[發(fā)明專利]一種熒光微球的自動(dòng)分群方法

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• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202010815762.2
• 申請(qǐng)日: 2020-08-14
• 公開（公告）號(hào): CN112131937A
• 公開（公告）日: 2020-12-25
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 王巨鋒;項(xiàng)堅(jiān)真;劉偉;史利利;洪明;何國(guó)清;劉翔;周旭一
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 中翰盛泰生物技術(shù)股份有限公司
• 主分類號(hào): G06K9/00
• 分類號(hào): G06K9/00;G06K9/20
• 代理公司: 浙江杭州金通專利事務(wù)所有限公司 33100
• 代理人: 劉曉春

本發(fā)明公開了一種熒光微球的自動(dòng)分群方法，通過將坐標(biāo)系最終劃分為單元格的形式來作為統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)點(diǎn)的最小單位，之后將8個(gè)相鄰的單元格來判斷是否已經(jīng)到一個(gè)簇群的邊界，再通過設(shè)定閾值來篩選刪除一些異常的數(shù)據(jù)點(diǎn)，保證每個(gè)簇群都會(huì)有一個(gè)邊界，最后通過數(shù)組的方式來對(duì)數(shù)據(jù)點(diǎn)進(jìn)行轉(zhuǎn)換，實(shí)現(xiàn)自動(dòng)分群。本發(fā)明極大的減少了通用直接用單個(gè)微球的數(shù)據(jù)做為最小元素來統(tǒng)計(jì)，使得計(jì)算極大的簡(jiǎn)化，由于最終簇群數(shù)組中的元素是包含了很多相鄰的單元格，在最后的時(shí)候通過對(duì)簇型數(shù)組在坐標(biāo)上的圖表化，可以直接得到分群信息，十分直觀。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及圖像檢測(cè)領(lǐng)域，尤其涉及一種熒光微球的自動(dòng)分群方法。

背景技術(shù)

現(xiàn)有技術(shù)中，流式細(xì)胞儀是基于激光或阻抗的生物物理技術(shù)，并用于細(xì)胞計(jì)數(shù)、細(xì)胞分類、生物標(biāo)志物檢測(cè)和蛋白質(zhì)工程。流式細(xì)胞儀可以同時(shí)對(duì)多達(dá)每秒數(shù)千個(gè)粒子(細(xì)胞)的物理和化學(xué)特性進(jìn)行多參數(shù)分析。背景技術(shù)：US20190163956A1-其方法包括(i)從顯微鏡獲得圖像，(i i)然后手動(dòng)定位亞細(xì)胞成分，和(iii)估計(jì)該細(xì)胞成分和亞成分的空間位置坐標(biāo)，以便將它們大致映射回一個(gè)明場(chǎng)圖像。該方法是用來識(shí)別和分類細(xì)胞，而非微球。所以在針對(duì)自帶熒光，并且需要被激發(fā)的無機(jī)的流式熒光微球來說，并不能起到很好的分群效果。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的是針對(duì)現(xiàn)有技術(shù)的缺陷，提供了一種熒光微球的自動(dòng)分群方法，能識(shí)別和分類微球被激發(fā)出兩類不同熒光。

為了實(shí)現(xiàn)以上目的，本發(fā)明采用以下技術(shù)方案：

一種熒光微球的自動(dòng)分群方法，包括以下步驟：

步驟一、通過探測(cè)器對(duì)不同微球的熒光強(qiáng)度進(jìn)行采集，將這些數(shù)據(jù)呈現(xiàn)在坐標(biāo)系中；

步驟二、將整個(gè)坐標(biāo)系劃分成網(wǎng)格，然后網(wǎng)格劃分為單元格，并計(jì)算出每個(gè)單元格的中心點(diǎn)坐標(biāo)暫存；

步驟三、將不同種類的微球所激發(fā)出來的光種類和強(qiáng)度進(jìn)行轉(zhuǎn)換成數(shù)據(jù)點(diǎn)，映射到單元格，以單元格中心點(diǎn)作為其新坐標(biāo)，并且記錄每個(gè)單元格內(nèi)包含的密度數(shù)據(jù)的總數(shù)量，得到一個(gè)密度分布數(shù)組；

步驟四、過濾單元格內(nèi)密度數(shù)據(jù)量較少的單元格，得到一個(gè)新的數(shù)組；

步驟五、查找步驟四中數(shù)組的最大密度和最小密度，設(shè)定密度系數(shù)數(shù)組；

步驟六、從高到低遍歷密度系數(shù)數(shù)組；按照該單元格相鄰的單元格查找，判斷相鄰的單元格中是否存在數(shù)據(jù)點(diǎn)；

步驟七、若相鄰單元格被查找判斷了，則跳過查找該單元格的相鄰單元格，直至所有的元素被查找判斷完畢，得到一個(gè)完整的簇群數(shù)組C，簇群數(shù)組的元素個(gè)數(shù)即為熒光微球的群落數(shù)。

進(jìn)一步的，步驟四中，設(shè)定一個(gè)過濾的閾值，過濾單元格內(nèi)密度數(shù)據(jù)量較少的單元格，得到一個(gè)新的數(shù)組。

進(jìn)一步的，步驟五中依據(jù)每個(gè)單元格內(nèi)的密度，計(jì)算一個(gè)密度系數(shù)，即最大密度-最小密度，系數(shù)越大表示密度越高，按照從高到低預(yù)先設(shè)定好一個(gè)密度系數(shù)數(shù)組。

進(jìn)一步的，步驟六中按照該單元格相鄰的8個(gè)單元格查找，判斷相鄰的單元格中是否存在數(shù)據(jù)點(diǎn)。

進(jìn)一步的，步驟七中若相鄰單元格存在數(shù)據(jù)點(diǎn)，則認(rèn)為該單元格和密度系數(shù)數(shù)組中元素所代表的單元格是聯(lián)通的，將以上單元格歸為一簇；若相鄰單元格中無數(shù)據(jù)，則認(rèn)為當(dāng)前單元格為簇群的邊緣，則不再對(duì)空數(shù)據(jù)單元格進(jìn)行下一步的相鄰判斷。

進(jìn)一步的，步驟七中將簇群數(shù)組的所有元素，即單元格，反應(yīng)到最開始的坐標(biāo)中即可得到熒光微球的群落分布圖。