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[發明專利]一種氨解液及氨解方法有效

專利信息
申請號: 202010828506.7 申請日: 2020-08-18
公開(公告)號: CN111704644B 公開(公告)日: 2020-12-04
發明(設計)人: 曹春艷;趙雙;靳開寶;紀磊;韓承昊;朱知浩 申請(專利權)人: 蘇州金唯智生物科技有限公司
主分類號: C07H21/04 分類號: C07H21/04
代理公司: 北京品源專利代理有限公司 11332 代理人: 鞏克棟
地址: 215000 江蘇省蘇州市*** 國省代碼: 江蘇;32
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 一種 氨解 方法
【說明書】:

發明提供了一種氨解液及氨解方法,所述氨解液包括胺、丁醇、氨基醇和堿性水溶液,所述氨解方法包括:(1)向裝有固相載體的固相合成柱中加入氨解液;(2)將所述固相合成柱置于裝有氨解緩沖液的密封容器內,并保持所述固相合成柱不接觸氨解緩沖液;(3)加熱所述密封容器,使固相載體處于氨解緩沖液的蒸汽氣氛中,隨后冷卻;(4)從所述密封容器中取出固相合成柱,用洗脫液處理固相合成柱中的固相載體,并收集流出液。本發明的氨解液配方溫和,氨解緩沖液不僅提供氨解氛圍,而且輔助氨解反應,氨解工藝不使用有毒氣體、安全性高、環境友好、不破壞引物結構,同時后處理步驟簡單,避免交叉污染,可以實現大規模工業化應用。

技術領域

本發明屬于核酸的合成技術領域,涉及一種氨解液及氨解方法。

背景技術

短鏈DNA又稱為寡核苷酸(Oligo),通常采用固相合成技術進行人工合成。固相合成以控制孔徑玻璃球(CPG)為固相載體,以亞磷酰胺為單體,按照3’-5’方向,經過脫保護、縮合、氧化和蓋帽四個反應的循環,將目標序列逐漸連接在固相載體上。固相合成方法的優勢在于:每一步反應都在固相載體上進行,反應結束后可以將未反應的原料通過抽濾的方式除去,后處理步驟簡單。因此,固相合成被廣泛應用于Oligo和多肽合成。在現在大部分的Oligo合成工藝中,亞磷酰胺單體的5’-OH被二甲氧基三苯基(DMT)基團保護,可以在2~3%CCl3COOH/CH2Cl2溶液中被切除,稱為脫保護反應;脫保護后裸露出的自由羥基與亞磷酰胺發生親核取代反應,即縮合反應;縮合反應結束后,為避免未反應的羥基進入下一輪縮合,需要將未反應的自由羥基乙酰化,俗稱“蓋帽”;最后,由于亞磷酰胺非常不穩定,需要用氧化劑如碘液將亞磷酰胺氧化為+5價磷。每連接一個堿基都需要經歷四個反應,將目標堿基全部合成后,將Oligo從CPG上剪切下來。同時,由于A、C、G堿基含有活性氨基,會干擾縮合反應,所以一般預先采用乙酰基(Ac)、苯甲酰基(Bz)和二氮甲基甲脒基(dmf)將氨基保護,當反應結束后,再將Ac、Bz和dmf基團切除。在這里,將Oligo從CPG上剪切下來和脫除保護基的反應稱為氨解反應。氨解反應的主要包括:(1)將Oligo從固相載體上切割下來;(2)將Oligo的3’-OH暴露;(3)將A、C、G堿基上的保護基Ac、Bz、dmf切除;(4)將磷酸上的氰乙基切除。

氨解反應最初采用氨水進行,其問題主要包括反應時間長,55℃反應需要16小時,65℃反應需要8小時;在反應過程中需要將合成柱浸泡在氨水中,容易造成交叉污染;由于氨水可以溶解Oligo,后處理步驟繁瑣;氨水中的雜質會積累,造成Oligo污染。后來研發的甲胺:氨水=1:1(AMA)的氨解反應體系大大降低了反應時間(M.P. Reddy, N.B. Hanna,and F. Farooqui, Nucleos. Nucleot., 1997, 16, 1589-1598.),但是仍然存在交叉污染和后處理步驟繁瑣等問題。氣相氨解采用氨氣為活性介質,以耐高壓的氨解鍋為反應容器,在高溫高壓的反應條件下進行氨解反應。氣相氨解的優勢在于反應快速高效、操作簡單,但是存在對設備要求高、需要使用有毒氣體、存在安全隱患、污染環境、對引物的結構破壞性較大的缺點。微波氨解是近年來廣泛應用的工藝,主要以微波作為加熱手段,但是在實際操作過程中,微波加熱很容易造成受熱不均勻,持續加熱會引起液體爆沸,造成損失和引起交叉污染。

CN109956987A公開了一種用于在DNA固相合成后進行氨解的方法,包括以下步驟:1)向包括用于合成DNA片段的固相載體的合成柱內加入氨解組合物;2)將所述合成柱置于裝有氨解緩沖液的可密封容器內,并保持所述合成柱位于所述氨解緩沖液的液面上方;以及3)以微波處理所述可密封容器,使得所述固相載體處于所述氨解緩沖液的蒸汽氣氛中;4)取出所述合成柱,以洗脫液處理所述固相載體并收集流出液。但是該方法仍然存在微波加熱受熱不均勻、容易造成損傷或引起交叉污染的問題。

因此,需要研發一種新的氨解方法,反應條件溫和,不會破壞引物結構,解決現有技術存在的問題。

發明內容

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