關(guān)基因區(qū)域21q22.3的SNP位點rs430915的檢測方法、試劑盒及其應(yīng)用。所述方法為基因分型(包括但不限于TaqMan分型和Sequenom分型)，本發(fā)明進一步涉及檢測上述易感位點的試劑盒及其應(yīng)用。另外，本發(fā)明將21q22.3的SNP位點rs430915與COVID?19的重癥風險進行關(guān)聯(lián)，公開該SNP及其應(yīng)用。其中，該SNP位于人類基因組區(qū)域21q22.3，確定了21q22.3是COVID?19的一個新的重癥風險相關(guān)基因區(qū)域，能夠有效用于篩選COVID?19重癥風險易感群體，并具有輔助指導COVID?19重癥治療的潛在應(yīng)用價值。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及與新型冠狀病毒肺炎重癥相關(guān)的 21q22.3區(qū)域的多態(tài)性的檢測方法、試劑盒及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

新型冠狀病毒SARS-CoV-2感染人體后，可導致以發(fā)熱、咳嗽和呼吸困難為主要特征的新型冠狀病毒肺炎(Coronavirus Disease 2019，COVID-19)，嚴重威脅人民的生命健康。然而，SARS-CoV-2感染人體后，個體會發(fā)生顯著不同的病程轉(zhuǎn)歸，可表現(xiàn)為單純性感染、輕型肺炎、普通型肺炎、重型肺炎和危重型肺炎。個體感染SARS-CoV-2后發(fā)生不同臨床轉(zhuǎn)歸的原因，可能是由于個體間的性別、年齡等因素存在差異所造成。例如，有報道顯示，年老的個體、男性個體和基礎(chǔ)健康狀況較差的個體，在感染SARS-CoV-2后，更易誘發(fā)重癥肺炎。另一方面，已有研究顯示，機體的遺傳因素在病毒感染后的臨床轉(zhuǎn)歸過程中也發(fā)揮著重要的作用。例如，重癥急性呼吸綜合征(SARS)由SARS-CoV 感染引起，攜帶趨化因子配體2(CCL2)基因變異G-2518A的個體，能夠招募更多的單核細胞和巨噬細胞，進而導致這些個體對SARS-CoV更為易感。又如，乙型肝炎病毒(HBV)感染個體后，部分個體能夠自我清除病毒，部分個體將發(fā)展成為持續(xù)性感染者，其重要原因之一在于編碼HBV的受體鈉離子牛磺膽酸共轉(zhuǎn)運多肽(sodium-taurocholate co-transporting polypeptide，NTCP)的基因SLC10A1存在基因多態(tài)性rs4646287，部分個體的NTCP受體可阻止HBV侵襲和感染肝細胞。

感染性疾病易感基因的發(fā)現(xiàn)，對于疾病的臨床治療具有重要意義。例如，編碼干擾素λ3的IL28B基因，其遺傳變異rs12979860與慢性丙型肝炎(HCV) 的發(fā)生顯著相關(guān)。采用聚乙二醇干擾素α聯(lián)用利巴韋林治療方案，攜帶IL28B基因易感位點的個體，其HCV病毒(尤其是G1型病毒)的清除率顯著高于不攜帶易感位點的個體。因此，發(fā)現(xiàn)COVID-19重癥相關(guān)的易感基因，有望為 COVID-19的發(fā)生、病程的進展、治療效果以及預后提供理論基礎(chǔ)和研究線索。

全基因組關(guān)聯(lián)研究(genome-wide association study，GWAS)被證明可以無偏、有效的發(fā)掘疾病或表型相關(guān)的SNP。至今，已有超過2000篇全基因組關(guān)聯(lián)研究被報道。GWAS發(fā)現(xiàn)的疾病易感基因，已被后續(xù)的機制研究證明在疾病的發(fā)生、發(fā)展過程中發(fā)揮重要的作用，為疾病防診治措施的研發(fā)奠定了堅實的基礎(chǔ)。近期，一項針對意大利和西班牙人的GWAS成功鑒定出2個SNP與 COVID-19重癥伴呼吸衰竭顯著相關(guān)，分別是：位于3p21.31的rs11385942和 9q34.2的rs657152。這兩個SNP的頻率分布在不同人群中差異較大，尤其是rs11385942，其在中國人群中不存在遺傳多態(tài)性。

目前，尚無中國人群COVID-19重癥遺傳易感性的研究報道。基于SNP的 COVID-19重癥預測技術(shù)仍有待開發(fā)。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明是基于發(fā)明人對以下事實和問題的發(fā)現(xiàn)和認識作出的：