[發明專利]生物組織染色方法、裝置、計算機設備和存儲介質在審
| 申請號: | 202010844585.0 | 申請日: | 2020-08-20 |
| 公開(公告)號: | CN111982638A | 公開(公告)日: | 2020-11-24 |
| 發明(設計)人: | 李小衛;曹煙東 | 申請(專利權)人: | 上海詒??萍加邢薰?/a> |
| 主分類號: | G01N1/30 | 分類號: | G01N1/30;G01N1/31 |
| 代理公司: | 北京清大紫荊知識產權代理有限公司 11718 | 代理人: | 黃貞君;馮振華 |
| 地址: | 201109 上海市*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 生物 組織 染色 方法 裝置 計算機 設備 存儲 介質 | ||
本發明提供了一種生物組織染色方法、裝置、計算機設備和存儲介質,屬于組織生物學領域,具體包括:獲取待染色的生物組織的組織類型和尺寸參數;根據所述組織類型獲取對應的染色模型;將所述尺寸參數輸入所述染色模型,輸出對所述生物組織標記的標記參數,所述標記參數至少包括標記電流和標記時間,所述染色模型根據進入到所述生物組織的抗體總量計算標記電流和標記時間;根據所述標記參數控制標記裝置對所述生物組織進行染色。通過本公開的處理方案,避免阻塞效應,提高厚組織免疫染色的均一性和質量。
技術領域
本發明涉及組織生物學領域,具體涉及一種生物組織染色方法、裝置、計算機設備和存儲介質。
背景技術
為了實現對生物組織的快速免疫標記,一般基于外加電場驅動加速抗體分子進入組織。但是,由于抗體大分子在自由溶液和致密組織中的電遷移率大小有量級上的差別,抗體分子在電場驅動下,會大量的聚集到組織與溶液的交界面上,形成一種“阻塞效應”,即抗體大分子將組織中的空隙全部填充,使得溶液中的抗體分子無法進入組織,最終組織在邊界部分被大量的標記,而內部幾乎沒有被標記。阻塞效應與電流密度的大小直接相關,而電流密度與電流大小、樣本的尺寸和類型等密切相關。因此,為了避免阻塞效應,提高厚組織免疫染色的均一性和質量,迫切需要有一種能根據不同樣本,不同抗體分子的選擇最佳標記參數的快速免疫標記方法。
發明內容
因此,為了克服上述現有技術的缺點,本發明提供了一種避免阻塞效應,提高厚組織免疫染色的均一性和質量的生物組織染色方法、裝置、計算機設備和存儲介質。
為了實現上述目的,本發明提供一種生物組織染色方法,包括:獲取待染色的生物組織的組織類型和尺寸參數;根據所述組織類型獲取對應的染色模型;將所述尺寸參數輸入所述染色模型,輸出對所述生物組織標記的標記參數,所述標記參數至少包括標記電流和標記時間,所述染色模型根據進入到所述生物組織的抗體總量計算最佳的標記電流和標記時間;根據所述標記參數控制標記裝置對所述生物組織進行染色。
在其中一個實施例中,所述染色模型的構建方法,包括:獲取樣本標記參數和采用所述樣本標記參數標記的樣本組織的樣本組織類型、樣本尺寸參數和樣本標記結果,所述樣本標記參數包括樣本標記抗體、樣本標記時間和樣本標記電流;根據所述樣本標記參數、所述樣本尺寸參數和所述樣本標記結果得到固定時間下,抗體分子進入所述樣本組織的抗體總量與電流值的映射關系;根據所述映射關系計算得到與所述樣本組織類型對應的抗體的等效遷移率,所述等效遷移率是抗體進入所述樣本組織的深度與所述樣本標記時間的比值;根據所述等效遷移率和所述映射關系構建染色模型。
在其中一個實施例中,所述等效遷移率根據公式v=f(c,I,ρ,S,h)計算得到,其中,v為等效遷移率,c為樣本標記抗體的濃度,I為樣本標記電流值,ρ為組織密度,S為樣本組織的截面積,h為抗體進入所述樣本組織的深度。
在其中一個實施例中,將所述尺寸參數輸入所述染色模型,輸出對所述生物組織標記的標記參數之后,包括:獲取用于對所述待染色的生物組織進行染色的抗體溶液的液體溫度和當前環境溫度,根據所述液體溫度、當前環境溫度和所述標記參數中的所述標記電流計算實際電流輸出值。
在其中一個實施例中,所述樣本標記電流攜帶有電流方向。
本發明還提供了一種生物組織染色裝置,所述裝置包括:參數獲取模塊,用于獲取待染色的生物組織的組織類型和尺寸參數;模型獲取模塊,用于根據所述組織類型獲取對應的染色模型;標記參數輸出模塊,用于將所述尺寸參數輸入所述染色模型,輸出對所述生物組織標記的標記參數,所述標記參數至少包括標記電流和標記時間,所述染色模型根據進入到所述生物組織的抗體總量計算標記電流和標記時間;組織染色模塊,用于根據所述標記參數控制標記裝置對所述生物組織進行染色。
本發明還提供了一種計算機設備,包括存儲器和處理器,所述存儲器存儲有計算機程序,其特征在于,所述處理器執行所述計算機程序時實現上述方法的步驟。
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