[發明專利]熒光定量的指標確定方法在審
| 申請號: | 202010867137.2 | 申請日: | 2020-08-25 |
| 公開(公告)號: | CN111944883A | 公開(公告)日: | 2020-11-17 |
| 發明(設計)人: | 李冬;楊智;賀賢漢 | 申請(專利權)人: | 杭州博日科技股份有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6851 | 分類號: | C12Q1/6851 |
| 代理公司: | 北京超凡宏宇專利代理事務所(特殊普通合伙) 11463 | 代理人: | 張萌 |
| 地址: | 310000 浙江省杭州*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 熒光 定量 指標 確定 方法 | ||
1.一種熒光定量的指標確定方法,其特征在于,包括:
采集第一數量個循環對應的初始熒光定量PCR擴增數據;
對所述第一數量中前第二數量個循環對應的初始PCR擴增數據進行線性擬合,確定擴增曲線基線;
對所述初始PCR擴增數據去基線,得到目標PCR擴增數據;
基于所述第一數量中除前第二數量以外的后第三數量個循環對應的目標PCR擴增數據確定PCR的指標。
2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,基于所述第一數量中除前第二數量以外的后第三數量個循環對應的目標PCR擴增數據確定PCR的指標的步驟包括:
針對所述第三數量個循環對應的目標PCR擴增數據,基于自適用多項式擬合方式確定目標指數區域;
根據所述目標指數區域確定所述PCR的指標。
3.根據權利要求2所述的方法,其特征在于,針對所述第三數量個循環對應的目標PCR擴增數據,基于自適用多項式擬合方式確定目標指數區域的步驟包括:
確定所述第三數量個循環對應的目標PCR擴增數據中熒光強度連續遞增的第四數量個循環;
針對所述第四數量個循環對應的目標PCR擴增數據取對數;
運用自適用多項式擬合方式,找到目標窗口對應的目標指數區域。
4.根據權利要求3所述的方法,其特征在于,所述自適用多項式擬合方式包括自適用Savitzky-Golay線性擬合方式。
5.根據權利要求4所述的方法,其特征在于,運用自適用多項式擬合方式,找到目標窗口對應的目標指數區域的步驟,包括:
根據Savitzky-Golay擬合原理及循環總數,確定窗口大小選擇范圍;
在選擇范圍中依次確定當前窗口大小,針對每個所述當前窗口大小,在所述當前窗口大小對應的每一個滑動平移位置,計算決定系數;以及取所述當前窗口大小中最大的決定系數其對應初始窗口為所述當前窗口大小對應的最優指數區域;
在所述初始窗口中選擇最優的目標指數區域。
6.根據權利要求2所述的方法,其特征在于,所述PCR的指標包括Ct值、初始拷貝數目以及擴增效率;根據所述目標指數區域確定所述PCR的指標的步驟包括:
根據所述目標指數區域確定Ct值;
根據所述目標指數區域確定初始拷貝數目;
根據所述目標指數區域確定擴增效率。
7.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述第一數量個循環為所有循環。
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