[發明專利]一種定量DNA甲基化程度的電化學方法及系統有效
| 申請號: | 202010838165.1 | 申請日: | 2020-08-19 |
| 公開(公告)號: | CN112098489B | 公開(公告)日: | 2022-11-15 |
| 發明(設計)人: | 孫經緯 | 申請(專利權)人: | 孫經緯 |
| 主分類號: | G01N27/327 | 分類號: | G01N27/327;C12Q1/6886 |
| 代理公司: | 廣州嘉權專利商標事務所有限公司 44205 | 代理人: | 胡輝 |
| 地址: | 廣東省廣*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 定量 dna 甲基化 程度 電化學 方法 系統 | ||
1.一種DNA甲基化的電化學檢測方法,包括:
S1)獲取待測DNA樣本;
S2)將待測DNA樣本溶解于水性緩沖液中,得到DNA溶液;所述水性緩沖液為pH=8.0的TE緩沖液;
S3)將電化學工作站的工作電極、參比電極和對電極浸沒于電解液中,確定吸附前的DPV電流峰值作為基線電流A0,所述電解液為添加有水溶性鐵氰化鹽和水溶性亞鐵氰化鹽的緩沖液;所述緩沖液為PBS緩沖液;
S4)將工作電極浸入所述DNA溶液中并充分吸附,測試吸附后的DPV電流峰值,記為樣本電流A1;
S5)根據基線電流A0和樣本電流A1,計算DNA甲基化程度;
其中,檢測過程中維持恒溫至15~25℃,所述工作電極為金電極;
所述金電極在使用前經過鋁粉進行打磨;
電化學工作站DPV模式的檢測參數為:t equilibration=0s、E begin=-0.1V、E end=0.5V、E step=0.005V、E pulse=0.05V、t pulse=0.05s、Scan rate=0.05V/s、Current range=1uA–1mA;
DNA電流吸附率的計算公式為:
當計算得到的DNA電流吸附率低于10%時,對樣本進行復核。
2.根據權利要求1所述的電 化學檢測方法,其特征在于:檢測過程中的溫度維持在20℃。
3.根據權利要求1所述的電 化學檢測方法,其特征在于:水溶性鐵氰化鹽選自[K3Fe(CN)6]、[Na3Fe(CN)6];水溶性亞鐵氰化鹽選自[K4Fe(CN)6]或[Na4Fe(CN)6]。
4.根據權利要求1~3任一項所述的電 化學檢測方法,其特征在于:水溶性鐵氰化鹽和水溶性亞鐵氰化鹽的摩爾比為(0.95~1.05):1。
5.根據權利要求4所述的電 化學檢測方法,其特征在于:水溶性鐵氰化鹽和水溶性亞鐵氰化鹽的摩爾比為1:1。
6.根據權利要求1~3任一項所述的電 化學檢測方法,其特征在于:使用磁珠吸附法提取獲得待測DNA樣本。
7.根據權利要求1~3任一項所述的電 化學檢測方法,其特征在于:所述待測DNA樣本包括血漿cfDNA樣本、組織DNA樣本。
8.一種腫瘤篩查系統,包括:
樣本DNA甲基化程度檢測裝置:采用 權利要求1~7任一項所述的方法,確定樣本DNA甲基化程度;
結果判斷裝置:基于樣本DNA甲基化程度,篩查惡性腫瘤。
9.根據權利要求8所述的腫瘤篩查系統,其特征在于:所述腫瘤選自肺癌、前列腺癌、乳腺癌、頭頸部鱗癌、食管癌、淋巴瘤、胃癌、白血病、胰腺癌、肝癌、腸癌、卵巢癌、子宮內膜癌、膽囊癌、宮頸癌。
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